第一节：文献精读介绍培养文献阅读理解的能力非常重要。
建立起锻炼科研思路-文献阅读-科研思路的学习模式。
掌握文献综述的学习与撰写。
文献阅读的意义：专业知识、科研知识、科学思维、学术视野。
告诉我们大家都在研究什么，告诉我们还能做什么，告诉我们怎么做。
文献阅读遇到的三个问题：1、坐不住：过量阅读疲劳阅读；2、记不住：盲目阅读、无中心阅读；3、想不开：缺乏科研思维。
文献阅读的层次：泛读：标题、摘要、前言、结论，判断文献是否与研究课题相关。
精读：与研究课题相关的文献要精读，精读时要思考以下几点：论文解决了什么问题、研究现状是什么、现实意义有哪些、解决问题时采用了什么方法，本研究有什么不足等。
阅读总结：自己学到了什么。
发现问题、论证问题、提出新问题的循环过程。
文献精读的意义：在泛读的基础上提炼出来的领域针对性强、内容可信度高、参考价值高的一系列文献，深入理解此类文献的研究思路、方法和结果，以获得有效的信息训练、拓展自身的科研思维，指导课题的设计及文章书写。
广义的精读：*精准高效的检索*精确的阅读 *精髓的领悟文献精读的基础：具有一定的英文基础，具有一定的文献检索能力，具有一定的科研思维能力，具有一定的文献阅读方法。
这个过程即是锻炼。
第二节：英文文献检索主要是Pubmed的用法例如检索gastric cancer就出现"stomach neoplasms"[MeSH Terms] OR ("stomach"[All Fields] AND "neoplasms"[All Fields]) OR "stomach neoplasms"[All Fields] OR ("gastric"[All Fields] AND "cancer"[All Fields]) OR "gastric cancer"[All Fields]第三节：获取文献效率及文献鉴别快速获取文献信息→文献质量筛选→目标化阅读→什么样的文章值得我们精读？1、高影响因子知名杂志2领域内核心杂志3高引用次数文献4科研思路相关的纵向及横向性文章5综述性文献。
∙专题性强，涉及范围较小∙具有一定的深度和时间性∙能反映出相关专题的历史背景、研究现状和发展趋势精读综述可以在短时间内获取大量情报。
1、充分了解研究对象的现状-避免重复劳动、走回头路。
2、指导科研方向。
综述阅读要素：1、时间三年以内；2影响因子越高越好；3、不能低于3篇。
一定要注意作者取材以及观念的局限性以及偏倚，研究成果的滞后性。
与科研思路相关的文献∙时间纵向：5年以内相关文献∙内容横向：与所研究内容直接或者间接相关、支持或反对的文献。
第四节：文献的分类管理∙下载后分类、标记（事半功倍）∙分类：按照类型、按时间、按内容、按关键词∙标记：精读前：Title or running title、杂志名、时间精读后：加附必要关键词及权重（*）例如用“PNAS2019-标题”来命名PDF文件。
精读后加*使用Endnote软件还可以备注 Research Note 笔记文献精读三步走∙阅读：要素化阅读/需求性阅读精读≠全读∙记录：历史、重要数据、关键功能、关键机制、优美句式、多义用词等等∙书写：综述、文献解析整体性阅读与要素化阅读•整体性阅读（高水平阅读）•基本点:一、辨清概念,明确方向;二、阐明意图,弄清思路三、结合语境,解惑化难四、知晓背景,加深理解要素化阅读/需求性阅读（新手）• 知识面的扩充：综述性文章、论著的abstract• 实验技术学习：论著的methods、results和figures• 学术背景学习：综述性文章、论著的introduction• 科学思维辩证学习：论著的discussion• 文章句式书写：随读随记• 以上均为针对性强化阅读，非抛弃性阅读文献精读的唯一目标：学习！• 这篇文献所做工作的领域？• 这篇文献的科学问题？转化医学意义？你是否感兴趣？• 这篇文献具体的研究目标是什么？• 这篇文献中主要研究方法是什么？这个方法和技术细节是否我是否弄明白了？如何借鉴？• 研究的主要结果？图表是否明晰？• 结论是什么，是否回答了前言中的科学问题和研究目标？如果没有，存在什么疑问？• 这篇文献的启发性及创新性？综述的精读•从读中文综述到读英文综述•从读综述到写综述•领会自己和他人实验工作的思路、线索和意义，督促自己看更多的文献•培养、锻炼自己的文献阅读能力、归纳能力、思考能力和写作能力综述的基本框架•题目、摘要、关键词：研究的主题•引文/前言：研究的原因、背景•正文：排列式、对比式、阶梯式的分段描述，锦上添花的图表•小结：总结及展望综述的摘要特点•简明扼要的介绍•启发式、引导式语言为主综述的阅读要点•阅读题目、摘要、关键词•浏览正文分段标题•阅读正文分段内容，标注关键内容•浏览小结英文摘要则不宜超过300 个实词，并且不要分段。
摘要的框架• 背景+ 重要性（原因）+必要性（目的）摘要常见句式• 归纳了…研究中的关键问题• 指出了…及其…研究的主要进展• 讨论了…的类型、影响因素、过程机理和描述方法• 在此基础上，对…规律的研究前景进行了展望引文常用句式• …是…的重要研究内容• 过去研究主要集中在…• ……是……的关键问题，研究……意义重大• …… 密切相关• （有争论的问题） …但分子机制/功能仍不十分清楚• 鉴于…的工作将对今后…研究意义以及…的现实应用意义• 作者就…的关键问题进行了系统的分析和综述正文•正文是综述文章的核心内容。
• 作者在此列举论据和论证。
通过提出问题、分析问题和解决问题，比较各种观点的异同点及其理论根据，从而反映作者的见解•作者习惯、主题内容决定了正文的模式•排列式正文：内容无主次之分•对比式正文：内容相反，辨证式论述•阶梯式正文：层层引出，环环相扣（常用于临床综述）常见模式：背景、症状、诊断、治疗正文的撰写• 根据具体情况分列若干小标题进行撰写，在每一个小标题下，扼要地介绍各种研究成果，指出不同研究组间的相互矛盾或相互支持的方面，指出共同的结论，讨论矛盾发生的原因；• 在论述每一个问题时，应写明某年某学者提出的论点或论据；除引用有关学者的论点外，可以写出综述者自己的看法（指出客观事实、避免主观臆断）；• 综述引用的资料应是比较新而又有权威性的，证据列举时应注意证据等级的权重。
综述阅读后• 注意重要数据的参考文献，标记并下载阅读• 注意作者举证文献的证据等级• 重视归纳性图表的采集• 重要内容尝试翻译注重翻译的重要性• 在语言转化的过程中加深对知识的消化、理解• 避免阅读时信息的丢失、遗漏• 英语语言的学习• 争取全文翻译加强科研思维的锻炼研究性论著的精读•第一阶段：读懂他人实验工作•第二阶段：模仿他人实验工作•第三阶段：结合他人实验工作基础创新研究性论著的基本框架• 题目、摘要、关键词（title，abstract，key words）• 引文/前言：研究的原因、背景（introduction）• 实验材料及方法（materials and methods）• 实验结果（resuts）• 讨论（discussion）根据目的合理选择阅读顺序• 一般情况下，建议先abstract、introduction，conclusion.• 然后一、先discussion，最后results 、figures和methods。
二、先results 、figures，再discussion，后methods。
多数文章看摘要，少数文章看全文引文的阅读引文是科学对话的一种方法，是作者认为对自己的研究“有用”的资料引文阅读的要点• 学习作者为提出科学问题（论述或证明该项研究的重要意义）做出的铺垫****• 引文内容与同主题综述的横向比较• 注意重要背景数据的记录、收集；• 注意归纳、总结性语句的使用、记录、收集（写作模板）讨论(Discussion)的阅读• 讨论是文献精读的重要部分，这一部分考验的是作者以及读者的逻辑辩证思维能力。
• 这一部分把实验结果提高到理论认识的部分，作者在讨论中着重阐述整篇论文中有创造性的内容和独到的见解，并根据本文结果，归纳其内在联系，并将全部资料加以综合分析，然后构成几个观念或提出自己的论点。
• 讨论中的最精彩的是作者的思维创新性以及如何辩证地与他人实验结果比较→这需要逻辑思维能力的训练。
你读懂讨论了吗？•作者研究的意义是什么？•作者的结论是什么？•作者的研究思路是如何开展的？实验结果的关联是什么？•作者实验的缺陷或局限是什么？•作者实验的争议是什么？实验方法（Methods）•抓住主题后的细节分解•学习重要的实验方案、材料来源（重要）、实验条件（重要、参考价值高）、生物学信息如引物序列等（重要、参考价值高）•理清结果与图表中的特殊名词与缩写•参考学习统计学方案实验方法特别关注点•实验技术的先进性•实验方法的严谨性和认可度•实验方法的互补性•与自己课题的关联性学习先进的实验技术十分重要•拓展自己的知识面•为课题、文章提升技术层次实验的严谨性和认可度• 很多实验方法的本身存在非特异性，需要阳性对照、阴性对照去排除相关干扰因素，阅读文献时需敏锐观察到作者实验的严谨性，学以致用。
实验方法的互补性•注意文献中对同一问题采用不同实验技术验证的方法，这种互补性体现的是实验严谨度，值得我们学习。
•最为典型的就是体内实验与体外实验的互补性与自己课题的关联性• 详细记录与自己课题密切相关的任何信息• 细胞株• 实验参数（密度、温度、培养方式、给药浓度等）• 目标蛋白的亚型、抗体• 目标基因的序列、引物设计• 信号通路的上游及下游• 等等结果与图表• 方法、结果、图表相结合阅读，减少理解的困难• 注意阅读图表注释• 一般情况下，作者会根据思路将results分成几块，并设置子标题，引导读者阅读理解• 每一个子标题就是一个新的发现或者一个结论• 注意文献的supplement data一些阅读技巧：注意特殊句式• 表达观点的，比如”which indicates/suggests/demonstrates that……”，之后的内容才是重点。
• 表达统计学差异的单词，“significant” or “non-significant”，“ statistical” ……• 总结式的单词，“In brief/In conclusion/above all……”学会抓住主题词句• 善于发现每一段的主题词句，往往在段落的第一句或最后部分，理解主题词句后可以更好的理解作者罗列的证据。