生物酶的结构和活性研究
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为了使催化基团和结合基团聚集起 来并保持它们相应的空间位置从而 赋予活性中心一定的柔性,进而具 有催化功能就必须有这样大而复杂 的分子结构来保证。
活性中心各基团的相对空间位置对酶活性具有重要的意义。
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酶活性部位的柔性是酶充分表 现其活性所必需的
1、满足底物结合诱导的构象调整(诱导契 合) ; 2、酶的活性基团在活性部位必须具有一定 的空间取向,以保持一个适应催化反应的空 间微环境; 3、残基侧链活性基团的运动更有利于催化 的高效性; 4、某些酶的活性是可调节的。
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蛋白质(酶)分子具有刚柔相间的空间结构
2、辅酶因子
有些酶属于简单蛋白质,完全由氨基酸残基 组成,如: 脲酶、溶菌酶、核糖核酸酶 有些酶除了蛋白质成分——酶蛋白外,还有 非蛋白质成分,如: 碳酸酐酶、超氧化物歧化酶、细胞色素氧化酶、 乳酸脱氢酶
非蛋白质成分的必需基团
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包含辅助因子的酶称为全酶
肽链的主链在空间的走向 多肽链通过氢键排列成沿一维方向具有 周期性结构的构象。
氢键是维持二级结构稳定的主要作用力
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三级结构
在二级结构基础上的肽链再折叠形成的构象。
稳定三级结构的主要作用力:氢键、盐键、疏水键和二硫键
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四级结构
组成蛋白质的多条肽链在天然构象空间上的排列 方式,多以弱键互相连接。疏水力、氢键、盐键 每条肽链本身具有一定的三级结构,就是蛋白质 分子的亚基。
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一般来说,构成酶的活性中心的氨基酸残基主 要是接触残基和辅助残基,结构残基虽然不在 酶活性中心范围之内,但它们却属于酶活性中 心外的必需范围,如果被其它氨基酸残基取代, 往往会造成酶的失活。
如前所述,在构成酶分子中的 氨基酸残基中只有少数的氨基 酸残基与酶的催化活性有关。 一个酶的活性中心一般是相当 小的,由几个到十几个氨基酸 残基构成,那么对于酶分子来 说如此小的活性中心为什么需 要一个大而复杂的分子结构才 能获得催化活性呢?
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2、酶催化的专一性
酶催化作用的专一性是指酶仅仅能催 化某一种或某一类物质发生化学反应, 或者说只能作用于某一种或某一类的 底物。
例如:蛋白酶只能水解蛋白质的肽链生产小 肽或氨基酸,但不能催化淀粉的水解反应, 同样,淀粉酶只能分解淀粉生成糊精或葡萄 糖,而不能作用于其它物质。
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(1)、反应专一性: 酶一般只能选择性地催化一种或一类相 同类型的化学反应,酶催化反应几乎没 有副反应。
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3、酶的调节性
酶活性的调节控制有下列几种方式: 酶浓度的调节。 激素的调节。 共价修饰调节。 抑制剂和激活剂的调节。 反馈调节。 金属离子和其他小分子化合物的调节。
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四、酶的功能
生物酶催化的优越性(与化学催化相比): 催化条件温和 催化效率高 高选择性(底物,区域,位点,立体) 低能耗 绿色过程
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1、酶的高效性
催化反应的高效性是指极少量的催化剂 就可以使大量的物质发生化学反应。酶 是自然界中催化活性最高的一类催化剂, 生命体内发生的许多化学反应在没有催 化剂存在的情况下是很难进行的,而酶 的催化作用可使这些反应的反应速度提 高10E6-10E12倍。
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②立体专一性,酶的一个重要特征是能专一性 地与手性底物结合并催化这类底物发生反应。在 酶催化反应中,还存在潜手性例子,虽然底物本 身不具有手性,但反应却是立体专一性的。 ③几何专一性,某些酶只能选择性地催化某种几 何异构体底物的反应,而对另一种构型的底物却 没有催化作用,如延胡索酸水合酶只能催化延胡 索酸水合生成苹果酸,而对马来酸则不起作用。 例如不同的蛋白酶都能水解肽键,但它们的专一 性程度是不相同的。
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(2)、底物专一性
一种酶只能作用于某一种或某一类结构和性 质相似的物质,而根据酶对底物专一性的程 度和类型,大致上又可分为以下几类: ①结构专一性 “绝对专一性”(例如脲酶只能催化尿素水解, 而对尿素的类似物却均无作用) “相对专一性”(如胰凝乳蛋白酶选择性地水解 含有芳香侧链的氨基酸残基形成的肽链)。
Thr
Asn Gln Tyr His Asp Glu
T
N Q Y H D E
色氨酸
半胱氨酸பைடு நூலகம்
Trp
Cys
W
C
赖氨酸
精氨酸
Lys
Arg
K
R
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20种标准氨基酸的英文简写
酶的一级结构:
酶分子多肽链共价主链的氨基酸排列顺序。
多肽链 氨基酸残基
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二、酶的高级结构
1、二级结构 2、三级结构
3、四级结构
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二级结构
2.2 酶的结构与功能
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一、酶的一级结构
氨基酸名称 甘氨酸 英文缩写 Gly 简写 G 氨基酸名称 丝氨酸 英文缩写 Ser 简写 S
丙氨酸
缬氨酸 异亮氨酸 亮氨酸 苯丙氨酸 脯氨酸 甲硫氨酸
Ala
Val Ile Leu Phe Pro Met
A
V I L F P M
苏氨酸
天冬酰胺 谷酰胺 酪氨酸 组氨酸 天冬氨酸 谷氨酸
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一级结构决定了各种侧链之间的各种相互 作用,包括疏水键、氢键、离子键、二硫 键、配位键、范德华力等。
酶的一级结构决定了酶的高级结 构,而高级结构则决定了酶的性 质与功能。
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酶的多种存在类型
1、单体酶:由一条肽链组成,只表现 出一种酶活性。 2、寡聚酶:由两个或两个以上亚基组 成的酶,具有四级结构 。 3、多酶复合体:由两个或两个以上的 酶靠共价键连接而成 。 4、多酶融合体:指一条多肽链上含有 两种或两种以上催化活性的酶 。
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三、酶的活性中心
1、活性中心:酶蛋白分子中与催化有关的一个
特定区域,它能与底物结合并发挥催化作用。
氨基酸残基分为:
接触残基 辅助残基 结构残基 非贡献残基
必需基团
非必需基团
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一些酶活性中心的必需基团
活性中心内起催化作用的部位称为催化部位或催化位点 ,与底物结合的部位称为结合部位或结合位点。对于大 多数的酶来说,催化部位和结合部位都不是只有一个, 有时可以是有多个。
。
与酶蛋白结合比较疏松,一般为非共价 结合,可用透析方法除去的称为辅酶 (coenzyme,Co)。 与酶结合牢固,一般为共价结合,不能 用透析方法出去的称为辅基 (prosthetic group)。
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辅助因子既可以是无机离子,也可以是 有机化合物。 举例:羧肽酶(从C-末端催化水解蛋 白质)活性需要锌离子,否则便会失活, 重新加入锌,活力又可恢复。