第八章氨基酸发酵机制
(二)共价调节酶(covalently modulated 共价调节酶( enzymes) )
什么是共价调节酶? 什么是共价调节酶?是一类由其它酶对其结构进行可逆共价
修饰,使其处于活性和非活性的互变状态,从而调节酶活性。
常见的是磷酸化/脱磷酸化,腺苷酰化 脱腺苷酰化 脱腺苷酰化, 常见的是磷酸化 脱磷酸化,腺苷酰化/脱腺苷酰化, 脱磷酸化 乙酰化/脱乙酰化,尿苷酰化 脱尿苷酰化 甲基化/脱甲 脱尿苷酰化, 乙酰化 脱乙酰化,尿苷酰化/脱尿苷酰化,甲基化 脱甲 脱乙酰化 基化, 相互转变, 种类型。 基化,S-S/SH相互转变,共6种类型。 相互转变 种类型
(一)负调控 模型一: 模型一: 乳糖操纵子理论
E.coli乳糖操纵子(lac operon)包含β 半乳糖苷酶 三个结构基因:Z 编码β-半乳糖苷酶 Y 编码通透酶 A 乙酰基转移酶 一个操纵序列O 一个操纵序列 一个启动序列 P 一个调节基因 I 一个分解代谢物基因激活蛋白( 一个分解代谢物基因激活蛋白(catabolite gene activation protein,CAP)结合位点 )
模型的几个假定: 模型的几个假定
该模型的要点 该模型的要点 :主张别构酶所有的亚基或者全部是坚固
紧密的,不利于结合底物的“T”状态,或者全部是松散 的,利于结合底物的“R”状态。这两种状态间的转变对 每个亚基都是同步的,齐步发生的,“T”状态中的亚基 的排列是对称的,变为R状态后,蛋白亚基的排列仍然 是对称的。
如E.Coli 谷氨酰胺合成酶 腺苷酰化无活性 脱腺苷酰化有活性
(三)寡聚酶的解聚和聚合
乙酰CoA + HCO3- + ATP
乙酰CoA羧化酶 丙二酸单酰CoA
柠檬酸激活
丙二酰辅酶A抑制
蛋白激酶调节: 聚合:活性低 解聚:活性高
(四)蛋白酶水解的激活作用
1、胃蛋白酶原(pepsinogen)的激活 、胃蛋白酶原( )
有乳糖存在时,lac操纵子可被诱导。 有乳糖存在时,lac操纵子可被诱导。乳糖在通 操纵子可被诱导 透酶催化、转运进入细胞,再经β 半乳糖苷酶催化, 透酶催化、转运进入细胞,再经β-半乳糖苷酶催化, 转变成半乳糖。 转变成半乳糖。半乳糖作为诱导剂分子结合阻遏蛋 白,使蛋白构象变化,导致阻遏蛋白与O序列解离, 使蛋白构象变化,导致阻遏蛋白与O序列解离, 发生转录。 发生转录。
ATCase活性调节的机理 活性调节的机理
C C C
汞盐
R R R R R R
C C
C C
C
+
C
催化亚基 (三聚体)
R R R R
R R
C
C
C
完整的 ATCase (活性)
调节亚基 (二聚体)
CTP ATP
有催化活性的构象
无催化活性的构象
5.负协同效应(negative cooperative effect) 负协同效应( 负协同效应 )
每一转录区段可视为一个转录单位,称为操纵子。 每一转录区段可视为一个转录单位,称为操纵子。 操纵子包括若干个结构基因及其上游的调控序列 原核生物)。 (原核生物)。
启动序列(promotor):RNA聚合酶结合并启动转录 启动序列(promotor):RNA聚合酶结合并启动转录 ):RNA 的特异DNA序列。又称启动子。 的特异DNA序列。又称启动子。各种原核启动序列特定区 DNA序列 域内(通常在转录起始点上游-10及 35区域) 域内(通常在转录起始点上游-10及-35区域)存在共有 区域 序列( sequence) 序列(consensus sequence) 原核生物启动子序列按功能的不同可分为三个部位,即 原核生物启动子序列按功能的不同可分为三个部位, 三个部位 起始部位、结合部位、识别部位。 起始部位、结合部位、识别部位。 操纵序列(operator):与启动序列毗邻或接近的 操纵序列(operator):与启动序列毗邻或接近的 ): DNA序列,是原核阻遏蛋白的结合位点。其DNA序列常与 DNA序列,是原核阻遏蛋白的结合位点。 DNA序列常与 序列 启动序列交错、重叠。 启动序列交错、重叠。
调节基因
控制基因
结构基因
Lac操纵子及各个组分
(一)阻遏蛋白的负性调节 没有乳糖存在时,lac操纵子处于阻遏状态。 没有乳糖存在时,lac操纵子处于阻遏状态。I 操纵子处于阻遏状态 序列表达的lac阻遏蛋白与O序列结合,阻碍RNA聚 序列表达的lac阻遏蛋白与O序列结合,阻碍RNA聚 lac阻遏蛋白与 RNA 合酶与P序列结合,抑制转录启动。 合酶与P序列结合,抑制转录启动。
调节物与变构酶结合后,酶的构象发生变化,新的构象不 利于后续底物分子或调节物的结合。
• 3-磷酸甘油酸脱氢酶 • 3-磷酸甘油酸脱氢酶对NAD浓度的较大变化 不受大的干扰。
(二)序变模型和齐变模型
对称或协同模型( 对称或协同模型(symmetry or concerted model,也称齐变模型、MWC模型) 也称齐变模型、 模型) 也称齐变模型 模型 1965年由 年由Monod、Wyman和Changeux提出。 提出。 年由 、 和 提出
• (3)补偿性激活
• A→B → C → D → E • • F→G→H
I
2.多功能途径 (1)协同反馈抑制(多价反馈抑制) F→G A→B → C D→E
如:谷氨酸棒杆菌中天冬氨酸激酶
(2)合作反馈抑制 如:催化嘌呤生物合成最初反应
的谷氨酸胺磷酸核糖焦磷酸转氨 酶
F→G A →B → C D→E
第八章
氨基酸发酵机制
第一节、概述 1.代谢控制发酵 遗传学的方法或其他生物化学的方法, 人为的改变、控制微生物的代谢,使有 用产物大量生成、积累的发酵。 条件: (1)搞清楚了微生物细胞各种氨基酸代谢的 遗传控制,代谢调节机制。 (2)可人为的在DNA水平上改变微生物的代 谢 (3)合理的控制环境条件
(n个Glc基) 个 基
2、结构特征 、
3、调节机理 、
磷酸化酶的磷酸化与脱磷酸化
磷酸化酶构象的变化( 磷酸化酶构象的变化(包括亚基的聚合与 解离 化学信号的放大(级联放大) 化学信号的放大(级联放大)
酶的磷酸化和脱磷酸化主要在高等动物细 胞中进行, 胞中进行,而腺苷酰化和脱腺苷酰化在细菌中 比较常见。 比较常见。
脱敏作用: 经特定处理后,不丧失酶活性而失去对变 构效应物的敏感性,称脱敏作用。 (1)酶解聚 (2)基因突变
4.正协同效应(positive cooperative effect) 正协同效应( 正协同效应 ) 调节物与变构酶结合后,酶的构象发生变化,新的 构象有利于后续底物分子或调节物的结合。
目前已知可以受化学修饰调节的酶几乎又都是别构酶。
共价调节酶最典型的例子是动物组织的糖原磷酸化酶 共价调节酶最典型的例子是动物组织的糖原磷酸化酶
1. 糖原磷酸化酶催化的反应
催化糖原的磷酸解,生成 催化糖原的磷酸解,生成G-1-P。 。
+ H3PO4
糖原
糖原磷酸化酶
G-1-P + 糖原
(n-1个Glc基) 个 基
调节基因( 调节基因(regulatory gene or inhibitor gene, I )
启动序列 操纵序列 promoter operator
Z 编码β-半乳糖苷酶 编码β 半乳糖苷酶 Y 编码透酶 a 编码乙酰基转移酶
一个分解代谢物基因激活蛋白( 一个分解代谢物基因激活蛋白(catabolite gene activation protein,CAP)结合位点 )
① ② ⑨
⑤ ⑩ ⑾ ⑿ ③ ⑥
⑦ ④
⑧
第二节、酶活性的控制
• 别构效应、共价修饰、寡聚酶的解聚与聚合、 蛋白酶水解激活 • 一、变构调节 • (一)变构效应(别构效应) • 1.别构效应:某种不直接涉及蛋白质活性的物质,结
合于蛋白质活性部位以外的其他部位(别构部位), 引起蛋白质分子的构象变化,而导致蛋白质活性改变 的现象。
正协同效应别构酶与米氏酶动力学比较
大肠杆菌天冬氨酸转氨甲酰酶( 大肠杆菌天冬氨酸转氨甲酰酶(E-Coli aspartate transcarbamylase, ATCase) )
氨甲酰磷酸 氨甲酰天冬氨酸 天冬氨酸
• (1)Asp浓度增加,ATC酶与底物亲和 力及协同性增加 • (2)CTP反馈抑制ATC酶活性,但不能 全部抑制 • (3)底物浓度饱和而达到最大反应速度 不受抑制剂的影响
第三节、酶合成调节 合成调节方式 1.酶的诱导 2.分解代谢物阻遏 3.终产物调节
一、操纵子学说
酶活性合成调节也即基因表达的转录调节或酶量调节, 酶活性合成调节也即基因表达的转录调节或酶量调节, 是一种相对的慢调节过程。 是一种相对的慢调节过程。基因表达调控是通过操纵子机制 实现的。 实现的。 操纵子(operon):通常由2 操纵子(operon):通常由2个以上的编码序列与启动序 ):通常由 列(promotor)、操纵序列(operator)以及其它调节序列 promotor)、操纵序列(operator) )、操纵序列 在基因组中成簇串联组成。 在基因组中成簇串联组成。
• 别构酶:受别构效应调节的酶。 • 效应物:凡使酶发生别构效应的物质,
• 通常为小分子代谢物或辅助因子。
2.别构酶结构上的特点 别构酶结构上的特点:多个亚基、有四 别构酶结构上的特点 级结构、活性中心与别构中心可处于不 同的亚基或同一亚基不同的部位。 3.别构酶性质上的特点 别构酶性质上的特点:当专一性底物与 别构酶性质上的特点 别构中心诱导楔合时,随着别构中心构 象的改变,该酶的活性中心构象也会相 应发生变化,从而引起酶催化活性的改 变。
• 调节酶总结:
(1)调节酶一般为变构酶; (2)调节酶反应速度与底物浓度关系多呈S型,有协 同性; (3)调节酶多处于合成代谢途径上而且一般在代谢分 支点,多受终产物反馈抑制; (4)中间产物不影响调节酶的活性; (5)调节酶后面的酶对终产物不敏感; (6)有脱敏作用; (7)调节酶与负效应物非共价结合引起的变构调节, 是酶活性控制的一种快速、敏感、高效的细调方式。