１．第一临床学院临床医学(本硕连读) 本专业学制七年，实行七年一贯，本硕融通，加强基础，注重素质，整体优化，面向临床的培养模式，旨在培养具有扎实医学理论知识和临床实际工作能力，适应社会发展需要，达到临床医学专业硕士学位水平的高素质专门人才。
能掌握较坚实的本专业必备的基础理论、基本知识和基本技能；能系统地掌握临床医学理论和实践技能；具有独立担任临床工作，从事临床医学实践工作能力，独立处理常见病，多发病和常见危急病症，了解疑难病症的诊疗原则及初步处理能力；具有获得本专业科学技术新发展、新动向的能力；具有适应未来国际医学科学技术竞争的基本素质和较大发展潜能；具有一定的人文社会科学，以及扎实的自然科学的理论知识；具有较强的自学能力，独立分析与解决问题的能力；具有熟练的计算机应用能力，熟练掌握一门外语，能听、说、读、写，比较熟练的阅读英文专业文献资料，能用英文撰写病史和论文。
本专业主要课程：外语、高等数学、物理学、化学、生物学、计算机基础及应用、人体解剖学、组织学和胚胎学、病原生物学、免疫学、生物化学、分子生物学、生理学、病理学、药理学、诊断学、医学心理学、内科学、外科学、儿科学、妇产科学、预防医学等。
实习三年，毕业后授予临床医学专业硕士学位临床医学本专业是省级教改示范专业，学制五年，培养综合素质较高、基础知识雄厚、专业知识丰富、具有创新精神、能适应医疗、教学、科研工作需要、适应终身教育的高级医学人才。
要求学生扎实掌握本专业所必备的基础理论、基础知识和基本技能，并能运用所学的知识和技能防治常见病、多发病及处理一般疑难急重病症；初步掌握中医基本理论和基本技能；能阅读一种外文专业书刊；具有初步科学研究能力。
毕业后主要在医疗卫生机构、医药卫生管理机构、药品生产及营销机构工作，还可在医学教育和科研机构就业。
本专业主要开设人体解剖学、细胞生物学、组织胚胎学、免疫学、病原微生物学、生理学、生物化学、病理学、药理学、诊断学、内科学、外科学、妇产科学、儿科学、精神病学等课程。
实习一年。
毕业后授医学学士学位。
麻醉学本专业学制五年，培养具备基础医学、临床医学和现代医学麻醉学基本理论和能力，能在医疗卫生及科研单位从事临床麻醉、重症监护（ICU）、疼痛治疗、手术治疗、手术室护理等方面工作的麻醉医学高级专门人才。
要求学生掌握本专业基础理论、临床医学知识和操作技能，并能运用所学的知识和技能为临床手术病人提供无痛、安全、良好的手术条件以完成手术治疗；能通过所掌握的复苏急救知识和技术，对各种病人，特别是危重急症病人进行急救处理，且具有初步科学研究能力。
毕业后可在医院麻醉、疼痛治疗等科室从事医务、科研及管理工作。
本专业主要开设基础医学、临床医学的相关课程外，还开设麻醉解剖学、麻醉生理学、麻醉设备学、麻醉药理学、临床麻醉学、危重病医学、疼痛诊疗等专业课程。
实习一年。
毕业后授医学学士学位。
临床医学(康复医学方向) 本专业学制五年，培养知识面宽、品学兼优、身体健康，能对临床上各种急慢性疾病引起的功能障碍和残疾人独立进行康复机能评价和康复治疗的高级专门人才，要求学生在学习基础医学和临床医学理论的基础上，掌握康复医学基础理论和专业技能，学生毕业后具备初步科研能力，能从事康复机能评价和康复治疗工作，可以在医疗机构、体育卫生单位、健身康复机构和康复训练器材生产营销企业工作。
本专业主要开设基础医学、临床医学、康复医学、康复临床学、康复治疗学、体育锻炼方法学、康复技能评估、社区康复等课程。
实习一年。
毕业后授医学学士学位。
医学影像学本专业学制五年，培养具备基础医学、临床医学和现代医学影像学基本理论知识和能力，能在医疗卫生及科研单位从事医学影像诊断、介入放射和医学成像等临床和科研工作的医学高级专门人才。
要求学生通过五年的在校学习，掌握医学专业基础理论和基本技能；掌握现代医学影像学的基本原理、特点和初步临床应用；并具有初步的科学研究能力。
毕业后具有从事医学影像诊断、介入放射和医学成像技术工作能力，能在医院影像、介入放射、同位素等科室从事医疗、科研和管理工作。
本专业主要开设基础医学、临床医学、医用电子学基础，影像诊断学、超声诊断学、核医学、影像技术学、介入放射学、影像解剖学、影像设备结构与维修、放射学维护等课程。
实习一年。
毕业后授医学学士学位。
临床医学(医学美容方向) 本专业学制五年，培养具有扎实的医学理论知识、动手能力强、知识面广、具有创新精神的高素质医学美容专业人才。
学生在学习基础医学和医学知识及实验技能的基础上，掌握与医学美容相关的皮肤、整形、口腔、美学基础知识和操作技能、基本应用能力，能施行美容皮肤、美容外科、美容牙科等医学美容技术。
毕业生主要就业去向为综合医院的美容中心或美牙中心、社区医疗美容机构、美容咨询服务机构等，还可在医学美容教育或科研机构就业。
本专业主要开设基础医学、临床医学、医学美容导论、医学美容艺术基础、医学美容技术、美容化妆品学、美容心理学、美容皮肤科学、美容外科学、美容牙科学等课程。
实习一年。
毕业后授医学学士学位。
临床医学(精神卫生方向) 本专业学制五年。
精神医学是研究人类各种精神疾患、心理障碍的病因、发病机制、临床特点和防治方法的一门临床学科，旨在探索人类精神世界的奥秘，促进人类的精神健康。
培养能从事精神医学或精神卫生工作的临床医师。
要求学生掌握基础医学、临床医学、精神病学及临床心理学的基本理论和知识，具有较全面的临床诊疗技能和一定的科学研究能力，能够处理常见的精神疾病、心理障碍、行为障碍及相关疑难急重症。
就业方向：综合医院、精神卫生临床和保健机构、脑科医院、医学心理中心等从事医疗、教学和科研工作。
主干课程有：基础医学和临床医学的主干课程、精神病学、儿童精神医学、老年精神病学、变态心理学、临床心理学、心理测量学、心理咨询与治疗等。
实习一年，毕业后授医学学士学位。
临床医学(医学心理学方向) 本专业学制五年，是心理学与医学交叉融合形成的跨学科专业。
培养具有扎实的医学、心理学专业知识和专业技能，能在医疗机构从事临床工作，在教育机构从事心理健康教育、心理咨询与治疗等方面工作，在科研机构从事相关科研工作的高层次专门人才。
本专业设有健康心理学、临床心理学、认知神经心理学等专业实验室，并已获得国家自然科学基金、安徽省自然科学基金以及安徽省优秀青年科技基金等重点资助，开展记忆及情绪的认知神经机制方面研究。
本专业主要开设生理学、病理学、药理学、内科学、外科学、神经病学、精神病学、普通心理学、社会心理学、健康心理学、临床心理学、心理测量、心理咨询与治疗等课程。
实习一年。
毕业后授医学学士学位。
２．口腔医学院口腔医学院(附属口腔医院·安徽省口腔医院)是安徽省培养口腔医学专业高级人才的基地，其前身是上海东南医学院牙科，至今已有80多年历史，1952年学校成立口腔科，1978年筹建口腔系，1984年开始招收口腔本科专业学生，1997年9月建成附属口腔医院，1999年口腔系升格为口腔医学院，2000年获得口腔临床医学硕士学位授予点并开始招收硕士学位研究生。
2006年对港澳台地区招收硕士研究生，2008年口腔临床医学被遴选为省级重点学科。
口腔中心实验室被确定为省级重点实验室，并获得省部共建实验室专项经费资助。
目前口腔医学院为安徽省口腔医疗、教学、科研中心。
经过二十多年发展和完善，口腔医学院形成了完善的教学、科研和医疗体系，并与美国、日本澳大利亚等大学及中国科学技术大学、中科院合肥光学研究所开展科研合作项目，同时口腔医学院是卫生部临床药理一期实验基地、中华医学会医学美学与美容学会口腔学组组长单位、安徽省口腔修复、正畸及修复工艺委员会主委单位、安徽省口腔颌面创伤委员会主委单位。
学院现有口腔内科学、口腔颌面外科学、口腔修复正畸学、口腔解剖生理学、口腔组织病理学、口腔预防医学等六个教研室和口腔医学及口腔医学美学两个研究所，拥有安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院、解放军306医院、常州市口腔医院、无锡市口腔医院、合肥市口腔医院等十多家专业实习基地。
每年招收五年制本科生60名，硕士研究生10-15名，台湾地区研究生58名，与中科院合肥光学研究所联合培养博士生。
安徽医科大学附属口腔医院是安徽省批准成立的唯一一家省级口腔专科医院，医院依托安徽医科大学雄厚的智力资源优势，经过多年发展和壮大，已成为省内口腔医疗、教学、科研和预防保健中心。
医院设有口腔内科、口腔颌面外科、口腔修复科、口腔正畸科、口腔预防科、口腔放射科、口腔病理科等临床医技科室13个，口腔综合治疗台60张，病床30张，诊疗项目齐全。
2005年被批准同时挂牌安徽省口腔医院。
口腔医学本专业学制五年，培养能适应口腔医疗、预防、教学和科研工作需要的高级口腔医学专门人才。
学生在学习基础医学和临床医学知识及实验技能的基础上，掌握口腔常见病、多发病的诊治和预防及临床操作技能；具有口腔医学教学和科研能力。
毕业生主要在口腔专科医院、医院口腔科、口腔医学教学或科研单位及卫生保健机构就业。
本专业主要开设基础医学、临床医学、口腔解剖生理学、口腔组织病理学、口腔材料学、口腔放射诊断学、口腔生物学、牙体牙髓病学、牙周病学、口腔黏膜病学、儿童牙病学、口腔颌面外科学、口腔预防医学、口腔修复学和口腔正畸学等课程。
实习一年。
毕业后授医学学士学位。
3.基础医学院：生物技术本专业学制四年，1999年开始招生，培养具有系统的生命科学与生物技术的基本理论、基本知识和基本技能，能在科研机构从事生命科学研究和医疗卫生、医药企事业行政管理部门从事与生物技术有关的应用研究、技术开发、生产管理和行政管理等工作的高级专门人才。
就业方向：该专业每届毕业生除30％以上考取硕士研究生生外，大都被北京、上海、江苏、广东和本省有关生物技术研究所、医药院校和有关生物制品企业录用，就业率100%。
本专业主要开设物理学、化学、生物学、英语、高等数学、生物化学、细胞生物学、微生物学、分子生物学、遗传学、基因工程、细胞工程、生物工程下游技术、企业管理等相关课程。
实习半年，毕业后授理学学士学位。
临床医学（临床病理方向）本专业学制五年，2007年开始招生，培养基础知识雄厚、专业知识丰富、实践能力强和具有创新精神的病理学专门人才。
要求学生扎实掌握本专业所必备的基础理论知识和基本技能，并能运用所学的知识和技能对常见病、多发病作出病理诊断；对疑难和少见病例的确诊提出进一步检查意见；能为临床和医学科研工作需要提供相应的病理技术支持。
就业方向：设置病理科室的医疗卫生、教育或科研机构，医药卫生管理机构，相关医疗器械生产技术企业及营销机构。
本专业开设的课程除基础医学和临床医学的相关课程外，还开设诊断病理学、细胞诊断学、病理学技术、法医病理学及分子病理学等专业课程。