实用生物信息技术课程第3次作业
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序列比对
姓名________ 学号______________ 编号_________ 日期__________
1. 从UniProt 数据库中提取人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基蛋白质序列，进行全局比
对，选择默认计分矩阵BLOSUM62和空位罚分，将比对结果填入表1。

分析比对结果，说明得到上述结果的原因和进一步分析思路。

表1 人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基蛋白质序列比对结果 物种 Species 登录号 Accession
得分 Score 相同氨基酸 Identity
相同和相似氨基酸
Similarity
空位 Gaps 人/小鼠 / 人/大鼠 / 小鼠/大鼠
/
2. 从RefSeq 数据库中提取人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基编码区序列，进行全局比
对，将结果填入表2。

选择不同计分矩阵和空位罚分，分析比对结果。

表2 人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基mRNA 编码区序列比对结果 物种 Species 登录号 Accession
得分 Score 相同核苷酸 Identity
相同和相似核苷酸
Similarity
空位 Gaps 人/小鼠 / 人/大鼠 / 小鼠/大鼠
/
3. 从UniProt 数据库中检索并提取人血红蛋白alpha 亚基和胞红蛋白（Cytoglobin ）序列，
分别进行全局比对和局部比对，将比对结果填入表3。

分析比对结果，说明全局比对和局部比对的差别。

表3 人血红蛋白alpha 亚基和beta 亚基蛋白质序列比对结果
比对方法 长度 得分 相同氨基酸 相同和相似氨基酸 空位 Needle Water 4. 将上述数据库检索、序列比对、结果分析的方法、思路、策略用于和你研究课题相关或
你熟悉的蛋白质及其编码序列，分析比对结果，说明原因。