不同菌属间的（ G+C ） mol ％范围很大，在 25 ％ ～75％之间
同一种细菌（ G+C ） mol ％相当稳定，不受菌龄、 培养条件和其他外界因素影响

亲缘关系越近，细菌的（G+C） mol％越相近
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核酸同源值测定
利用DNA分子杂交技术测定DNA分子的相似度。
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二、正确采集和处理标本
1. 注意事项
① 采取血液、脑脊髓液或穿刺液时应严格无菌操作，避免 杂菌污染；粪便、肛拭子、鼻咽拭子应置于灭菌容器内， 尽可能避免标本外细菌混入 ② 应在使用抗菌素前采集标本 ③ 盛标本的容器不得用消毒剂或酸碱类消毒处理 ④ 尽快送检，或根据分离病原的不同保存于适当的温度条 件下，如冷冻等
析寡核苷酸的碱基序列可测出rRNA的相关性。绘制
各类群关系和树状谱，从而确定种系的发生关系。
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第四节
细菌的分类体系
细菌分类体系主要是“伯吉氏系统细菌学手册”， Holt（美国）编共4卷，以及“伯吉氏细菌鉴定手册”
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和人具有致病作用的衣原体、立克次体、霉形体、螺旋体、
放线菌等，此外还涉及蓝细菌、紫色光合细菌等。
分类单元
细菌属原核生物界，包括衣原体、立克次体、 霉形体、螺旋体、放线菌等。 分类有纲、目、科、属、种，但最重要、最 基本的是种，其次是属。
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1. 属（genus）：具有共性的若干种的组合，与其 他属有明显差异。 2. 种（species）：微生物学分类的最基本单元。 种是一群性质相似的菌株，与其他菌株群体有明显差 异。 3. 菌株（strain）：不同来源的某一种细菌的纯培 养物。
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例如 Salmonella typhi(伤寒沙门菌)。属名 也可用第一个字母代表，如 S typhi 等。有时泛 指某一属细菌而不特指其中的某个细菌则可在 属名之后加上sp，如Salmonella sp，即表示沙门 菌属细菌（sp代表菌种species，复数用spp）
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数值分类法
各种生物学性状按“等重要原则”进行分类 如选择 100-200项生理生化指标，比较结果，以 相似系数或相似百分数表示：相似系数 =相同特征数/ （相同特征数+不同特征数） 相似系数越大表示相同特征越多，说明两个菌种 间有较高的亲缘性
商品鉴定试剂及自动化细菌鉴定系统即采用数值分类原理
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标准菌株或模式菌株(standard/type strain)
具有某种细菌典型特征的菌株，它是该种菌 株的参比菌株。
在细菌的分类、鉴定和命名时以模式菌株为 依据，也可作为质量控制的标准。
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传统分类法（双歧检索条目分类法）
以形态生理特征为依据选择稳定的生物 学性状，如形态结构、染色性、培养特性、 生化反应、抗原性作为分类依据，然后按 主次顺序逐级区分。
使用方便，分类亦明确，但有主观性。
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研究种系发生关系采用三种方法：
DNA（G+C）含量测定（mol％） 核酸同源值测定（核酸分子杂交） 16S rRNA寡核苷酸同源性
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DNA（G+C） 含量的测定
DNA 分子两条链上（ G+C ）的摩尔百分数是稳定 的，能反映出细菌间 DNA分子同源程度，习惯上以 （G+C）作为细菌分类标记来自20 版权所有者：盖新娜

新手册共分4卷33章，先后于1984、1986和1989年 出版。 第一卷（1984）主要是革兰氏阴性细菌、立克次氏体、 衣原体、支原体和螺旋体的分类


第二卷（1986）主要是革兰氏阳性细菌的分类
第三卷（1989）主要是原始细菌、蓝澡等的分类 第四卷（1989）主要是放线菌、链霉菌等的分类
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新种，拉丁文学名后加上 “ sp.nov ” 。如， Lawsonia intracellularis gen.nov.,sp.nov.，译为胞 内劳森菌，新属新种。 亚 种 ， 用 subsp. 或 ssp. 表 示 。 如 Pasteurella multocida subsp. septica，多杀性巴氏杆菌败血 亚种。
Strain 1 Heat
+
Strain 2
0% Homology
100% Homology
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结果判定
结合率大小反映DNA碱基序列相似程度和菌种间 的亲缘关系。
70％以上的为同一种
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核蛋白体RNA碱基序列测定
细菌核蛋白体RNA序列比较保守。其变化十分缓 慢。 分离提取细菌16SrRNA，用T1核酸酶消化，分
培养物保藏中心(ATCC) ”以及“德国微生物及 细胞保藏中心(DSM) ”等。 我国兽医微生物菌（毒）种由中国兽药监察 所鉴定保存。
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第五节
临床标本的微生物学检验
分离病原微生物的基本要领：
一、重视标本送检申请单
记录标本的来源、送检的目的、临床诊断 （主要症状等），认真做好登记工作
第二节 细菌的命名
依据“国际细菌命名法规” 学名用拉丁文，遵循“双名法”，具备拉丁化文
字形式和明确分类等级的两个特点，即有一个属名和 一个种名构成。

属名在前，首字母大写；


种名在后，均用小写；
两者均用斜体表示。 细菌学名的中文译名则种名在前，属名在后。
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《国际系统与进化微生物学杂志》

原名“国际系统细菌学杂志”，是世界公认的细菌分 类命名权威杂志。

新分离鉴定细菌应在其上发表，或提交副本公布。2年 后无异议，新名称方可生效。
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国际公认的菌种保藏权威机构是“美国典型
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二、种系分类法（遗传学分类法)
目前分类依据是细菌的种系发生关系，即 分析其基因特性，确定分类地位。以细菌的 核酸的同源程度分类，优点是：
对细菌的“种”有较为一致的概念 使分类不会出现根本性的变化 可制定可靠的细菌鉴定方案
有利于了解进化和亲缘关系

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第三节 细菌的分类方法
① 细菌的生理生化分类法：包括有传
统分类法（双歧检索条目分类法） 和数值分类法； ② 种系分类法：细菌核酸的同源程度 进行分类。
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一、生理生化分类法
细菌的形态、染色以及特殊结构是最早的分 类依据，有传统分类和数值分类法两种。
2. 采集、包装和送检过程中要注意安全
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三、选择适宜的培养基是分离出病原菌的重要环节 四、认真区分污染菌
① ② ③
观察菌落是否在划线上 每次培养需要做无菌对照 结合拟培养的细菌的生长特点去对照判断（菌落的形状、 大小、色泽、边缘、透明度、湿润度、溶血现象等） 注意观察时间，如布氏杆菌、支原体、钩体、结核杆菌的 生长缓慢 涂片染色检查，观察是否与目的菌一样
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④
⑤
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第六节

细菌鉴定
目前进行细菌鉴定的方法有：

细菌鉴定试剂盒有API系统、Vitek系统、 Enterotube系统

PCR鉴定：毒力基因、16sRNA
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第六章
细菌的分类与命名
第一节 细菌的分类地位
在全面了解细菌生物学特征的基础上，研究它们的种类， 探索其起源、演化以及与其他类群之间的亲缘关系，进而提 出能反映自然发展的分类系统，并将细菌加以分门别类。
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细菌过去归属植物界，自1974年以来，划为原核生物。 细菌作为另一个系统进化类别的原核生物，包括对动物
1. 提取待鉴定细菌与参考菌株的DNA，
2. 加热变性解链 3. 将两种变性的DNA(其中参考菌株的DNA为标记DNA
或rRNA)混合液在一定的温度下保温复性
4. 得到杂交的双螺旋DNA分子，鉴定其双螺旋结合率。
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DNA-DNA hybridization