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分子实验室、细胞实验室常用配方

分子实验室、细胞实验室常用配方————————————————————————————————作者: ————————————————————————————————日期:ﻩ(一)WB相关试剂及常用缓冲液●RIPA(100mI)(最后要调pH为7.4)终浓度分子量称取50mM 121.14 605.7mg Tris-HCI(pH7.4)NaCI 150 mM58.44876.6mgTritonX-100 1% 1mI脱氧胆酸钠1%1gEDTA 1mM 292.24829.2248mgSDS 0.1%0.1gPMSF(100mM) 使用时每1ml加10ul●10%过硫酸铵溶液AP(分装保存于-20度)AP粉末 1gddH20 10ml●10%SDS(十二烷基硫酸钠):SDS粉末10gddH20定容到 100ml注意:用磁力搅拌器搅拌不会容易起泡泡●6X蛋白质sample bufferTris-HCl(1M,pH6.8) 30mLSDS10g甘油 30mLDTT(154.25)9.3g溴酚蓝0.06gdd H20定容至100mL●10XPBS缓冲液的配制:NaCl 80gKCl 2gNa2HPO4 14.4g(十二水合36g)KH2PO40 2.4g加800 mLddH2O,根据开始的pH用NaOH或HCL调pH到7.4,调好pH再定容到1升。

配好后用高压蒸气灭菌后常温保存最好是在4度●PBST(1X)PBS(1X) 500mlTween 20500μl●50×Tris-乙酸(TAE)缓冲液配制1L溶液各成分的用量Tris粉末 242g冰醋酸 57.1mlNa2EDTA·2H2O 37.2gddH20定容到 1L●封闭液脱脂奶粉 5g叠氮钠 0.02g(现配现用时可不加)PBS 定容到100mL●染色液(室温)1L 500ml 200ml 100ml甲醇500mL250100 50乙酸100 mL 5020 10R250考马斯亮蓝0.5g 0.25g 0.1 g 0.05 gH20400 mL 2008040●脱色液:(室温)甲醇 165mL乙酸50 mLH20785 mL●8.8Buffer:(调pH至8.8,4度保存)100ml 200mlTris 18.17g36.34g10%SDS 4mL8mlddH20定容至100mL 200ml● 6.8 Buffer: (调pH至6.8,4度保存)100ml 200mlTris 6.06g 12.12g10%SDS 4mL 8mlddH20 定容至100mL200ml●转移缓冲液(10×trans buffer):(常温保存)1L 2L甘氨酸144g 288gTris粉末30.3g60.6ddH20 定容至1L 定容至2L使用时甲醇 200mL转移缓冲液(10×)100 mLddH20 700 mL●电泳缓冲液(10×)(running buffer):(常温保存)1L 2L甘氨酸144g 288gTris粉末30.3g 60.6SDS 10g 20gddH20 定容至1L 定容至2L●10Х)TBS: (常温保存)NaCl 80.0gTris粉末 24.2gddH20 定容至1L●TBST(1X)TBS(1X) 500mlTween20 500μl●Stripping buffer(可反复利用)温老师组配方10%SDS 10mlΒ-巯基乙醇350 lTris-HCI(pH6.8) 6.25ml(6.06加到50mL水)加入ddH2O至50mL●Stripping buffer(可反复利用)郭老师给配方甘氨酸15gSDS1gTween20 1mldd ddH2O 1L作这个buffer洗20min,然后用PBST洗3次,再重新封闭孵抗体。

(二)细胞和细菌培养基、抗生素●LB培养基(当天灭菌后放4度存放)1000ml 500ml300 ml250 ml 200 ml 氯化钠10g 5g3g 2.5g 2g蛋白胨10g5g 3g 2.5g 2g酵母提取物5g 2.5g 1.5g 1.25g1gddH20 定容至1000ml 定容至500ml 定容至300ml定容至250ml定容至200ml●LB平板:(当天灭菌后倒平板,放4度存放)1000ml 500ml 300 ml 250 ml 200 ml 氯化钠10g 5g 3g 2.5g 2g蛋白胨10g5g3g 2.5g 2g酵母提取物5g 2.5g 1.5g 1.25g 1g琼脂15g 7.5g4.5g 3.725g 3gddH20定容至1000ml定容至500ml 定容至300ml定容至250ml定容至200ml●SOB培养基将下列组分溶解在0.9L水中:ﻫ蛋白胨20gﻫ酵母提取物 5gﻫ氯化钠 0.5g1mol/L氯化钾 2.5ml用水补足体积到1L。

分成100ml的小份,高压灭菌。

培养基冷却到室温后,再在每100ml的小份中加1ml灭过菌的1mol/L氯化镁●1M IPTG(异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(分子量为238.3))溶液IPTG粉末2.383gddH20 定容到10ml用0.22μm滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20℃。

●Amp+(50mg/ml)Amp+粉末50mgddH20 1ml注意:分装保存于-20度,使用时按1000:1的比例用●Kana+(50mg/ml)Kana +粉末 50mgddH20 1ml注意:分装保存于-20度,使用时按1000:1的比例用●胰酶:抽滤,长期保存可放负20度粉末 0.25gEDTA0.02-0.03g1XPBS 100ml●高糖DMEM培养基:抽滤保存在4度粉末全部碳酸氢钠3.7gddH20 定容到1L(用盐酸调pH值到:7.2-7.4)●G418母液(100mg/ml)用0.22μM滤菌,分装存于-20度粉末 1gPBS 10ml●zeocin母液(100mg/ml)用0.22μM滤菌,分装存于-20度粉末1gddH2O10ml●Blasticidin(100mg/ml)用0.22μM滤菌,分装存于-20度粉末0.3gPBS 10ml(三)利用His-tag从细菌中纯化蛋白配方透析液配方终浓度母液浓度量取体积20mM 1M20ml Tris-HCl(pH:8.0)NaCl 20mM 4M 5 mlMgCl22mM1M 2 mlDTT 1mM1M 1ml甘油50% 500mlddHO472 ml2●超声裂解液(lysisbuffer):2011年做蛋白纯化时用Na3PO4(164) 8.2g(50mM)NaCl (58.5)17.55g(300mM)加800 mL ddH2O溶解,用2M NaOH或者2MHCL 调pH到8.0,再定容到1升。

配好后用高压蒸气灭菌后常温保存。

●洗涤液(wash buffer):2011年做蛋白纯化时用Na3PO48.2g(50mM)NaCl 17.55g(300mM)咪唑 0.681g(10mM)加800 mLddH2O溶解,根据开始的pH用2M NaOH或者2M HCL调pH到8.0,调好pH 再定容到1升●洗脱液(elution buffer):2011年做蛋白纯化时用Na3PO4 8.2g(50mM)NaCl 17.55g(300mM)咪唑17.025g(250mM)加800mLddH2O溶解,根据开始的pH用2MNaOH或者2MHCL调pH到8.0,调好pH再定容到1升)PrepEase®Histidine-Tagged ProteinPurification Kits - High Speci ficity●8X LEW Buffer (Lysis-Equilibrium-Wash Buffer):(室温保存)pH:8.0NaH2PO4.2H2O 6.2404g(400mM)NaCl 14.0256g(2.4M)dH20定容到100 mL (调节pH:8.0)●4X Elution Buffer:(室温保存)pH:8.0NaH2PO4.2H2O 3.1202 g(200mM)NaC l7.0128g(1.2M)咪唑6.81 g(1M)dH20定容到100 mL(调节pH:8.0)●EDTA:(100mM)EDTA 2.923 gdH20 定容到100 mL●NiSO4:NiSO4 .6H2O2.6285g(100mM)dH20 定容到100 mL●溶菌酶:(使用时1ml溶液加入20ul)粉末 50mgddH20 1mL(四)利用His-tag从细胞中富集蛋白配方●磷酸钠缓冲液按图示比例混合0.2 M Na2HPO4溶液和0.2 MNaH2PO4溶液,得到两种缓冲液,pH分别调节成为8.0和6.3.pH 0.2 M Na2HPO4体积/mL 0.2 MNaH2PO4体积/mL6.3 11.25 38.758.0 47.35 2.65●细胞裂解液(最好新鲜配制,当天使用)Celllysis buffer终浓度配10ml配15ml 配20ml 配40ml 配30ml盐酸胍(g) 6M 5.7318 8.5977 11.463622.927217.1954Tris(g) 10 mM 0.0121140.018171 0.024228 0.048456 0.036342pH 8.0buffer(ml) 100 mM 5 7.5 10 20 15 (注意胍盐是有害试剂注意这里用的磷酸钠缓冲液pH必须8.0!)(注意二价阳离子螯合剂,还原剂,会导致镍从树脂上的洗脱)本实验的所有试剂中EDTA浓度不得超过1 mM,DTT浓度不超过5 mM,巯基乙醇浓度不超过20 mM。

●pH8.0的洗脱溶液(最好新鲜配制,当天使用)pH 8.0的washbuffer 终浓度配100ml 配50ml配20ml 配40ml 配30mlUrea尿素(g)8M48.04824.0249.6096 19.219214.4144Tris(g) 10 mM 0.12114 0.06057 0.0242280.048456 0.036342pH8.0Na3PO4buffer(ml)100 mM 50 25 10 20 15Triton X-100(ul) 0.1%(vol/vol)100 50 2040 30b-mercaptoethanol.巯基乙醇(ul)5 mM 35 17.5714 10.5●pH 6.3 wash buffer (现配现用)pH6.3的washbuffer 终浓度100ml 配50ml 配30ml pH6.3的washbufferUrea尿素(g)8M48.048 24.024 14.4144Urea尿素(g)Tris(g) 10 mM 0.12114 0.060570.036342 Tris(g)pH6.3Na3PO4buffer(ml)100mM50 2515pH6.3Na3PO4buffer(ml)TritonX-100(ul)0.1%(vol/vol)100 50 30 Triton X-100(ul)注意使用pH为6.3的磷酸缓冲液,而且pH不得低于6,pH要精确配制,非常重要!Histidine 的质子化,会导致镍树脂上的解离,所以要精确测定pH,并且以pH试纸校对,而不是仅仅依靠pH仪器。

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