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文档之家› 文献检索 第四课 Pubmed
文献检索 第四课 Pubmed
外文信息资源检索-PUBMED
温州医科大学图书馆
林薇
Contents
初识PubMed PubMed基本检索 PubMed高级检索 PubMed主题词检索 PubMed期刊检索 PubMed检索结果处理
初识 PubMed
标引质量高
更新速度快 使用方便
信息量大
选择PubMed的n个理由
/pubmed
Pubmed基本检索
一、Pubmed检索系统
(三)Pubmed基本检索 基本检索
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
1.
逻辑运算符: AND OR NOT
AND diabetes therapy NOT nifedipine
将检索出同时包含阿司匹林和糖尿病两个检索词的文献。
/美国国立卫生研究院
/美国国立医学图书馆
/国家生物技术信息中心
Entrez资源整合系统
NCBI资源整合系统,基于Web界面的综合生物信 息数据库,可实现跨库检索,包括
GenBank和Nucletide (2) Genoma (3) OMIM (4) Protein (5) Structure (6) Pubmed (7) PMC
(1)
初识Pubmed
一、Pubmed检索系统
(一)Pubmed收藏范围:
(1)
(P46)
Medline:标注为[Pubmed-indexed for Medline] (2) OldMedline:标注为[Pubmed-OldMedline] (3) In Progress Citations:标注为[Pubmed-in Process] (4) Publisher Supplied Citation:标注为[Pubmed-as supplied by Publisher]
Subheadings
款目词
树状词表
检索
检索结果
Pubmed主题词检索
举例
2. 主题数据库(Mesh Database)检索:艾滋病(AIDS )预防和控制(Prevention and Control)(习题4)
Pubmed期刊检索
期刊数据库检索
通过输入刊名、缩写名、ISSN等,浏览期刊文献 提供电子原文的超链键 两个方面
Pubmed高级检索
1. 检索构建器 search builder 2. 检索历史
Pubmed高级检索
高级检索
Advanced Search
高级检索习题
1. 检索作者姓为Black,且标题中有Hypertension 的文献(习题3) 2. 检索题目或摘要中有中医Chinese Traditional Medicine 和药理学pharmacology 的中文文献
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
5.著者检索
姓前名后,姓用全称,名用首字母。全称。缩写。
Smith SR
6.字段限定检索
[ ] P47不同字段
作者[AU] 语种[LA ]
7.期刊检索
基本检索习题
习题1: 基本检索:肺癌和吸烟关系的文献 lung cancer, smoke ,smoking, smoked(用截词符*)
检索该期刊被Pubmed收录的文献 检索该期刊的信息 举例:the new england journal of medicine
Pubmed期刊检索
期刊数据库
期刊检索习题
习题5:期刊数据库(Journals Database)检索: PubMed 中收录关于视力测定(Optometry)的期刊有哪些?
NIH、NLM、NCBI与pubmed
– NIH(National Institute of Health):美国 国立卫生研究院 – NLM(Natioanl Library of Medicine):美国 国立医学图书馆 – NCBI(National Center for Biotechnology Information) :美国生物技术信息中心
习题6:找出肾性高血压(renal hypertension)的主题词, 以及其上位主题词和下位主题词。
第二节 Pubmed与NCBI
三、其他工具和链接
(一)My
1.
NCBI个性化功能
保存检索策略及E-mail发送功能 2. 保存检索结果 3. 过滤检索结果
(二)Linkout:全文链接 (三)批量引文匹配器 (四)临床试验数据库
由丁香园创建,基于Pubmed数据。
高级搜索
图库搜索
The end
See you next time!
"diabetes mellitus"[MeSH Terms] OR ("diabetes"[All Fields] AND "mellitus"[All Fields]) OR "diabetes mellitus"[All Fields] VS diabetes
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
摘自上海交通大学-生命医药学科博客: /lam/article.asp?id=269
GoPummed
PMCቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
PubMed Central:免费全文数据库
Pubmed Central
/pmc/
Pubmed与Gopubmed
Gopubmed知识挖掘分析工具
Gopubmed概述 2. Gopubmed的分类统计功能
1.
(1) 主题分布 (2) 作者分布 (3) 文献来源分布 (4) 年度分布
3.
Gopubmed与SCI信息分析功能比较
Gopubmed是一种Pubmed检索工具,是对于 Pubmed资源的另一种组合检索方式,它比 Pubmed的优点集中在于对于某一方面的研究我 们能够直观得知研究时间、研究者、地域、研 究过程、研究动态和各种信息之间的相关性
如:aspirin
如:hypertension
将检索关于高血压治疗但不含硝苯地平的文献
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
2.词语自动转换:自然语言转换
Mesh转换表、刊名转换表、短语表、著者索引 对常用医学名词进行自动在MeSH转换表 、刊名转换表、 短语表、著者索引及所有记录字段中转换匹配。 如: diabetes mellitus (糖尿病) 转换为
Pubmed检索结果
检索结果的显示、评价、分析与管理 1. 结果显示: 2. 检索结果的保存及输出 3. 检索结果的记录显示 4. 检索结果的限定和过滤
检索结果
显示方式
保存方式
详细显示
结果限定
作业习题
习题2:检索2007年以来2岁(即出生至23个月)小儿哮喘 的综述文献(asthma)
Pubmed主题词检索
二、Pubmed检索系统
(四)Pubmed主题词检索
主题词概念与优势:统一概念,可扩展 检索方法
例:欲查肾衰竭(renal failure)饮食疗法(diet therapy) 的相关 文献?
Mesh Search
Pubmed主题词检索
举例
1.
欲查肾衰竭(renal failure)饮食疗法(diet therapy) 的 相关文献? 注意:主题检索优缺点
3.截词检索功能
截词符:”*”作为通配符进行截词检索。 例如:bacter* (系统会找到前一部分是bacter的单词, 如: bacteria、bacterium等) 用双引号来强制系统进行短语检索。 例如:“oxygen free radicals” (不再自动转换匹配和 扩展检 索)
4.短语精确检索