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PubMed文献检索

• 但是,在日常检索实践中,我们经常发现检索的结果 为零而事实上已有这方面的报道,或者检索出来的文 章并不是我们所需要的,这就需要调整检索策略,以 防止漏检或误检。即我们通常所说的提高查全率和查 准率
检索方法的制定
• 了解检索系统的特征和功能,熟悉数据库的标引规则 、词表结构,掌握必要的检索技能和技巧,了解所检 课题的专业知识。
• 进行主题检索时,系统还会自动显示与该词相关的副主题词供 选择副主题词是对主题词的进一步限定,用来检索更为专指的 文献。M中共有82个副主题词,每个副主题词有特定的含义和 使用范围,分别与不同主题词组配,其个数因主题词的不同而 变化。
• 例如:胰腺癌的治疗 • 在用主题词进行检索时,副主题可自动跳出“drug therapy,
• 主题词:取自于主题词表、叙词表、分类词表等,是经过 规范化的。
• 自由词:取自于文献篇名、文摘、正文,是没有规范化的 自然语言。
• 选择合适的检索词,将检索词进行合理的组配,才能得到 满意的结果。
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自由词检索
• 自由词即我们通常所说的关键词,是未经规范化的术 语。在进行自由词检索时系统会将在任何字段中出现 的该单词自动检出,而文献内容不一定关于该主题。
• PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接, 来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。
• PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务 ,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质 序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
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PubMed
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检索域标签
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检索策略
• 从 PubMed的自由词检索、主题检索两种方式不难看 出,用Mesh Browser进行主题检索,准确、规范, 检索效率高。显然,主题检索是文献检索首选CLC
NbiSpCoLlaCr
NSCLC
„gemcitabine AND NSCLC‟ 1,607
„gemcitabine OR NSCLC‟ 30,744
„gemcitabine NOT NSCLC‟ 5,323
检索词
• 检索词:是检索要求中的基本单元 • 检索词可分为两种:主题词、自由词。
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谢谢!
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• 检索需求的概念分析要正确、全面,把待检课题的主 题内容转换成检索系统采用的检索标识和检索词,并 准备若干自由词备用。
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• 首选主题词检索,以提高检索效率
• 通过标引,主题词包含了它的同义词、近义词,用主题词检索, 保证了查全率;主题词可以与副主题词组配,对该主题词下的文 献进行进一步的限定,确保了查准率。
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PubMed — 文献检索
PubMed (/PubMed)
• PubMed 是由美国国立医学图书馆(NLM)的国家生物技 术信息中心(NCBI)开发的基于网络的检索系统。它是 NCBI的宏大的检索系统Entrez的一部分。
• PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他 相关数据库接入服务。
• 其次才选自由词;当没有合适的主题词时,也应考虑 用自由词检索。
• 要注意自由词的不同表达形式:近义词、同义词、缩写、全称等 ,以防漏检。
提高查全率的主要方法及存在问题
• 遗漏下位词,造成漏检 • 对副主题词的适用范围不够了解,造成漏检。 • 自由词检索时,未使用同义词,造成漏检
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diet therapy, surgery, therapy”你可以根据你需要选择相应的 副主题词来进行限定。
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Eli Lilly and Company
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Eli Lilly and Company
• 文献量达1千1百万条记录,并回溯到1966年。
• [indexed for MEDLIEN]
文献标题
作者 期刊缩写
出版时间
卷/期 页码
无摘要
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• In process citation(PreMEDLINE) • 提供MEDLINE尚未经规范处理的数据。 • 获MeSH词后,再加入MEDLINE。 • 记录中[in process]的标记。语言
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辅助检索
• 辅助检索有以下几个功能键,即Limits、 Preview/Index、 History 、Clipboard 4个按钮,其 中以 Limits最为常用。
• 相当于高级检索,可对年龄、性别、人或动物、语种 、文献类型、出版年份、子集数据库的限定。
• 检索词的转换 • 在检索词方面,使用者所输入的检索词都将自动被转换对映至
MeSH,但系统会同时以MeSH及All Fields方式进行检索,例 如检索 vitamin h,系统将以Biotin[MeSH] OR “biotin”[All Fields] OR “vitamin h”[All Fields]进行检索。 • 如果需要找词条,可在词条间加入引号,如:“single cell ”。 • 在期刊名方面,使用者输入刊名全称、缩写或是ISSN号码时, 系统将对映至刊名检索,例如输入:new England journal of medicine,将被转换成"N Engl J Med"[Journal] OR "new england journal of medicine"[All Fields]
主题词检索(MeSH)
• 该检索方式能指引检索者实用规范的术语进行有效检索。每个 M词对应一个概念,即用主题词可检出同一主题的不同词形, 拼写,单复数和缩写。例:liver cancer 在进行主题词检索时 ,会将所有关于肿瘤的表达方式检出。“liver neoplasms, liver tumor , liver carcinoma‟
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相关文献
检索建议
标题符合
免费全文
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检索策略
Eli Lilly and Company
Eli Lilly and Company
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免费全文
• Publisher Supplied Citations 出版商直接向PubMed提供电子记录 包括MEDLINE未收录的部分记录
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布尔逻辑运算符 - Boolean Operators
• AND OR NOT
gemcitabine
goelmanczitaapbininee
提高查准率的主要方法及问题
• 提高检索词的专指度,选专指度较强的规范词或自由 词。
• 增加AND连接,进一步限定主题概念。 • 把主题词限定在主要字段,如标题字段、主题词字段
等 • 缩短检索年限,或限定某些刊物。
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• 切截 • 如英美文字的拼法或是词尾的变化而需要模糊查询时
,可使用*作为切截符号,如:flavor*,可找到以 flavor开头的字,如:flavored、flavorful……,最 多可显示150个以此字开头的资料。但是*是以单字词 为主要使用对象,如查询:infection*可以找到 infections,但无法找到 infection control。
• 数据类型:期刊论文、综述、以及与其他数据资 源链接。
• 特点: 1.免费提供题录和文摘 2.可与提供原文的网址链接
(部分免费获取) 3.提供检索词自动转换匹配 4.操作简便、快捷
数据收录
• MEDLINE
• 4300余种生物医学期刊,内容涉及医学、护理、牙 科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科。这些 期刊来源于美国和世界上70多个国家和地区。
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