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实时荧光定量PCR技术详解和总结
实时定量PCR技术
目录 • 实时定量PCR基本原理
• 实时定量PCR实验材料
• 实时定量PCR实验方法
• 实时定量PCR实验结果
实时定量PCR基本原理
1 实时定量PCR的定义 2 实时定量PCR标准曲线
实时定量PCR的定义 • 定量PCR技术:利用荧光信号的变化实时检测PCR 扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,最终精 确的对起始模板的定量分析
整理方程式得:
log X0= (- log(1+Ex) )×n+ log Xn
• 将C(t)和达到C(t)值时终产物的量Xc(t)带入上式得:
log X0= (- log(1+Ex) ) ×C(t)+ log Xc(t)
初始浓度的对数与循环数呈线性关系
实时定量PCR标准曲线
• 初始模板量越多,C(t)值越小 C(t)与初始模板浓度的对数值成线性关系
106 105
104
103 102 10
荧光强度---循环数曲线
初始模板量对数---C(T)循环数标准曲线
定量原理
• 浓度的对数值与循环数呈 线性关系,根据样品扩增 达到域值的循环数(Ct值) 就可分析样品中起始模板 量定量PCR的实验步骤来自1 标准菌株DNA的提取
2 3 4 5 6 7 QPCR探针和引物的设计 阳性克隆质粒的构建 荧光定量PCR反应 定量标准曲线 重复性实验 灵敏性实验
定量PCR三个基本概念
• 扩增曲线
平台期 背景期 指数增 长期 线性增长期
阈值与C(t)值
• 阈值:是循环开始3~15个循环的荧光信号的标准偏差的 10倍,设定在扩增曲线指数增长期 • C(t)值:荧光信号(扩增产物)到达阈值时所经过的扩增 循环次数
C(t) value
Threshold line
18.12 +/- 0.04
C(t) value
定量PCR的数学原理
• 理想的PCR反应: Xn=X0×2n • 非理想的PCR反应: Xn=X0(1+Ex)n n:扩增反应的循环次数 Xn:第n次循环后的产物量 X0:初始模板量 Ex:扩增效率
方程式两边同时取对数得:
log Xn=log (X0 (1+Ex)n)
实验材料