当前位置:文档之家› 七章节数量遗传学基础

七章节数量遗传学基础

以个体分组,以个体的各次度量值为组内观 察值,采用单因素方差分析法,所得的组内 相关系数即是重复力。
2020/5/27
29
2020/5/27
30
例题
n ki
2
n SST
ki
X
2 ij
i 1
X ij j1
n
i1 j1
ki
23601 1449 2 2812 .8713 101
Py.x1
y.x1 2
x1
x1 y
第13张幻灯片
(
y
y ( x1
)(x1 x1
)2
x1
)
x1 y
(x1 x1) (x2 x2 ) (x1 x1)
2 x1
(x1 x1)2
x1 yБайду номын сангаас
(x1 x1)2
2 x1
x1
(x1 x1)2 x1 y y
2020/5/27
目的:变量之间 相互因果关系确定下来后,就 可以估计引起方差协方差来源(原因)的相对 大小。
2020/5/27
10
概念
两个变量间的关系:
因果关系: 单箭头线,方向由因到果,称为通径 线 平行关系:双箭头线,称为相关线
每条线的相对重要性称为系数
通径线的系数称为通径系数 相关线的系数称为相关系数
2020/5/27
EP,G
EP
1 n
n i 1
Esi
VPn
VPn
VG VEP
reVP
nre
VPn
1
(n n
1)re
VP
1 (n 1)re
2020/5/27
37
重复力的用途
多次度量育种值的估计
h2 pn
Cov( A, Pn ) VPn
VA VP
n 1 (n 1)re
nh2 1 (n 1)re
2020/5/27
2020/5/27
26
概念
度量次数一般不只2次,因此可以用组内 相关系数来度量。
个体间变异越大,个体内变异越小,说明重 复力越高
re
2 B
2 B
2 W
2020/5/27
27
概念
一般环境方差:指的是时间上持久的或者空间上 非局部的条件所造成的环境方差,它是个体方差 的一部分。
母畜泌乳量的高低对仔畜生长的影响
① 邻近通径必须以尾端与相关线相接 ② 一条通径链内至多只能有一条相关线 ③ 不同的通径链可以重复通过同一条相关线
4. 在追溯两个结果的通径链时要避免重复和 遗漏。
2020/5/27
24
第三节 重复力
2020/5/27
25
概念
重复力指的是家畜个体由一性状多次度量值 之间相关程度的度量。
时间上:猪产仔数,奶牛的产奶量,绵羊的产 毛量,蛋鸡的产蛋数。 空间上:果蝇翅长,作物种子的蛋白质含量。
多基因性状:由许多基因相互作用控制的性 状,其表型变异为连续数量。
2020/5/27
3
Shull(1908)
玉米:纯系的变异比远交群小得多。利用今 天的遗传学解释:
普通玉米的基因型很复杂,自交可以产生纯合 基因型个体,因此,近交系的变异很低
2020/5/27
4
Nilsson-Ehle(1909)
i 1
ki
2 n ki
2
SSb
n i 1
X ij
j 1
ki
X ij
i1
j 1 n
ki
74 2 172 2
133 2 1449 2
621 .6633
5 10
8 101
i 1
SSW SST SSb 2812 .8713 621 .6633 2191 .2080
2020/5/27
遗传力是育种值对表型值的回归系数 遗传力是育种值和表型值的相关系数
2020/5/27
41
遗传力估计的原理和方法
遗传力估计的原理
rP hrAh h2rA
h2 rP rA
h2
rP ( MT ) rA( MT )
rP ( MT ) 1
rP(MT)
h2
rP(OP) rA(OP)
rP(OP) 0.5
bDM(S)=bYX(S)=SPXY(S)/SSX(S), h2=2 bDM(S)
2020/5/27
44
遗传力估计的原理和方法
二、半同胞相关 组内相关系数:单因素方差分析;系统 分组 注意当各组半同胞数量不同时的计算
rHS
CovHS Pi , Pj V V Pi Pj
CovHS Ai Ri , Aj Rj VP
研究谷类作物
F2 1. 多数性状符合3:1 2. 个别64:1,AaBbCc, (1/2)6=1/64 结论: 1. 有性繁殖可以产生大量的基因型。10个座位可
以产生31060,000种基因型 2. 新的类型不是新的突变,而是由于稀少基因分
离造成的(返祖)。
2020/5/27
5
Johannsen 和 Payne
38
第四节 遗传力
2020/5/27
39
概念
广义遗传力:H2 = VG/VP 狭义遗传力:h2 = VA/VP 实现遗传力:
子代平均值
hR2
R S
PO PP
P P
全群平均值 种畜平均值
2020/5/27
40
概念:遗传力的几种表述
遗传力是育种值对表型值的决定系数
h2 = dP.A = VA/VP
2020/5/27
20
通径系数的性质(三)
共同原因
ry1y2 = P2 P2(左) ry1y2 = rx2x3 P2 P3(中) ry1y2 = P2 P 2 + P3 P 3(右)
2020/5/27
21
通径系数的性质(四)
ryx1 = P1 + r12 P2 + r13 P3 dy.x1 + dy.x2 + dy.x3 = 1
2020/5/27
7
数量性状表型值的剖分
P=G+E,E=0
P=A+D+I+E
R=D+I+E,P=A+R
P G PA
2020/5/27
8
第二节 通径分析
Path Analysis Wright(1921)
2020/5/27
9
通径分析
利用两者之间的原因,分析两种变量相互关 系的方法。
起初只是应用于分析影响小型哺乳动物骨骼变 异的一般因素和特定生长因子。后来推广到许 多方面:遗传学,农业经济学,生理学,生态 学等。动物育种主要用来估计相关程度和计算 近交系数。
2020/5/27
34
重复力的用途
1. 判断遗传力估计是否正确
重复力为遗传力的上限
2. 确定需要重复度量的次数
Vp VG VEg VEs reVP VG VEg
VEs 1 re VP
Vp(n)
VG
VEg
VEs n
Vp(n)
1 (n
1) re n
VP
2020/5/27
35
重复力的用途
小梅山母猪产仔数方差分析表
变异来源
自由度
平方和
均方
期望均方
母猪间 母猪内
12
621.6633
51.8053
ˆW2
7.7112
ˆ
2 b
88
2191.2080 24.9001
ˆW2
总和
101 2812.7813
2020/5/27
33
例题
re
MSb MSW
MSb k0 1MSW
51.8053 24.9001
第七章 数量遗传学基础
2020/5/27
1
第一节 数量性状的遗传特征
2020/5/27
2
动物性状的分类
质量性状:可心明确区分为若干类 。如毛色, 角的有无
数量性状:变异是连续的,无法用形容词描 述,只能通过度量。如产奶量,生长速度, 体重,羊毛的粗细等。
多基因:控制某个数量性状一组基因的一个 基因。
15
通径系数的性质(一)
ry.x1
( y y)(x1 x1)
y x1
(x1 x1)2 x1
y x1
y
2020/5/27
16
通径系数的性质(一)
根据方差剖分原理:
2 y
2 x1
2 x2
1
2 x1
2 x2
2 y
2 y
2020/5/27
17
通径系数的性质(二)
性质二(间接原因)
CovHS Ai , Aj rHSVA 1 h2
VP
VP 4
2020/5/27
45
遗传力估计的原理和方法
rHS
2 S
2 S
2 W
51.8053 7.7112 1 24
.9001
0.1229
Vre
21 re 21 k0 1re
n 1k0k0 1
2
2 1 0.122921 7.71121 0.12292
131 7.7112 7.71121
8.2501103
t
re
V re
0.1229 1.3531 8.2501103
t0.05(12) 2.179
特殊环境方差:暂时的或者局部条件所造成的环 境方差,也就是个体内度量间的方差。
某一年草地的好坏对羊毛生长的影响
VE = VEg + VEs, VB = VG + VEg, VW = VEs
相关主题