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生物学分子生物学实验

夜后,用DEPC水洗净备用。
1.5移液枪的正确使用 1. 选择合适量程; 2. 对应合适枪头; 3. 吸液后轻放以避免将液体吸入到枪体内; 4. 用完后调回最大量程。
1.6安全注意事项 DEPC:焦碳酸二乙酯,是强的蛋白变性剂和致癌物。开瓶
时要使瓶子尽可能远离操作者,因为内部的压力可能导致飞 溅。操作中应戴上手套,并在通风厨中进行;
提取步骤: 破碎组织→分离RNA→沉淀RNA→洗涤RNA→融解RNA→保存RNA。
所有RNA的提取过程中都有五个关键点,即: ① 样品细胞或组织的有效破碎; ② 有效地使核蛋白复合体变性; ③ 对内源RNA酶的有效抑制; ④ 有效地将RNA从DNA和蛋白混合物中分离; ⑤ 对于多糖含量高的样品还牵涉到多糖杂质的有效除去。 但其中最关键的是抑制RNA酶活性。RNA的提取目前阶段主要可
采用两种途径:1、提取总核酸,再用氯化锂将RNA沉淀出来; 2、直接在酸性条件下抽提,酸性下DNA与蛋白质进入有机相 而RNA留在水相。
2、总RNA提取的方法
(1)(异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法)
• TRIZOL试剂中的主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,其中异硫氰 酸胍可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离, 并将RNA释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚, 而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机 层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离开。水相 层(无色)主要为RNA,有机层(黄色)主要为DNA和蛋白质。
RNA提取注意事项:为防RNA降解,带手套、口罩,少说话; 试剂均为有机挥发试剂,有毒,需在通风厨操作,屏息,若不 小心沾到试剂立即用自来水冲洗
(二)琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳是重组DNA研究中常用的技术,可用于分离,鉴 定和纯化DNA片段。不同大小、不同形状和不同构象的DNA分 子在相同的电泳条件下(如凝胶浓度、电流、电压、缓冲液 等),有不同的迁移率,所以可通过电泳使其分离。凝胶中 的DNA可与荧光染料溴化乙锭(EB)结合,在紫外灯下可看到 荧光条带,籍此可分析实验结果。
分子生物学实验
2010-2011第二学期
目的:掌握分子生物学基本技术,主要包括 RNA提取、反转录、PCபைடு நூலகம்、电泳等
内容:罗非鱼18S基因的cDNA克隆 ①总RNA提取 ②电泳检测 ③cDNA合成 ④PCR扩增 ⑤PCR产物的分离、回收和纯化
时间安排: 5月24日 实验准备一:1.3去除RNA酶的实验用品处理 5月25日 实验准备二:灭菌干燥离心管、枪头 5月26日 总RNA提取和电泳检测 5月27日 cDNA合成和PCR扩增 5月28日 PCR产物回收和纯化
③ 室温,12,000×g离心3分钟,将上清液移至干净的1.5 ml离心管中,加入相同体积溶液B,颠倒混匀。
④ 将溶液置于离心柱中,静置2分钟,≥8000rpm 离心30S,若一次加不完,可分两次离心。
⑤ 用通用洗柱液洗两次。 ⑥ 短暂干甩后,用RNA洗脱液洗柱,室温离心干
燥30S ,溶解总RNA。 ⑦ 0.8%琼脂糖凝胶电泳检测RNA的质量。
要求: 1、分组实验,以小组为单位进行考核,即以各小
组实际的实验结果进行评分,不另外安排考试。 2、实验结果主要包括:总RNA电泳图、PCR电泳
图,每小组交一份实验报告,实验报告需对实验 结果进行分析讨论。
1 材料 1.1 实验鱼
罗非鱼购自农贸市场,碎冰速冻麻醉后分离垂体、肝脏 组织,立即置于TRIZOL试剂,或置于-60℃超低温冰箱 保存。
1.2 试 剂 1. 柱式动物RNAout(总RNA 提取试剂盒)
2. RevertAid TM H Minus First Strand cDNA Synthesis Kit (反转录试剂盒)
3. ExTaq PCR kit(PCR反应试剂盒) 4. E.Z.N.A Gel Extraction Kit(胶回收试剂盒)
(二)mRNA的提取
mRNA的分离方法较多,其中以寡聚(dT)-纤维素柱层析法最为 有效,已成为常规方法。此法利用mRNA 3’末端含有Poly( A+)的特点,在RNA流经寡聚(dT)纤维素柱时,在高盐缓冲 液的作用下,mRNA被特异地结合在柱上,当逐渐降低盐的浓 度时或在低盐溶液和蒸馏水的情况下,mRNA被洗脱,经过两 次寡聚(dT)纤维柱后,即可得到较高纯度的mRNA。
有机溶剂:RNA提取试剂为有机挥发试剂(硫氰酸胍-苯酚、 氯仿、异丙醇),均有毒,需在通风厨操作或屏息操作,少 讲话,以免将有毒气体吸入体内。若试剂不小心沾到皮肤上, 请立即用自来水冲洗;
EB:溴化乙锭,是诱变剂,具有高致癌性,配制使用时,应 戴乳胶手套,并且不要将该染色液洒在桌面或地面上,凡是 接触过EB的器皿或物品,必须经特殊处理后,再进行清洗或 弃去。
5. 100bp DNA Ladder
1.3 去除RNA酶的实验用品处理 ① DEPC水:每1L双蒸水中加入1mL DEPC,终浓度为0.1%,
于室温搅拌过夜,高压灭菌。 ② 金属解剖器具和玻璃器皿经180℃烘烤5小时,以灭活
RNA酶。 ③ 塑料离心管、枪头及枪头盒等塑料用品均用DEPC水浸
泡过夜后,高压灭菌烘干后使用。 ④ 琼脂糖凝胶电泳槽、制胶模具用3%的过氧化氢浸泡过
实验相关知识及操作方法
1. RNA提取 2. 琼脂糖凝胶电泳 3. PCR及反转录
二、RNA提取的基本原理与方法
(一)总RNA提取的基本原理与方法 1、原理
通过变性剂破碎细胞或者组织,然后经过氯仿等有机溶剂抽提 RNA,再经过沉淀,洗涤,晾干,最后溶解。但是由于RNA酶 无处不在,随时可能将RNA降解,所以实验中有很多地方需要 注意,稍有疏忽就会前功尽弃。
总RNA提取(柱式动物RNAout) ① 从低温冰箱(–80℃)中取出肝脏样品,剪取小块(约为
50-100mg)后加入1 ml的溶液A,用1ml一次性塑料注射 器抽打匀浆。
② 匀浆液室温放置(15℃–30℃)1分钟以便细胞充分裂解, 每1 ml 溶液A加入0.2 ml的氯仿,用力振荡30秒后,室 温放置1分钟以便溶液分层,总RNA存在于上层水相中。
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