酶改性基本理论
蛋白类酶的分类原则
氧化还原酶(oxidoreductases) 转移酶(transferases) 水解酶(hydrolases) 裂合酶(lyases) 异构酶(isomerases) 连接酶(ligases)或合成酶(synthetases)
★★ 国际系统分类法及编号(EC编号)
Sidney Altman Yale University New
Haven, CT, USA
Cech和Altman各自独立地发现了RNA 的催化活性,并命名这一类酶为 ribozyme(核酶),2人共同获1989年 诺贝尔化学奖。
具有催化作用的 一类蛋白质 ——蛋白质酶类
有自剪切或催 化功能的核酸
※Koshland将酶分子的氨基酸残基分为四类: (1)接触残基:它们与底物接触、参与底物的 化学转变。此类氨基酸残基的一个或几个原 子与底物分子中一个或几个原子的距离都在 一个键距离 (1.5~2埃)之内。它们的侧链,起 与底物结合作用的称为结合基团;起催化作 用的称为催化基团。有时结合基团也参与催 化作用,不能绝对区分。这些残基中的一些 有时可能也起辅助残基的作用。
(4)非贡献残基: 除了上述三类酶的必需基团外,酶分 子上其余的氨基酸残基都可称为非贡献残基或非必需 基团。它们对酶活性显示不起作用,可以由其它氨基 酸残基代替,且在酶分子中占很大比例。
例如,木瓜蛋白酶的三分之二的氨基酸残基是非贡献
残基。当然,它们也可能在免疫、酶活性调节、运输
转移、防止降解、种系发育的物种专一性等方面起作
活性中心以外 的必需基团
结合基团
底物 催化基团 活性中心
酶活性中心示意图
S-S
底物
肽链
活性中心外 必需基团
结合基团
活 性
中
心
必
催化基团
需 基
团
活性中心
1.接触残基
( R1、R2、R6、R8、R9、 R163、R164,R165)
2.辅助残基
( R4 )
3.结构残基
(Rl0、R162,R169 )
锌离子(Zn2+):是各种金属蛋白酶的辅助因 子。
铁离子(Fe2+)、铜离子(Cu2+)、锰离子 (Mn2+)、钙离子(Ca2+)。
(二)有机辅助因子
烟酰胺核苷酸(NAD+和NADP+) 黄素核苷酸(FMN和FAD) 铁卟啉 辅酶Q 辅酶A 生物素等等
4、酶的活性中心
核酸类酶(R-酶)的基本组成单 位——核苷酸
从酶的组成来看,有些酶仅由蛋白 质或核糖核酸组成——单成分酶;
有些酶除了蛋白质或核糖核酸以外, 还需要有其他非生物大分子(辅助 因子)成分——双成分酶。
全酶=酶蛋白(或酶核糖核酸) + 辅助因子
全酶的结构与分子组成
(一)无机辅助因子
镁离子(Mg2+):多种酶的辅助因子,在酶的 催化中起重要作用。eg:柠檬酸裂合酶、异 柠檬酸脱氢酶。
4.非贡献残基
(R3、R5、R7 )
酶分子中各种残基的作用
第二节 酶的分类和命名
酶的分类
按化学组成不同,酶可以分为两大类 别。
主要由蛋白质组成的酶称为蛋白类酶 (P酶);
而主要由核糖核酸组成的酶称为核酸 类酶(R酶)。
(一)蛋白类酶的分类与命名
习惯命名法
1.依据底物来命名(绝大多数酶): 淀粉酶、脂肪酶、蛋白酶
(2)辅助残基:它们不与底物接触,而是在使 酶与底物结合及协助接触残基发挥作用方面起 作用。
上述两类残基构成酶的活性中心。
(3)结构残基:它们在维持酶分子正常三维构 象方面起重要作用。它们与酶活性相关,但不 在酶活性中心范围之内,属于酶活性中心外的 必需基团。
上述三类残基统称为酶的必需基团,若被其 它氨基酸残基取代,往往造成酶失活。
2.依据催化反应的性质命名: 水解酶、转氨酶
3.结合上述两个原则命名:琥珀酸脱氢酶。 4.有时加上酶的来源
胃蛋白酶、牛胰凝乳蛋白酶
缺点:一酶多名,写出反应难等。
国际系统命名法(1961年,国际酶 学委员会)
底物+反应性质(类型)+酶
例子:乙醇脱氢酶(推荐名)
乙醇:NAD+氧化还原酶(系统名)
乙醇+NAD+ 乙醛+NADH+H+ (反应)
1982年美国Cech等人发现四膜虫的rRNA前体能在完全没 有蛋白质的情况下进行自我加工,发现RNA有催化活性.
Thomas Cech University of Colorado at Boulder, USA
1983年美国S.Altman等研究核糖核酸酶P-RNaseP (由20%蛋白质和80%的RNA组成),发现RNaseP中 的RNA具有核糖核酸酶P的催化活性,而蛋白质部 分确没有。
用。
结合基团
酶蛋白
活性中心
必需基团
活性中心外
非必需基团 非贡献残基
接触残基
辅助残基 结构残基
催化基催 化 基团;
* 色氨酸62和63、 天 冬 氨 酸 101 和 色 氨 酸 108 是 结 合基团;
* A~F 为 底 物 多 糖链的糖基,位 于酶的活性中心 形成的裂隙中。
(一)酶活性中心的概念
酶分子上只有少数氨基酸残基与催化活性直接相 关,这些氨基酸残基集中的、与酶活性相关的区 域称作酶的活性中心,亦称作活性部位。这些氨 基酸残基往往分散在相距较远的氨基酸顺序中, 有的甚至分散在不同的肽链上。
枯草杆菌蛋白酶: Ser221 ,His64;
胰凝乳蛋白酶:Ile16,His57,Asp102,Lys194,Ser195
———核酶
Sumher&Northrop纯化得到脲 酶结晶而荣获1946诺贝尔奖
绝大多数的酶属于此类酶。
1982年
四膜虫的26SrRNA均能自我剪接 形成成熟的rRNA。
Cech&Altman获 1989诺贝尔奖
核酶的发现,是对酶概念的重要发展。
2.酶的化学组成
蛋白类酶(p-酶)的基本组成单位 ——氨基酸
第二章 酶学基础
第一节 酶的化学本质
1.酶大多数是蛋白质
酶经酸水解的产物是氨基酸; 凡能使蛋白质变性的因素也能使酶变
性; 酶存在两性解离和等电点的性质; 和蛋白质一样不能透过半透膜;
胰凝乳蛋白酶
溶菌酶
少部分酶是核糖核酸
1982年,Cech和Altman 等人发现RNA 具有生物催化活性。