2011092010017生物信息学第三次上机作业
小鼠基因序列:
AA TTTGCTGAGTACAACAGCGACCGTCATCAGTTTTTTGAGTTTCTGTACAACCAGGG AA TTGGAACCAAGTCA TCA TA TATA TACATGTCCTGGGCAGGGCATCTGGAAGCCCAGG GAGAGCTGCAGCA TGCCAGTGCT
.1. 这个基因在小鼠中是哪个基因?budding uninhibited by benzimidazoles 1 homolog (S. cerevisiae).
基因的标识符是什么?Locus tag:RP23-189N15.7
这个基因的在基因组上的定位是怎样的?Chromosome 2
这个基因标码的蛋白质是什么?protein_id="BAE25776.1"
2. 3.
4.
具有什么样的功能?
ATP选择性和非共价相互作用,5’-腺苷三磷酸的一个重要的辅酶和酶活性的调节。
反应的催化A TP +蛋白丝氨酸= ADP +蛋白磷酸丝氨酸,苏氨酸蛋白和A TP + ADP + =蛋白苏氨酸磷酸。
细胞亚定位在何处?
这个基因是一个酶吗,什么酶?
ATP选择性和非共价相互作用,5’-腺苷三磷酸的一个重要的辅酶和酶活性的调节。
具有什么样的功能结构域?
3.编码的蛋白质有3级结构的信息吗?如果有,给出在PDB中的标识符。
检索序列:
搜索蛋白质数据库。