-10区：较保守，为TATAAT，称为TATA box，又叫Pribnow框， 为RNA Pol牢固结合的位点，简称结合位点。 -35区：大部分启动子为TTGACA序列，为RNA Pol的σ亚基识别 位点，又称Sextama框。RNA Pol全酶可同时覆盖-35区和-10区， 长度为70bp。
共有序列 色氨酸操纵子 酪氨酸tRNA 乳糖操纵子 λPL NP9621（stx2eB）
第八章 RNA的转录及转录后的加工
以 DNA 为 模 板 合 成 RNA （ 核 糖 核 酸 ） 的 过程称为转录（transcription）。
RNA的合成和DNA的合成从核苷酸水平 上看，二者是很相似的，但生物学意义不同： DNA的合成仅是基因组的精确复制，并且固定 不变，RNA的合成涉及许多性状的遗传和表达， 并在多级水平有调控。
3、tRNA 运送氨基酸，成熟的tRNA为三叶草结构，富含稀 有碱基。
一、RNA聚合酶与启动子
1、RNA聚合酶 原核生物的RNA聚合酶只有一种，可催化三种RNA的合成。
E．coli RNA聚合酶由6个亚基组成，即α2ββ’ ωσ，
α、β、β’、σ四种亚基的分子量分别为36.5, 150,160,16KD,
-35 TTGACA TTGACA TTTACA GCGCAA TTGACA TGAACA
-10 TATAAT TTAACT TATGAT CATGAT GATACT TATATA
不保守的序列较多，多数只有3个碱基与共有序列 一样
共有序列之间相距17bp时的转录效率最高
Escherichia coli isolate NP9621 Shiga-like toxin IIe variant A B genes, complete AUTHORS Wang,J.F., Ran,X.Q. and Wu,Y.J.
单顺反子
多顺反子
SD序列 起始码
终止码
SD序列 起始码
终止码
AGGAGG ATG
TGA
AGGAGG ATG
TGA
弱化子
spacer
2、rRNA 参与核糖体组装，合成蛋白质之地。原核生物的 rRNA有3种：5S rRNA，16S rRNA，23S rRNA，分 别含有120，1541，2904个核苷酸。
source 1..1299
/organism="Escherichia coli“
/mol_type="genomic DNA“
/serotype="O121:HNT“
/isolate="NP9621"
/isolation_source="swine with edema disease“
/db_xref="taxon:562"
核心酶：与DNA具有很高的亲合 性，但不能识别启动子，它与 DNA的结合是随机的，只有与σ 因子结合形成全酶后才能启始 特定的RNA的合成。
2、启动子
起始RNA合成的一段DNA序列称启动子（Promotor），在启动子 序列中，有两个特殊的序列，以编码RNA的第一个DNA核苷酸定 为+1，在其上游-10bp和-35bp处， 有两个6个核苷酸组成的共 有序列（consensus sequence），为-10区和-35ote="SLT IIe subunit A; N-glycosidase; ribosome-inactivating protein“
/codon_start=1
/product="Shiga-like toxin IIe variant subunit A“
/protein_id="AAQ17546.1“
/db_xref="GI:33391900"
/translation="MKCILLKWILCLLLGFSSVSYSQEFTIDFSTQQSYVSSLNSIRTAISTPLEHISQGATSVSVINHTPPGSYISVGIRGLDVYQERFDHLR
LIIERNNLYVAGFVNTTTNTFYRFSDFAHISLPGVTTISMTTDSSYTTPQRVAALERSGMQVSRHSLVSSYLALMEFSGNTMTREASRAVLRFVTVTAEA
Structure of a transcription unit
DNA
+1
promoter
Transcribed
ATACG
TATGC
region terminator Antisense strand
RNA AUACG
Transcription
第一节、原核生物RNA及其合成
一、原核生物RNA的结构及种类 1、mRNA：原核生物mRNA的寿命较短，半衰期仅几分钟；
转录的共性
1、选择基因中的编码区转录 2、转录单位：启动子、转录区、终止子 3、DNA的2条链（正链、负链），
负链（即反义链、无义链）为转录的模板链， 正链（即有义链、编码链）序列与RNA完全一样 4、RNA合成的方向为5`-3`方向，与模板链反向互补；原 料为NTP 5、 RNA聚合酶，可从头合成RNA，没有反方向的外切 校对功能
全酶分子量为465KD， α、β、β’、σ分别 是rpoA，rpoB，rpoC， rpoD的产物。
α2ββ’ω形成的聚体称为核心酶（core enzyme）， σ（ Sigma因子）与核心酶结合不紧密。在同一个 原核生物中，核心酶相同，但σ因子不同，不同细 菌的σ因子也不同 σ因子作用：识别不同的启动子，转录出不同的RNA。
在mRNA的起始码AUG上游4-13 bp之前的一段嘌 呤序列AGGAGG，称Shine-Dalgarno序列，简称SD 序列，为mRNA与核糖体的结合位点。
有些mRNA前导区中含有一个调节区称弱化子 （attenuator），多顺反子mRNA分子还含有顺反 子间序列，称隔离序列、间隔区（spacer）。 原核生物mRNA的5`端和3`端没有特殊序列。
常在转录过程中就开始翻译。 mRNA的碱基序列从起始密码到终止密码以3个碱基为一
组读码，3个为一组的碱基称为密码子。每一密码子对应一 个氨基酸或一个终止信号。 对应一条多肽链的DNA片段加起始信号，终止信号称为顺反子 （Cistron） 只编码一条多肽链的mRNA称单顺反子mRNA，多见于真核 可编码几条多肽链的mRNA称多顺反子mRNA，所编码的蛋白常 常是一个代谢过程途径中的几种蛋白。多见于原核