第一章：绪论进化生物学Evolutionary Biology：是研究生物进化的科学，不仅研究进化的过程，更重要的是研究进化的原因、机制、速率和方向。

（研究生物进化的科学，包括进化的过程、证据、原因、规律、演说以及生物工程进化与地球的关系等。

）系统学Taxonomy：is the science of defining groups of biological organisms on the basis of shared characteristics and giving names to those groups.根据生物体显现出的的基本特征定义并确定其群体名称的学科。

系统生物学Systematic Biology：研究生物系统组成成分的构成与相互关系的结构、动态与发生，以系统论和实验、计算方法整合研究为特征的生物学。

系统与进化生物学Systematic and Evolutionary Biology：分类Classification：provide a convenient method of identification and communication.为生物的辨识与交流提供更便捷方法的学科。

系统发育Phylogeny：the evolutionary relationships among a group of species,provide a classification which as far as possible expresses the natural relationships of organism.研究种群之间进化的联系，尽可能地为解读生物体之间的自然关系提供一种分类方式的科学。

进化Evolution：detect evolution at work,discovering its processes and interpreting its results.（PPT）进化指食物由低级的、简单的形式向高级的、复杂的形式转变过程。

广义进化是指事物的变化与发展。

涵盖了天体的消长，生物的进化，以及人类的出现和社会的发展。

生物进化：生物进化就是生物在与其生存环境相互作用的过程中，其遗传系统随时间而发生一系列不可逆的改变，并导致相应的表型改变，在大多数情况下这种改变导致生物总体对其生存环境的相对适应。

生物进化论：生物进化论是研究生物界进化发展的规律以及如何运用这些规律的科学。

主要研究对象是生物界的系统发展，也包括某一物种或某一完整的生物类群的发展。

其重点是研究生物如何由简单向复杂，由低等向高等的发展过程。

生物进化论是进化生物学的重要基础。

中性突变：由Kimura在1968年提出。

中性突变是不影响蛋白质功能的突变，也就是既无利也无害的突变，如同工突变和同义突变。

化石：经过自然界的作用保存于地层中的古生物遗体、遗物和他们生活的遗迹。

从时间上看，必须是全新世（1万年）之前的地层中挖掘出的才可称之为化石。

内共生起源说：真核细胞的线粒体和质体来源于共生的真细菌，运动器来自共生的螺旋体类的真细菌，它们最早被原始的真核细胞吞噬进细胞内，与宿主进行长期的共生，而逐步演化为重要的细胞器。

根据这个学说，他们起源于内共生于真核生物细胞中的原核生物。

这种理论认为线粒体起源于好氧性细菌，而叶绿体起源于内共生的光合自营原核生物蓝细菌。

分子系统树：通过比较现在同一同源分子在不同生物间的差异以及其他信息来推断生物大分子的进化史，以此建立的系统树，称为分子系统树。

第二章：遗传变异及其来源变异：由遗传差异或环境因素引起的细胞间、生物个体间或同种生物各居群间的任何不同。

（个人觉得简答题很可能会考变异的不同分类模式）表型可塑性（phenotypic plasticity）：生物由于环境条件的改变在表型上作出相应变化（响应）的能力，是环境对基因型的一种修饰。

同一基因型在不同环境中会产生不同的表现型。

分为发育可塑性和环境可塑性。

染色体变异：在真核生物的体内，染色体是遗传物质DNA的载体。

当染色体的数目发生改变或者染色体的结构发生改变时，遗传信息就随之改变，带来的就是生物体的后代性状的改变，可分为：1.染色体数目的变异2.染色体大小的变异3.染色体结构的变异基因重组：指在生物体进行有性生殖的过程中，控制不同性状的基因重新组合。

同源染色体联会时，四分体中的非姐妹染色单体之间相对应的部位常常会发生交叉与互换。

基因突变：基因组DNA分子发生的突然的、可遗传的变异现象（gene mutation）。

从分子水平上看，基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。

复制滑移：滑移出现在亲代分子复制过程中，在一个子代分子的新合成聚核苷酸中添加了一个重复单位。

InDel：InDel(insertion-deletion)插入缺失标记，指的是两种亲本中在全基因组中的差异，相对另一个亲本而言，其中一个亲本的基因组中有一定数量的核苷酸插入或缺失。

根据基因组中插入缺失位点，设计一些扩增这些插入缺失位点的PCR引物，这就是InDel标记。

基因水平转移（Horizontal gene transfer）：是指在差异生物个体之间，或单个细胞内部细胞器之间所进行的遗传物质的交流。

遗传多样性：广义的遗传多样性是指地球上所有生物所携带的遗传信息的总和。

一般所指的遗传多样性是指种内的遗传多样性，即种内个体之间或一个群体内不同个体的遗传变异总和。

PCR：The polymerase chain reaction(PCR)is a technology in molecular biology used to amplify a single copy or a few copies of a piece of DNA across several orders of magnitude,generating thousands to millions of copies of a particular DNA sequence.第三章：遗传漂变和自然选择灾变论：法国学者居维叶于1821年提出。

与均变论相对立，此理论认为在地球历史上发生过多次巨大的灾变事件，每经一次灾变，原有生物被毁灭，新的则被创造出来(特创论)。

又称灾变说。

是一个地质学理论，认为地球曾经遭受许多短暂的灾难，其中有些是世界性的。

均变论：查尔斯·莱尔提出，论证了地球的变化以及地层形成是由可观察到的自然因素长期作用的结果，即地层的形成及变化是逐渐的、有规律的和有成因的。

华莱士线：The Wallace Line is a faunal boundary line drawn in1859by the British naturalist Alfred Russel Wallace that separates the ecozones of Asia and Wallacea,a transitional zone between Asia and Australia.West of the line are found organisms related to Asiatic species;to the east,a mixture of species of Asian and Australian origin is present.1859年由华莱士提出，华莱士线是东亚与西亚之间的分界线，也是亚洲物种与澳洲物种之间的过渡线。

华莱士线西面生活着亚洲物种，而华莱士线东面则共同生活着亚洲物种与典型的澳洲物种。

达尔文：英国生物学家，生物进化论的奠基人。

达尔文出版著作《物种起源》，提出“自然选择学说”，认为生物性状符合“用进废退”以及“获得性遗传”，主张“适者生存”，首次辩驳了神创论及物种不变论的观点。

变异：Genetic variation is a fact that a biological system individual and population is different over space.It is the base of the genetic variability of different biological systems in space.同一空间范围的亲子之间以及子代个体之间性状表现存在差异的现象。

变异是遗传多样性的基础。

可分为基因重组﹑基因突变与染色体畸变。

适合度（fitness）（reproductive success）：指某一基因型个体与他基因型个体相比能够存活并把它的基因传给下一代的能力。

自然选择：Natural selection is the differential survival and reproduction of individuals due to differences in phenotype.自然选择是不同的表现型所导致的生物个体间存活率与繁殖能力之间的差别。

（Wiki）适合度高的个体留下较多的后代，适合度低的个体留下较少的后代，而适合度的差异至少一部分由遗传差异决定，这样一代一代下去，群体的遗传组成自然而然地趋向更高的适合度，这个过程就叫做自然选择。

（PPT）“搭车效应”（hitchhiking effect）：在有利突变产生后被正选择固定的过程中，与之连锁的中性位点的变异也被固定。

“背景选择”（background selection）：“背景选择”指的是负选择在清除有害突变时，也会随之清除与其连锁的中性位点的变异。

隔离：即广义的生殖隔离，指在自然界中生物间彼此不能自由交配或交配后不能产生正常可育后代的现象。

基因流：在群体遗传学中，基因流动（Gene flow）是从一个种群到另一个种群的基因转移。

居群：A group of conspecific organisms that occupy a more or less well defined geographic region and exhibit reproductive continuity from generation to generation.占据一定范围空间的同种生物个体的集合，其子世代繁殖具有连续性。

孟德尔群体（Mendelian population）：群体内的个体享有共同的基因库，通过有性生殖传递基因，可用孟德尔定律进行分析的群体。

基因型(genotype):一个生物体或细胞的遗传组成，导致其个体或细胞的特别性。

“which determines a specific characteristic(phenotype)of that cell/organism/individual.”复等位基因(multiple allele)：二倍体群体中同一基因座上具有两个以上的突变状态的基因。