药学学科药物化学专业硕士培养方案100701：药物化学一、学科概况药物化学是应用化学和生命科学原理研究药物和创制新药的学科。
研究任务主要包括通过药物分子设计或对具有一定生物活性的化合物分离、鉴定或结构改造，总结构效关系，创制可用于临床的新药；通过研究药物化学结构与理化性质的关系和化学稳定性，为药物的生产、剂型设计、贮存流通、质量控制及临床合理用药提供理论基础；通过研究药物化学结构与生物活性间的关系，在分子水平上讨论药物在体内的化学过程和化学作用原理，深入的阐明药物的作用机理、药物在体内代谢过程以及产生毒副作用的本质，为其它学科研究提供理论基础；通过对药物合成路线的设计和改进，为药物生产提供先进、合理的方法及工艺。
药物化学以化学合成药物、无机药物和天然药物为研究对象，研究药物的化学结构与药理作用之间关系；各类药物的作用和作用机制；药物的体内代谢及其产生毒副作用的本质；药物在体内吸收、分布与化学结构之间的关系；影响药物的药效、毒性、质量以及研究最佳剂型和药物制剂分析方法等的主要性质；药物的理化性质的变化规律和在体内的化学过程与合理用药之间的关系；药物结构修饰的原理和方法；新药创制的基本方法与理论；药物合成工艺路线和制备过程可能带来的特殊杂质。
二、培养目标毕业生要能够掌握化学、生命科学和计算机技术等的基础理论和系统专业知识；至少掌握英语一门外国语，能熟练地阅读本专业的英文资料，具有进行国际学术交流的能力；熟悉新药研究的基本方法和现代新药研究的发展方向；具有基本的独立从事新药创制科学研究和科研管理能力。
学位获得者能在高等院校、药物研发机构、药厂、医院等单位从事教学、新药研发、药品生产与质量控制等工作。
三、学习年限硕士研究生在校学习年限为三年、最长在校年限（含休学）四年。
四、研究方向1.新药设计与合成2.化学生物学与药物设计3.天然药物分离、修饰及全合成4.新药评价五、课程设置与学分安排总学分不低于32.0学分，其中学位课不少于8门；公共课计入总学分；学科通开课总学分不低于6.0学分，其中学位课不少于2门，计入总学分；专业基础课总学分不低于3.0学分，其中学位课不少于1门，计入总学分；方向选修课计入总学分；专业外语计入总学分；人文与科学素养选修课计入总学分；必修环节计入总学分；补本课不计入总学分；六、必修环节1、开题报告：必修，最晚于第三学期末完成。
2、学术研讨和学术活动：必修，每学年作报告1次，在学期间作报告不少于2次，参加学术活动不少于9次。
3、实践环节：必修，含科研实践、医疗实践、教学实践和社会实践。
七、课程简介及教学大纲课程简介及教学大纲计算机辅助药物设计一、课程基本情况二、课程内容简介本课程主要介绍计算机辅助药物设计的基本概念、基本理论以及常用的药物设计技术和方法，并选用一些典型的实例，介绍最近的国内外研究成果，让研究生了解现在学科的发展趋势，同时介绍常用软件，使本课程兼具理论性、前沿性、实用性。
三、课程教学内容第一章绪论（3学时）主要内容：讲述计算机辅助药物设计出现的背景、历史以及在药物研发中的应用、学科发展的前沿和趋势。
第二章基本概念和理论基础（6学时）第一节药物与靶点相互作用理论一、药物与靶点相互作用类型二、药物与靶点分子的计算机图形显示主要内容：药物的主要作用靶点类型，药物与靶点相互作用的类型及其相互作用理论，药物与靶点的计算机图形显示。
第三章理论计算基础（6学时）第一节能量优化1.构象搜索2.分子力学方法3.量子力学方法主要内容：分子结构的能量优化、构象搜索以及分子力学和量子力学方法。
第四章计算机辅助药物设计的方法学（15学时）第一节定量构效关系第二节药效团模型第三节分子对接第四节虚拟筛选主要内容：基于配体的药物设计方法包括定量构效关系、药效团模型以及基于受体的药物设计方法分子对接以及这些方法的主要应用虚拟筛选。
第五章计算机辅助药物设计的应用实例（12学时）第一节 HIV-1蛋白酶抑制剂的设计第二节抗感冒药的设计第三节计算机辅助药物设计最新应用进展、成果主要内容：以计算机辅助药物设计在HIV-1蛋白酶抑制剂设计及抗感冒药设计中的成功应用为例使得学生了解计算机辅助药物设计的实际药物研发中的应用。
在此基础上报告计算机辅助药物设计的最新应用成果。
第六章上机实际操作相关软件（12学时）主要内容：介绍并练习使用常用的大型计算机辅助药物设计软件的基本功能和使用方法，主要包括SYBYL、Discovery Studio等。
四、参考文献1. 徐筱杰，侯廷军，乔学斌，章威；计算机辅助药物分子设计；化学工业出版社 2004.2. 陈凯先, 蒋华良, 嵇汝运；计算机辅助药物设计--原理、方法及运用；上海科学技术出版社 2000.3. A.R.Leach Molecular Modelling: Principles and Applications (2nd Edition) 世界图书出版公司2003.课程简介及教学大纲药物作用的化学原理一、课程基本情况二、课程内容简介药物作用的化学原理是研究化学药物及其靶分子的化学结构以及药物理化性质、生物学性质（如吸收、分布、排泄、代谢）、药物作用（包括治疗作用和毒副作用）的化学机理和构效关系而寻找新药的途径和方法的一门学科，通过本课程的教学，回答的问题是怎样发现一个安全有效的药物和怎么用好药，使学生为如何发现新药和有效、合理使用现有的化学药物提供理论依据，为从事新药研究和指导临床合理用药等工作奠定理论基础。
三、课程教学内容第一章绪论（6学时）1.1药物作用的化学原理的研究内容1.2 药物作用的化学原理的任务1.3药物作用的化学原理与其他学科的关系1.4新药创制的发展史回顾1.5 我国新药创制的发展情况1.6 药物研究与开发1.7新药研究与开发的四个阶段1.8 药物的名称第二章受体（6学时）2.1受体的含义2.2激动作用与拮抗作用2.3交感神经与副交感神经的递质2.4去甲肾上腺素的生物化学2.5肾上腺素受体2.6胆碱受体2.7 多巴胺受体第三章第二信使（3学时）3.1 环磷酸腺苷和环磷酸乌苷3.2 磷酸二酯酶抑制剂3.3 前列腺素第四章酶反应与酶抑制剂（6学时）4.1 酶反应4.2 青霉素4.3 抗艾滋病毒药物4.4血管紧张素转化酶抑制剂4.5酶蛋白的结构与作用4.6酶催化反应的化学过程4.7 药物与酶的结合力第五章电荷密度分布（4学时）5.1 正电中心与负电中心5.2 共轭效应5.3 氢键5.4 电荷转移复合5.5 电荷密度的计算5.6 电子等排体5.7 软硬酸碱第六章立体效应（6学时）6.1 旋光异构体6.2 几何异构体6.3 药效基团6.4 构象第七章理化性质（5学时）7.1 电离度与吸收7.2 油水分配系数7.3 亲脂性7.4 亲水性7.5 定量构效关系第八章代谢转化（6学时）8.1 羟化反应8.2 脱烷基反应8.3 醇的氧化8.4 氮化合物的氧化8.5 硫化合物的氧化8.6 还原反应8.7 水解反应8.8 乙酰化反应8.9 甲基化反应8.10 缩合反应8.11 结构修饰改变代谢转化的速率第九章药物潜优化（6学时）9.1 增加水溶性9.2 增加脂溶性9.3 改变酸碱性9.4 增高选择性第十章抗癌药物的新型设计方法（6学时）10.1 良性肿瘤与恶性肿瘤10.2 目前应用或试验的抗癌药物10.3 癌基因及其致癌机理10.4 肿瘤抑制基因10.5 致癌因素10.6 抗癌药物的新型设计方法四、参考文献1. William O. Foye . Foye’s Principles of Medicinal Chemistr y，6th ed., 2007, Editor: Lemke and Williams2. Burger’s Medicinal Chemistry and Drug Discovery, Abraham, D.J., Ed. 6th Ed., 2003.3. J. Am. Chem. Soc., J. Med. Chem.4. Bioorg. Med. Chem., Bioorg. Med. Chem. Lett.5. Curr. Med. Chem., Euro. J. Med. Chem.,Wikipedia (free) ：课程简介及教学大纲天然药物提取分离及结构鉴定一、课程基本情况二、课程内容简介天然药物化学是一门运用现代化科学理论、方法与技术研究天然药物中化学成分的一门学科，内容包括各类天然药物化学成分的结构特点、物理化学性质、提取分离方法以及主要类型化学成分的结构鉴定等，此外还涉及到主要类型化学成分的生物合成途径。
本门课程是在有机化学、分析化学、药用植物及波谱学课程的基础上，在本科生通过天然药物化学课程学习已熟悉天然药物中有效成分的结构特点与类型；掌握各类有效成分的理化性质、了解典型有效成分的结构测定方法以及生物合成途径之后，着重讲授天然药物有效成分研究的途径和方法，提取分离有效成分的各种方法及应用范围、应用紫外光谱（UV）、红外光谱（IR）、质谱（MS）、氢核磁共振（1H-NMR）、碳核磁共振（13C-NMR）等光谱检测手段鉴定糖苷、黄酮、醌类、萜类、皂苷等有效成分的结构。
三、课程教学内容第一章天然药物的提取技术（讲授8学时、课堂讨论2学时）第一节：天然药物的提取总论第二节：天然产物提取的传统方法第三节：现代提取技术原理及应用主要内容：天然药物所含成分，预实验的概念及分类，提取分离的工作；传统提取方法（浸渍法、渗漉法、煎煮法、热回流提取法）；现代提取技术（二氧化碳超临界萃取技术、超声辅助提取技术、微波辅助提取技术、生物酶解技术、仿生、半仿生提取技术、强制上行循环提取技术的原理、特点和应用）。
第二章天然药物的分离技术（讲授12学时、课堂讨论2学时）第一节：薄层色谱第二节：常压柱色谱第三节：特殊柱色谱第四节：制备型与分析型色谱主要内容：薄层色谱的分类、应用及优缺点；常用柱层析（吸附性柱色谱、分配性柱色谱、离子交换柱色谱、凝胶过滤柱色谱、聚酰胺柱色谱、大孔吸附树脂）的原理、装填使用方法、应用及特点；特殊柱层析（干柱柱层析、减压柱层析、短柱柱色析、棒色谱、闪式柱层析）的原理、装填使用方法、应用及特点；制备型与分析型色谱应用及特点。
第三章天然药物波普学特征及结构鉴定（讲授10学时、自学交流2学时）第一节：糖和糖链结构的波谱特征及结构鉴定第二节：香豆素类化合物的波谱特性及结构鉴定第三节：蒽醌类化合物的波谱特性及结构鉴定第四节：黄酮类化合物的波谱特征及结构鉴定第五节：萜类化合物的波谱特征及结构鉴定主要内容： 1H-NMR判断糖苷键的相对构型、13C-NMR在糖链结构测定中的应用、苷化位移；香豆素类、蒽醌类、黄酮类、萜类化合物（单萜、倍半萜、五环三萜等）的紫外光谱、红外光谱、质谱、1H-NMR、13C-NMR。