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TAKARA糖基化分析试剂盒

用 1.5 ml Microtube 收集(分为 2 管,每管 1 ml)。最后用空气将 Cellulose Cartrige Colum 内 的溶液全部吹出。 c) 洗脱液用真空离心等方法干燥后,用 100 μl 左右的灭菌蒸馏水溶解,经适当稀释后进行 HPLC 分析。
注:Cellulose Cartridge Column 不能重复使用。
TaKaRa Code:D4480
Pyridylamination Manual Kit (20 次量)
说明书
宝生物工程(大连)有限公司
目录
内容
●制品说明 ●制品内容 ●保 存 ●PA 化反应的操作方法 ●PA 化糖链的纯化方法 ●对照实验例 ●参考文献
页码
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●制品说明
本试剂盒是利用 2-Aminopyridine(2-氨基吡啶, 2-AP)对糖链进行荧光标记(PA 化)的试剂盒。使用 本试剂盒不需要特殊的 PA 化设备,操作简单,回收率 高。 对糖链进行 PA 化标记反应时,首先是糖链的还原末端 与 2-氨基吡啶反应形成西夫碱(Schiff Base),西夫碱 在还原剂的作用下生成稳定的糖链氨基吡啶衍生物 (PA-糖链),PA-糖链是一种稳定的荧光诱导体,检测 灵敏度高。(原理见图 1)。 对糖链进行 PA 化标记后,使用试剂盒中的 Cellulose Cartridge Column 进行层析,能够高效除去反应后的 残存试剂,回收 PA-糖链。使用这种方法要比使用糖质 PA 化标记专用设备(如 PALSTATION 或 GlycoTAG 等通过蒸发除去反应后的残存试剂)的回收效果好。 本试剂盒标记的 PA-糖链具有荧光性,可以通过 HPLC 对糖链进行高灵敏度的分析。
④ Cellulose Cartrige Column 的洗净。 注射器中吸入 10 ml*1 的试剂 1,安装到 Adaptor 上,以 1 滴/秒左右的速度推出液体,清洗 Cellulose Cartrige Column*2。整个操作过程要始终保持柱子中有液体。最后注射器内吸入 2 ml 左右的空气, 把 Cellulose Cartrige Column 内的液体吹出。
注 2:配制均一的偶联试剂,在常温以下时有时能发生凝固,此时需要加热融化。由于粘度较大,适 当搅拌有助于融解。
③ 还原试剂的配制。 称量 Borane-dimethylamine Complex 20 mg 装入 1.5 ml 的 Microtube 中,加入 100 μl 的 Acetic Acid,充分振荡溶解。
向标记反应后的 PA 化糖链样品 40 μl 中,加入 1 ml 的试剂 1,充分振荡混匀。此样品要进行离心操作,保持悬浊液的状态直接上样。 注 2:充分振荡后,样品溶液仍然明显分为两层时,可用试剂 1 稀释,有可能均一化。如果试剂 1 的
照糖链差别较大时,建议首先进行预实验,以寻找最适合的反应条件。
* 本试剂盒中附带的对照糖链 Biantennary Sugar Chain 的结构
●制品内容(20 次量)
本试剂盒分为-20℃保存和常温保存两部分。 【-20℃保存部分】
2-Aminopyridine Borane-dimethylamine Complex Biantennary Sugar Chain(500 pmol/50 μl) PA-Biantennary Sugar Chain(100 pmol/100 μl)
注 2:本还原试剂应现用现配,配制后请于当天使用。
2. PA 化操作方法。 ① 将糖链样品(50 pmol~50 nmol)装入带有螺旋盖的 1.5 ml Microtube 中,用真空离心或冻结干
燥等方法将样品充分干燥。
注:糖链样品应尽量除去盐类、蛋白质、脂质等杂质,在 PA 化标记反应前可以使用 Cellulose Cartridge Glycan Preparation Kit(TaKaRa Code:D4403)或者凝胶过滤柱层析等方法纯 化。
Cellulose Cartridge Column。 c) 重复上述 b)操作 2 次。 d) 注射器内吸入空气,将 Cellulose Cartridge Column 中的水完全吹尽。 e) 注射器内吸入 10 ml 的试剂 2,安装到 Adaptor 上,以 2~5 滴/秒的速度推出液体,清洗 Cellulose
*1 上样的样品量过多时,可按样品量+洗净液(试剂 1)量 = 12 ml 的比例调整洗净液量。 *2 洗出液先收集保留,待分析结果出来后再废弃。
⑤ 糖链的洗脱。 a) 取 2 ml 的试剂 2 加入至上述④的未安装有 Adaptor 的 Cellulose Cartrige Column 内。 b) 按顺序安装上 Adaptor、吸入空气的注射器,慢慢推进注射器(以出液速度 1 滴/秒为宜),洗脱液
加量达到 5 ml 仍分为两层时,通常是样品中的杂质原因,特别是盐类含量太高等,有可能导 致样品得不到充分 PA 化标记。此时,我们建议再次干燥,进行凝胶过滤柱层析除盐后,重新 进行 PA 化反应。
③ 上样操作。 a) 样品溶液振荡混匀后,加入至上述①处理的未安装有 Adaptor 的 Cellulose Cartrige Column 内。 b) 按顺序安装上 Adaptor、吸入空气的注射器,慢慢推进注射器(以出液速度 1 滴/秒为宜),最后注
【说 明】
图 1. 糖链的 PA 化反应过程
PA 化的反应效率和利用 Cellulose Cartridge Column 回收标记的 PA-糖链的回收率,受糖链样品本身结
构的影响。本试剂盒最适于对具有两个分支的复合型糖链 N-Glycan(试剂盒中附带的对照糖链 Biantennary
Sugar Chain*)进行标记。用于标记的糖链的结构,特别是糖链还原末端残基的种类和糖链的分子量与对
300 mg×2 瓶 100 mg×2 瓶
50 μl 100 μl
【常温保存部分】
Cellulose Cartridge Column(0.5 ml) Adaptor Syringe(10 ml)
20 个 1个 3个
-1-
【本试剂盒以外需要自备试剂】 ① n-Butanol ② Ethanol ③ Acetic Acid ④ Ammonium Bicarbonate ⑤ 灭菌蒸馏水
(分析纯以上) (分析纯以上) (分析纯以上) 75 mM 水溶液
约 500 ml 约 500 ml 约 5 ml 约 500 ml
●保 存
-20℃保存部分: -20℃保存。 常温保存部分: 常温保存。
●PA 化反应的操作方法
1. 仪器的准备和反应试剂的配制。 ① 将恒温箱或水浴设定至 80℃(也可以使用加热块,但其控温稳定性不太好,往往得不到良好的实验
●对照实验例
将试剂盒中的试剂 Biantennary Sugar Chain 10 μl(100 pmol),按照上述操作步骤,进行 PA 化标 记反应及纯化。将得到的 PA 化糖链,与试剂 PA-Biantennary Sugar Chain 同时进行 HPLC 分析比较, 确认 PA 化收率。简单方法如下:
意不要让 Cellulose Cartrige Column 干燥,让微量溶液保留于充填剂的上端。 注:溶出液先收集保留,待分析结果出来后再废弃。
c) 用 1 ml 的试剂 1 清洗样品管,将清洗液同样加入 Cellulose Cartrige Column 内,然后按照 b)的 方法进行操作。
-3-
50000 40000 30000
A B
Fliorescence
20000
10000
0
0
20
40
60
Time (min)
A:PA 化后的 Biantennary Sugar Chain(本实验样品)。 B:内部标准品 PA-Sugar Chain 003(TaKaRa Code: D4103)*。
* 本试剂盒中不备有,需要另行购买。
注 1:由于 Borane-dimethylamine Complex 极易吸潮,称量时应首先将制品瓶于室温下复温,然后 在湿度较低的地方称量。称量操作要迅速,可按实际使用量称量,再按比例加入 Acetic Acid。 称量后的 Borane-dimethylamine Complex 瓶要盖严,然后用封口膜等封严。
-4-
HPLC 条件: Column:TSKgel Amide-80(4.6×250) (TOSOH Code:01371) Solvent A:500 mM Acetic Acid-Triethylamine(pH7.3)/CH3CN/H2O(10/75/15) Solvent B:500 mM Acetic Acid-Triethylamine(pH7.3)/CH3CN/H2O(10/50/40) Gradient:0~0%B/0~15 min,0~100%B/15~65 min,100~100%B/65~75 min, 0~0%B/75~90 min Flow Rate:1 ml/min Fluorescence Detection:Ex:310 nm,Em:380 nm Column Temperature:40℃
结果)。 ② 偶联试剂的配制。
向装有 300 mg 偶联试剂(2-Aminopyridine)的制品瓶中加入 100 μl 的 Acetic Acid,可在 80℃ 左右加热,并用振荡器充分振荡溶解,配制后的试剂量约为 250 μl。
注 1:用 300 mg 的 2-Aminopyridine 配制的偶联试剂可以做 10 次反应。使用后的剩余试剂请转移至 1.5 ml 的 Microtube 中,于-20℃密封冻结保存,此偶联试剂请于 3 个月内使用。
Cartridge Column。最后注射器内吸入空气,将试剂 2 完全吹出。 f) 注射器内吸入 10 ml 的试剂 1,安装到 Adaptor 上,以 2~5 滴/秒的速度推出液体,清洗 Cellulose
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