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生物素标记和化学发光检测技术在核酸杂交和EMSA中的应用


交联化学: 交联化学:交联剂,修饰试剂,生物素化试剂…
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1. 生物素标记和化学发光检测 技术在核酸杂交和EMSA EMSA中的应用 技术在核酸杂交和EMSA中的应用
The world leader in serving science
关于生物素
别名: Vitamin B 分子量: 244.31 水溶性好 结合对象: 亲和素Avidin 亲和素Avidin 链亲和素Streptavidin 链亲和素Streptavidin 中性亲和素NeutrAvidin 中性亲和素NeutrAvidin 单体亲和素Mono 单体亲和素Mono Avidin
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3. 化学发光检测
Note1:要保证所有缓冲液充分溶解,没有颗粒 1.封闭:封闭液20ml(0.25ml/cm2膜)于37-50°振荡洗膜封闭15分钟 2.抗体孵育:20ml抗体稀释液( 66.7ulSA-HRP+20ml封闭液),室温孵育 15分钟 3.洗膜:20ml的1X漂洗缓冲液分别室温轻柔振荡漂洗4次,每次5分钟 4.平衡:杂交膜与30ml的底物平衡液室温轻柔振荡孵育5分钟 5.底物孵育:把湿润的膜放在一个干净的塑料盘(平皿)里,与底物工作液 在室温下孵育5分钟(推荐在暗室中)。确保膜被底物溶液完全淹没或覆 盖底物工作溶液需足够以完全覆盖杂交膜(约0.1ml/cm2)。 6.曝光:滤纸吸附多余底物,作好标记,保鲜膜包裹,确保保鲜膜和杂交膜 间无气泡和皱褶。把包好的杂交膜放在暗夹里,放上X光片,曝光1-5分 钟。曝光时间长短可以稍有变化以获得理想的信号。 7.从暗夹里取出X光片,按厂家的使用说明书显影和定影。 Note2:可与底片背景去除试剂配合使用,以获得更理想的实验结果
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2. 探针制备二之探针纯化 探针制备二之探针纯化
1. 2. 3. 4. 5. 6. 加入5ul醋酸铵于上述50ul反应离心管,吹打混匀 加入110 ul 冰预冷的无水乙醇,充分混匀,冰或-70°放置15分钟 12000rpm 4°离心15分钟 观察沉淀情况,小心吸取出上清,风干沉淀 用冰预冷的70%乙醇洗涤一次,12000rpm 4°离心15分钟,观察沉 淀情况,小心吸取出上清,风干沉淀 50ulTE或RNA酶free 的水溶解沉淀(-20℃或-70℃长期保存)
Affinity cytochemistry
Localization studies Signal Amplification Diagnostics Histochemistry
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1.1生物素标记和化学发光检测技术在核酸杂交中的应 1.1生物素标记和化学发光检测技术在核酸杂交中的应 用
“Everything is possible - with the right tools”
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2. 杂交和洗膜之严谨洗膜 杂交和洗膜之严谨洗膜
1. 2. 配制1X严谨洗膜缓冲液,平衡严谨洗膜缓冲液到室温(溶解充分) ,加等体积去离子水配制所需洗膜液(0.2ml/cm2膜) 将膜转移到一个新的容器中(杂交管)。加入1X严谨洗膜液10- 20ml,旋转洗膜3次(DNA杂交55℃,RNA:RNA杂交65℃),每 次15-20分钟。
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对照DNA点杂交 对照DNA点杂交 DNA
备用试剂:0.1N NaOH 煮沸变性DNA变性成单链( 对照DNA,5μl,250ng/μl) 准备生物素标记的对照探针或阳性样品探针(见探针标记,纯化和定量 ) 准备目标膜(注意:推荐使用带正电尼龙膜,需带无粉手套并用乙醇净 化的镊子拿膜。) • 0.1N NaOH稀释变性DNA得到1,0.5,0.25,0.125,0.0625, 0.0312,和0.015ng/μl稀释梯度。 • 在膜上平行点两点。点前最好把膜预洗一下,半干的时候点,但 干点同样有用。 • 用1X TE轻轻漂洗膜(~10秒),微波炉高火加热2分钟,紫外交 联(自动交联)或烘干固定。注:如果没有紫外交联仪,则可以 注 将膜置于80度温箱烘烤2-3小时,可达到固定目的 • 交联固定完,用0.1%SDS预湿润膜,进入下面预杂交,杂交以及 底物孵育和曝光 杂交,严谨洗膜和封闭,抗体孵育,洗膜,平衡,底物孵育以及曝光见 前所述
该试剂盒由探针标记,杂交洗膜和化学发光检测三部分组成 North2South™生物素随机引物Kit(该试剂盒含有足以完成10次标记反应的试 剂,每次可合成至少1ug的生物素标记的探针) 化学发光检测Kit 89880可检测1080cm2的杂交膜.
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探针得率高
高产率 :模板DNA可以少至100ng,Klenow聚合酶无核酸外切酶活, 产率提高,每次标记至少产生1-2 ug的生物素标记的探针。 使用方便:标记好的探针可以在冰箱里保存一年。
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2. 杂交和洗膜之杂交
1. 平衡杂交液到室温 2. 预杂交:将转好的膜置于杂交管,点样面朝上,确保膜被杂交缓冲液均 匀覆盖,杂交炉要缓慢转动以保证杂交液与膜能充分接触,(每平方 厘米膜至少0.1ml杂交液。除了RNA:RNA杂交用65℃外,其他的都用 55℃),50-100rpm旋转,至少30分钟。 3. 热变性探针:煮沸变性10分钟,迅速在冰/盐水混合物退火5-10分钟 4. 杂交:加入已经变性的DNA探针于杂交液,充分混匀(探针加入到杂交 液,不要加到膜上,要轻轻晃动,使探针均匀分散在杂交液中),探 针浓度约30ng/ml杂交液, 50-100rpm旋转,孵育过夜。
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检测安全
采用非同位素的化学发光系统,免除放射性的危险与处理同位素废物 的麻烦,减少环境污染;无须专门的同位素操作室,易于使用推广 anyone,anywhere and anytime
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高灵敏度与高信噪比
生物素标记的dUTP保证了与HRP标记的链亲和素(Kd=10-15M; 抗体10-5~8M ) Kd=10 15M; 抗体10 最大结合,经受最严谨的洗膜条件 优化杂交液和封闭液保证了探针与靶DNA的完美结合 Dura (10-14克)底物保证了保证了高于地高辛(DIG)-AP标记系统,等同 于或者超过同位素的检测灵敏度
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方便快速
0.5-10分钟即可检测到特异性信号 6小时的超长发光时间允许多次曝光 可以使用冷光CCD成像仪扫描成像
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操作流程与时间
1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 探针标记与纯化(1小时) 预杂交(0.1mL/cm2 ,55或者65°, 0.5小时) 杂交(8-12小时) 严谨洗膜(3X15分钟,提高温度,降低离子强度) 封闭( 0.25mL/cm2 , 轻柔振荡15分钟) SA-HRP孵育(,1:300稀释度,轻柔振荡15分钟) 洗膜( 4X5分钟) 平衡(5分钟) 底物孵育(0.125mL/cm2 , 5分钟) 曝光检测(0.5- 10分钟)
1.生物素标记和化学发光检测技术在核 1.生物素标记和化学发光检测技术在核 酸杂交和EMSA中的应用 酸杂交和EMSA中的应用 2.Western Blotting的问题与对策 Blotting的问题与对策
The world leader in serving science
Steven Product manager Apr 24 ,2007
有机合成,化学耦联,表面化学和分析化学
Product Focus: Focus:
分子生物学: 分子生物学:各种化学发光Blotting, EMSA,RPA 蛋白质组学: 蛋白质组学:蛋白抽提, 蛋白定量,纯化,样品制备,功能研究以及各种染色 试剂和预染Markers 免疫学 :抗体制备, 纯化,片断化, 分型和修饰
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North2South 杂交原理和操作流程
5、SuperSignal® Dura 底物在 HRP的催化下反应发光,检测
底物
HRP
4、HRP标记的链亲和素与 探针上的生物素结合
3、杂交:生物素标记的 探针与靶DNA结合 │
B
SA
B

2、洗膜封闭
1、DNA电泳,转膜,紫外交联固定
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Kit组成 组成
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原理
标记:采用随机引物标记法,利用DNA聚合酶,以目标DNA为模板,在随 标记:采用随机引物标记法,利用DNA聚合酶,以目标DNA为模板, DNA聚合酶 DNA为模板 机七核苷酸为起始引物的作用下,将生物素标记的dUTP dUTP掺入到合成的 机七核苷酸为起始引物的作用下,将生物素标记的dUTP掺入到合成的 DNA探针中 产生可用于Southern Northern杂交实验的高活性生物素 探针中, Southern或 DNA探针中,产生可用于Southern或Northern杂交实验的高活性生物素 标记的DNA DNA探针 标记的DNA探针 检测:杂交形成双链,洗膜后,探针DNA上的生物素与HRP DNA上的生物素与HRP上的链亲和素 检测:杂交形成双链,洗膜后,探针DNA上的生物素与HRP上的链亲和素 结合,HRP与 Dura化学发光底物孵育曝光或冷光CCD检测 化学发光底物孵育曝光或冷光CCD 结合,HRP与Pierce 的Dura化学发光底物孵育曝光或冷光CCD检测
O OH
O HN H S NH H
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关于生物素/ 关于生物素/亲和素复合物
亲和素 亲和素Avidin 亲和素Avidin 链亲和素Streptavidin 链亲和素Streptavidin 中性亲和素NeutrAvidin 中性亲和素NeutrAvidin 单体亲和素Mono 单体亲和素Mono Avidin
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探针制备三之探针定量 探针制备三之探针定量
1. 500ul去离子水,260nm调零 2. 充分混匀2.5ul 探针和47.5ul 去离子水(即稀释20倍)分光光度计测 定OD260值 3. 定量计算公式:1 OD260 dsDNA = 50 μg/ml; 4. 样品浓度(μg/ml)=OD值X50X稀释倍数; 5. 样品浓度μg/ul= OD260值X50X20/1000 6. 样品浓度ng/ul= OD260值X50X20(注:如果稀释20倍,实际测定的 OD260值应该在0.02-0.05之间) Note:大多数情况下,由于各实验室用来测定核酸的仪器不同,检测灵 Note: 敏度不同以及样品中的一些干扰物质,测出的OD值往往是0甚至是负值 ,如果出现这种情况,再进行核酸定量没有实际价值,因此,根据经验 ,保守估计,在每次至少合成1ug探针的前提下,在杂交时,探针的用 量按照每ul含有20ng探针来使用,即每毫升杂交液加入变性的纯化过的 探针1.5-2ul.
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