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科研数据处理教程230P

合理性。
软件工程师开 发电脑软件, 使繁琐的计算 大大简化。
科研工作者的团队定位(本系列视频的宗旨)
①:了解统计分析方法的原理,知道“什么类型的数据该选用什么分析方法”。 ②:知道“该选用什么软件”,熟悉“原始数据输入软件的格式”。 ③:熟悉“软件的数据处理结果该怎么解释”。
《科研数据处理》系列说明
1. 基础部分
– 推荐软件及操作方法 – 备选软件(0~3个)及操作方法
2. 拓展部分(某些章节会有,选读)
– 加深对本讲方法的理解
• 为了方便大家学习,原始数据的结构均以 Excel工作表(.xlsx)格式呈现。
《科研数据处理》系列说明
• 视频中难免讲错的地方,欢迎大家在相应 优酷视频的评论中指出,也可以给我发邮 件讨论。我会在相应优酷视频的文字简介 中更正。
选择合适的工具,去完成相应的任务。
实例演示:使用Excel分析工具
• 使用随机数发生器,创建三列呈正态分布 的随机数。
• 本系列实例演示中的样本数据的来源。
• 创建随机数的另一方法:
– Rand()
科研工作者的团队定位


原始数据
千百个的统 计分析方法
数据的运算
数据处理结 果

统计学家建立 方法的数学骨 架,并证明其
2. 使用Excel计算药时曲线的AUC。 3. 使用Origin计ห้องสมุดไป่ตู้药时曲线的AUC。
科研数据处理002_计算AUC曲线下面积
二、曲线下面积AUC——拓展
计算药时曲线AUC的其他方法
• 建立药物动力学模型,对实验数据进行曲 线拟合,并求出相关的参数。利用函数的 微积分方法求出曲线下面积。【有软件可 以自动计算~~~】
………………
科研数据处理
数据绘图
适合科研领域的数据处理软件
软件及版本 Microsoft Office
Excel 2010
GraphPad Prism 5
OriginPro 8.5.1 IBM SPSS
Statistics 19
缩写 Excel
Prism Origin SPSS
特点
大众化:几乎人人都会,简单易操作。 广泛化:几乎每台电脑上都有Excel。 非专业化:各行各业的人都在用Excel。 为科研工作者量身定做,简单易学。 使用Sample模板,大大节约时间。 兼有数据分析和数据绘图,都是精华。
统计学的两个作用
1. 数据压缩与数据挖掘 2. 使不同工作者的经验判断规范化、统一化
• 统计学 = 经验(60%) + 数学(40%) • 统计学的精髓在于:在处理同类问题时,
不同工作者都采用相同的统计分析方法。
科研数据处理的内容
数据分析
平均值(Mean) 标准偏差(Standard Deviation, SD) 显著性差异(Significant Difference)
功能强大,偏重于数据绘图。
功能强大,偏重于数据分析。
推荐度 ☆☆☆☆
☆☆☆☆☆ ☆☆☆ ☆☆☆
备注:
1. 《科研数据处理》系列视频主要使用上述4个数据处理软件。每讲的数据处理都 会有一个推荐软件和若干个备选软件。
2. 其他如SigmaPlot,QtiPlot,STATA等也是科研raphPad”,不要写“Prism”。
【问题1】药时曲线的AUC计算
• 药物浓度-时间曲线(药时曲线) • Concentration-Time Curve (C-T curve) • 曲线下面积(Area Under Curve, AUC)
Conc(ng/ml) Conc(ng/ml)
Conc-Time Curve
100
80
60
40
20
0
0
20
40
60
Time(h)
Conc-Time Curve
100
80
60
AUC=???
40
20
0
0
20
40
60
Time(h)
【相关关键词】
• 药物浓度-时间曲线(药时曲线) • Concentration-Time Curve (C-T curve) • 曲线下面积(Area Under Curve, AUC)
Conc(ng/ml) 0 5.1 13 30 58 88 82 67 42 35 21 9.4 2.3 0.2
【目标图片&结果】药时曲线的AUC
Conc(ng/ml)
Conc-Time Curve
100
80
60
40
AUC=???
请绘制“药时曲线” 如右图所示,并计算 出阴影部分的面积。
20
0
0
20
• 梯形法(trapezoid rule) • 积分(Integrate)
科研数据处理002_计算AUC曲线下面积
一、药时曲线的AUC计算
【原始数据结构】药时曲线的AUC
• 给大鼠口服某药物后, 按照一系列时间点取 血,用高效液相色谱 分析血中药物的含量, 如表所示:
Time(h) 0
0.25 0.5 1 1.5 2 3 4 6 8 12 24 36 48
40
60
Time(h)
推荐软件:GraphPad 备选软件:Excel,Origin
梯形法计算曲线下面积
Conc(ng/ml)
100
梯形面积=(上底+下底)×高÷2
80
Area=(y2+y1)×(x2-x1)÷2
60
40
(x1,y1)
20
(x2,y2)
0
0
20
40
60
Time(h)
实例演示
1. 使用GraphPad计算药时曲线的AUC。(推荐)
科研数据处理教程
系列绪论
本系列的相关配置
• 操作系统和配色方案:WIN7 Home Basic • 屏幕分辨率:1024×768 • 数据处理软件
– Microsoft Office Excel 2010 – IBM SPSS Statistics 19 – GraphPad Prism 5 – Origin 8.5.1
• 该方法(药动模型法)的关键是:所建立 的模型要合适,与实验数据有比较好的拟 合度。
• 我的
• 大家共同探讨,共同进步~~~
计算AUC曲线下面积
本讲的相关配置
• 操作系统和配色方案:WIN7 Home Basic • 屏幕分辨率:1024×768 • 数据处理软件
– Microsoft Office Excel 2010 – IBM SPSS Statistics 19 – GraphPad Prism 5 – Origin 8.5.1
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