卡培他滨、氟尿嘧啶乳膏外用液
拉布立酶、氨苯矾、伯氨喹、氯喹 利福平、异烟肼、吡嗪酰胺
硫唑嘌呤、硫鸟嘌呤、6-巯基嘌呤 华法林
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21
IL28b基因多态性与丙型肝炎治疗 及预后
基因多态性 rs12979860 rs8099917 rs12980275
2020-5-28
结果判断
邻近IL28b基因，位于IFN-r3编码基因上游3kb处，是目前 已知的与HCV感染者的持续病毒应答（SVR）相关，其中 C/C与SVR相关联，C/T和T/T与非病毒应答（NVR）相关。 SNPrs12979860T基因型也与应用PEG-IFN/RBV治疗引起 的初相病毒载量的下降显著关联，但仅与1型慢性HCV患者的 二相病毒载量下降有关。
治愈率<10%, 五年生存率23%。低于欧美 国家31%、57%,低于日本27%和43%
主要原因： 1）早期诊断低 2）缺乏规范化治疗 3）经济状况差
2020-5-28
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较早期诊断（Ⅰ和Ⅱ）提高治愈率和五年生 存率46%， 72%
分子诊断为肿瘤早期诊断提供技术支撑！
2020-5-28
曲妥珠单抗）
Her2/neu表达 者效果较好
2020-5-28
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20
基因多肽性与药物治疗
基因
药物
CYP2C19
CYP2C9 CYP2D6
DPYD G6PD NAT TPMT VKORC1
2020-5-28
伏立康唑、奥美拉唑、 泮托拉唑、艾美拉唑、雷贝拉唑、地西洋、那非那韦
塞来考替，华法林
阿托西丁、文拉法辛、利哌利酮、塞托溴胺、他莫普芬、 噻吗洛尔、氟西叮、奥氮平、西维美林、托特罗定、特 比萘酚、曲马多、啊立哌唑、美托洛尔、卡维地洛、普 罗帕酮、硫利达嗪、普罗替林，可待因
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个体差异与个体化医疗
个体差异：基础
个体化医疗（Personalized medicine）
这个名词最早由Gibson提出，其意义是家 庭医生独立行医的意思。现代意义的个体化 医学概念于1999年由Langreth和 Waldholz在《Oncologist》杂志上首次提 出，其意义是根据病人的遗传学背景，结合 生物信息学和高端成像技术进行诊断，从而 合理选择药物进行治疗。
Herceptin (Trastuzumab) Lapatinib
Ivacaltor
Indacaterol, Irinotecan, Nilotinib Herceptin (Trstuzmab)
Herceptin (Trstuzmab)
Zeiboraf (vemurafenib)
VFIyS2sHi0s 2PAr0LoK-b5eB-rK2ei8at k Apart
临床分子诊断与个体化治疗
xx 暨南大学附属珠海/珠海市人民医院
2020-5-28
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1
分子诊断
狭义分子诊断：应用分子生物学方法检测患者体内 遗传物质的结构或表达水平的变化而做出诊断的技 术，称为分子诊断，包括肿瘤分子诊断、传染病分 子诊断、产前诊断等。
广义分子诊断：指应用分子生物学方法，对受检者 体内各类生物分子（包括DNA、RNA、蛋白质等） 进行定性和定量分析，确定其结构或表达水平，从 而为个性化预防、治疗提供依据的一种诊断技术， 包括肿瘤分子诊断、传染病分子诊断、产前诊断、 单基因诊断、易感基因检测以及天赋基因检测等。
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22
个性化检测的局限性
一些疾病是由一个或多个基因突变引起 基因检测方法确实能对这些疾病的患病风险、
确诊和治疗起指导作用 大多数疾病发生、发展及预后可能涉及更多
的基因以及这些基因和环境因素相互作用 仅通过基因检测盒基因表达谱的检测有很大
局限性
2020-5-28
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23
CLIA：分子检测有关的主要质控要求
2020-5-28
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6
目前国内临床分子诊断现状
绝大部分用于病原体核酸检测 较少部分用于遗传病的产前诊断 个体化用药的分子诊断正在兴起
2020-5-28
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7
一些常见的认识误区
临床实验室=检验科 基因（遗传携带、突变等）与病原体核酸检
测完全不同 临床PCR检验在病理科、药剂科或肿瘤科做，
A comprehensive treatment could improve survial aquality another one-third of pattients with cancer
2020-5-28
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11
华南肿瘤国家重点实验室，中山大学肿瘤防治中心-钱朝南教授
中国肿瘤治疗现状
雅培公司
2011谢-0谢8阅读组织，ALK
FISH
Xalkon (crizotinb)
19
基因突变和表达与肿瘤靶向治疗
肿瘤 结直肠癌
非小细胞肺癌
治疗药物
检测位点
结果判断
西妥腊单抗 （Cetuximab） 帕尼单抗 （Paritumuma b）
古非替尼
特罗氨 （Tarceva）
12号染色体KRAS基因2号外显子的12密码子和 13密码子、3号外显子的61号密码子，其中有7 个突变热点：G12C、G12R、G12S、G12V、 G12D、G12A、G13V/D占到KRAS基因突变的 90%以上
对于每一个检测系统，实验室由此又控制程序的责任——监控整个分析过程的准确性和精 密度。(42 CFR 493.1256（A）)控制程序必须是：
罗氏公司
2004-12
血CYP4502D6
Dakocytomention Her2 FISH pharm OX kit
Dakocytomenation Denmark A/S
2005-05 组织
检测方法 基因芯片
FISH
Tag-lt Cystic Fibrosis kit Invader Molecular Assay
Number of articles per yea谢r f谢ro阅m读1999 to 2011 that included
15
the term “personalized figures on Pubmed ”
个体化医学
2020-5-28
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16
GWAS分析方法
1）基因组规模微阵列基因分型平台，确定SNP和插入/缺 失和拷贝数变异区域（copy number variation,CNVS）
改进
质理管理的习惯养成需要时间。
2020-5-28
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9
几个策略比较
家族病史研究与基因研究相比较 说法不一，孰优孰劣？各有所长。 肿瘤早期诊断带来的真正收益有没有我们所
希望的那么大？
2020-5-28
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10
国家自然科学基金委医学部主任、国家肝癌科学中心主任—王红阳院士，
WHO has developed three principles for cancer issues
人类染色体7p13-q22区，第19位外显子的缺失、 L858R、T790M、G719X、L861Q、S7681、 第20位外显子的插入等，以前两者居多，占所有 突变的90%
KRAS突变
野生型治疗效果 较好 突变型治疗效果 差
野生型治疗效果 较差 突变型治疗效果 好
乳腺癌
核赛叮
Her2/neu表达
（Herceptin，
焦磷酸测序法
HRM ARMS
优点
缺点
可以检测所有突变 不灵敏，操作繁琐，易污染
无特殊设备、价廉 不能定量、不能确定特殊突变
无特殊设备、简便、 快捷、灵敏
准确，可以检测质量 的样本
可以检测所有突变
不能对突变精确定位 测序长度短、易污染 复杂，操作繁琐
灵敏度高，周期短
需要特殊探针，每次只能检 测一种突变
2020-5-28
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14
个体化医学的发展趋势
280 260 240 220 200 180 160 140 120 100 80 60 40 20
1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011
2020-5-28
Current prevention strategies could block up to one-third of all new cancer
Improved early sreening could result in the detection of one-third of cancer at an early stage。
2020-5-28
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4
2010年:
《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办 法》（卫办医政发【2010】194号）
《医疗机构临床基因扩增检验室工作导则》 （卫办医政发【2010】194号）
2020-5-28
全国按照所制定的标准 通过验收的临床基因扩增检验实验室共 2670余家。采用所编写的培训教材和培训 模式共举办了培训班280多期，培训实验室 技术人员21000多人。涉及全国28个省、 直辖市和自治区。
2）比较基因组杂交芯片（comparative genomic hybridization arry,CGH array）检测染色体拷贝数 变化
3）转录水平的基因表达平台(检测mRNA表达水平) 4）大型数据集分析软件
2020-5-28
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常用的基因突变检测方法优缺点比较
检测方法 直接测序法 RFLP SSCP
2020-5-28
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