黑河干流发源于青海省走廊南山南麓和讨赖山北麓，从我省的肃南县入境，途经甘州区、临泽县、高台县，于金塔县出境流入内蒙古自治区，最后入居延海。黑河干流全长约956公里（从祁连山发源地到尾闾居延海的长度），年均径流量亿立方米。
山丹河发源于祁连山区冷龙岭北坡。流经山丹一个县，最后注入祁家店水库。河长约200公里，年均径流量亿立方米，。
（一）黄河干流水系
黄河干流水系包括干流上游玛曲段及下段积石关到黑山峡段，主要支流有大夏河、庄浪河、祖厉河、白河、黑河、西科河、银川河、宛川河等。
黄河干流：黄河干流玛曲段从青海省的久治县入境，由西向东流至文保滩后向北流，因受西倾山的阻挡又朝西流去，在玛曲境内180度的大转弯，又流回青海省，形成了一个状如“U”形弯曲，成为九曲黄河十八弯的第一弯。积石关至黑山峡段即黄河兰州段区间，干流由青海循化县横穿积石山入境，经临夏、永靖，兰州，白银，从靖远县黑山峡出境。黄河干流在我省内长度913公里，其中上段433公里，下段480公里，流域面积56695平方公里，黄河兰州段平均年径流量312.6亿立方米（兰州水文站）。多年平均自产水资源总量44.9亿立方米。
3、西科河
发源于玛曲县西北阿尼玛山，上游称喀儿科河，由南向北流，流至35.8公里，纳西科河北支，转向东流称西科河，在玛曲县西科河羊场，行64.8公里入黄河。河源高程3321米，河道全长64.8公里，平均比降%，河口高程3321米，流域面积1003平方公里，年平均径流量亿立方米。
4、银川河
发源于积石山县小积石山的雪积山一带，河源高程4240米，由西向东流，在积石山县银川乡汇入黄河。河道全长46.2公里，河口高程1685米。流域面积457平方公里，平均比降%。年平均径流量亿立方米。
讨赖河发源于祁连山讨赖南山东段。流经肃南县、嘉峪关市及金塔县，最后注入鸳鸯池水库，全长68公里，年均径流量6.2亿立方米。
3、石羊河水系
石羊河流域诸河皆发源于祁连山冷龙岭北麓，河流短促，无主次之分。自东向西较大的河流有：大靖河、古浪河、黄羊河、杂木河、金塔河、西营河、东大河、西大河八条河流。西大河及东大河部分水量在下游汇成金川河入金川峡水库，其余六条河流出山后进入河西走廊武威灌区，水量大部分引灌及渗入地下，后又以泉水形式溢出地表，形成众多的泉水河道，交汇成石羊大河，此后河流向北穿过红崖山进入民勤盆地，经引灌蒸发而消失石羊河水系水资源总量为17.1亿立方米。
榆林河发源于祁连山脉的大雪山北坡和野马山北坡的冰川群，流经肃北及安西两县，注入榆林河水库。河长118公里，年均径流量亿立方米。
石油河发源于祁连山脉的石油河垴、鸭儿河垴冰川及疏勒山，流经肃北县及玉门市。注入赤金峡水库。河长130公里，年均径流量亿立方米。
白杨河发源于祁连山区吊大板，流经肃南县及玉门市，注入白杨河水库，河长90公里，年均径流量亿立方米。
西营河发源于祁连山之冷龙岭，河流流经肃南县及凉州区，河长124
表1甘肃省内陆河流域主要河流特征表
水系
河流名称
发源地
流入地
流出地
汇入河流名称
流经县（区）
河长
（公里）
河流径流量
（亿立方米）
自产水资源
总量
（亿立方米）
苏干湖
大哈尔滕河
阿克塞县党河南山
苏干湖
阿克塞县
320
疏勒河
党河
肃北县疏勒南山
肃北县、敦煌市
390
疏勒河
肃北县疏勒南山
肃北县、玉门市、瓜州县
945
榆林河
肃北县祁大雪山及野马山
肃北县、瓜州县
118
石油河
肃北县疏勒南山
肃北县、玉门市
130
白杨河
肃南县祁连山脉
肃南县、玉门市
90
黑河
讨赖河
肃南县的讨赖南山
肃南县、嘉峪关市、金塔
68
洪水河（酒泉）
肃南县托来山
讨赖河
肃南县、肃州区Biblioteka 70丰乐河肃南县走廊南山
山丹县
200
石羊河
西大河
肃南县祁连山脉的冷龙岭
金川河
肃南县、永昌县
124
东大河
肃南县祁连山脉的冷龙岭
肃南县、永昌县
133
3
3
西营河
肃南县祁连山脉的冷龙岭
肃南县、凉州区
124
金塔河
天祝县祁连山脉
天祝县、凉州区
102
杂木河
天祝县祁连山脉
天祝县、凉州区
75
黄羊河
天祝县祁连山脉
天祝县、凉州区
105
古浪河
天祝县祁连山脉
天祝县、古浪县
137
大靖河
天祝县祁连山脉
天祝县、古浪县
40
公里，年均径流量亿立方米。
东大河发源于祁连山之冷龙岭，河流流经肃南县及永昌县，河长133公里，年均径流量亿立方米。
西大河发源于祁连山之冷龙岭，河流流经肃南县及永昌县，河长124公里，年均径流量1.6亿立方米。
二、黄河流域
省内黄河流域分黄河干流（包括支流庄浪河、大夏河、祖厉河及直接入干流的小支流）、洮河、湟水、渭河、泾河五个水系。年径流量大于1亿立方米的河流除上述五个水系的干流外，还包括各水系的一、二级支流31条。我省黄河流域多年平均水资源总量127.8亿立方米，其中地表水资源量125.2亿立方米，地下水资源量2.6亿立方米。入境水资源量239.6亿立方米，出境水资源量341.1亿立方米。
民乐洪水河发源于祁连山区的龙孔岭北坡，流经民乐一个县，注入双树寺水库，主河道全长37公里，年均径流量1.2亿立方米。
大堵麻河发源于祁连山的野牛山北坡，流经肃南县及民乐县，注入瓦房城水库，河长约21公里，年均径流量亿立方米。
临泽梨园河发源于祁连山区的柴达诺山，流经肃南县及临泽县后注入黑河，河道上游建有鹦鸽嘴水库，河长143公里，年均径流量2.1亿立方米。
（二）洮河水系
洮河水系主要河流包括洮河干流、支流周科河、科才河、括合曲、博拉河、车巴沟、卡车沟、大峪沟、迭藏沟、羊沙河、冶木河、漫坝河、三岔河、东峪沟、大碧河、广通河。
洮河干流发源于青海省海南州境内的西倾山北麓勒尔当，在我省碌曲县境西部的西倾山东麓流入我省。洮河流经碌曲、夏河、卓尼、临潭、渭源、临洮、永靖等县,在永靖县刘家峡水库大坝上游流入黄河。全程长673.1米，比降，流域面积25527平方公里，河源高程4260米，多年平均河流径流量亿立方米（红旗水文站）。自产水资源总量47.2亿立方米。
酒泉马营河发源于祁连山脉北麓，流经肃南县及肃州区，河道水量全部被引完，河长约20公里，年均径流量1.1亿立方米。
丰乐河发源于祁连山脉的走廊南山，流经肃南县及肃州区，河道水量全部被引完，河长约100公里，年均径流量亿立方米。
酒泉洪水河发源于祁连山北麓的托来山，流经肃南县及肃州区，最后注入讨赖河。河长70公里，年均径流量2.5亿立方米。
6、庄浪河
发源于祁连山冷龙岭东端的得尔山、抓卡尔山。河源高程4248米，上游称金强河，由北向南东流，经扎龙掌、华藏寺，由天祝县界牌村入永登县境，行程94.8公里，抵武胜驿，绕永登县城西下流至岗镇注入黄河，河口高程1550米。全长184.8公里，比降～‰。流域面积4008平方公里，年平均径流量亿立方米。
主要支流：
1、白河
发源于四川境内的加日顶及龙日坝。河源高程在3600～4440米，由南向北流，流域面积5488平方公里，河长269.9公里，于甘肃省玛曲县入黄河，河口高程3400米，平均纵坡～%。
2、黑河
发源于四川省境内若尔盖县的麦洼及色洼，由班佑河及格曲两河在若尔盖汇流而成黑河。于四川省磁化县诺尔杰尔沟入甘肃省碌曲县境，在玛曲渔场牧场入黄河。河长455.9公里，在省内长50.4公里。流域面积7608平方公里。流经若尔盖沼泽草地，河道弯曲，两岸多滩地。河源高程4100米，河口高程3400.5米。
7、宛川河
发源于榆中县南部马衔山北麓，河源高程3287米，由西向东流，上游19.7公里修建高崖水库，经榆中县甘草店、夏官营，在桑园峡出口的响水子注入黄河。河口高程为1498米，全长93公里，流域面积1862平方公里，多年平均径流量亿立方米。
8、祖厉河
发源于通渭县北部华家岭，河源高程在2450米，由北向南流13.2公里进入会宁县境，继续北流71.9公里时纳苦水河，经会宁县城、甘沟、郭城进入靖远县苏家湾村，在靖远县城西三公里处注入黄河。河口高程1393米，河道全长224.1米，比降～‰，流域面积10653平方公里，年平均径流量亿立方米。
1、周科河
发源于碌曲县境西倾山东麓及郭尔莽梁,河源高程4209米,由南向北流，在碌曲县境内汇入洮河，全长82.1公里，河口高程3190米，流域面积1224平方公里，平均比降‰，年平均径流量3.06亿立方米。
2、科才河
发源于夏河县西南部完根扫地，河源高程4220米，由北向南流，进入碌曲县后汇入洮河，全长66.5公里，河口高程3155米，流域面积1394平方公里，河道平均比降‰，年平均径流量亿立方米。
2、黑河水系
黑河水系以黑河为干流，自东向西主要支流有山丹河、民乐洪水河、大堵麻河、临泽梨园河、酒泉马营河、丰乐河、酒泉洪水河及讨赖河，历史上各主要支流均汇入黑河干流，1947年在讨赖河建成鸳鸯池水库后，讨赖河、酒泉洪水河湮灭于金塔盆地。按目前地表水力的联系，黑河水系可分为东、中、西三个相对独立的子水系，其中东部子水系包括黑河干流、梨园河及其它支流；中部子水系包括酒泉马营河至丰乐河间诸小河流；西部子水系包括酒泉洪水河至讨赖河间诸小河流。黑河水系水资源总量为23.1亿立方米。
1、疏勒河水系
疏勒河水系以疏勒河为干流，主要支流有大哈尔腾河、党河、榆林河、石油河及白杨河，这些支流虽不汇入疏勒河、但习惯上仍划归为疏勒河水系。各河流均发源于祁连山脉，水量自产并全部消耗于我省内。疏勒河水系水资源总量为21.2亿立方米。
疏勒河干流发源于祁连山脉的疏勒南山东段纳嘎尔当，河流出山后流经我省的肃北县、玉门市及瓜州县，注入双塔堡水库，下游水量只能引灌到西湖农场，已无余水下泄，疏勒河流域干流总长945公里，年均径流量8.7亿立方米。