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生物化学第十章核酸的酶促降解和


H2O
O
H2O
HO H2N
C
CH-CH3
C O
N H
CH2
β-脲基异丁酸
嘧啶核苷酸与嘌呤核苷酸分解代谢最大 的不同是嘧啶环的裂解,最后生成β-氨基酸
嘧啶碱的降解产物易溶于水,故嘧啶代 谢异常的疾病较少。
第三节 核苷酸的生物合成
核苷酸在细胞内合成有两条基本途径: 1、从头合成或从无到有途径:由AA、磷酸 戊糖、CO2 和NH3 等简单的化合物合成核苷酸 2、补救途径:由预先形成的碱基或核苷合成 核苷酸。
第二节 核苷酸的降解
一、核苷酸的降解
核苷酸酶
核苷磷酸化酶 碱基 + 戊糖-1-磷酸
核苷酸
核苷
(生物体内广泛存在)
磷酸
核苷水解酶
碱基 + 戊糖(植物和微 生物)
1、嘌呤的降解 2、嘧啶的降解
二、嘌呤的分解代谢
嘌呤核苷酸的结构
AMP
GMP
二、嘌呤的分解代谢
AMP GMP
H 黄嘌呤氧化酶
(次黄嘌呤)
三、脱氧核苷酸的合成
1、脱氧核苷酸的合成 2、脱氧胸腺嘧啶核苷酸的合成
O
O
HO P O P O
O 碱基
OH OH H H
HH
NADPH+H+
NDP
OH OH
NADP+ +H2O
O
O
HO P O P O
O 碱基
在核苷二磷酸水平
OH OH H H H H
被还原而成
dNDP
OH H
NDP ADP GDP UDP CDP
二、核酸酶
2、核酸酶的功能
生物体内的核酸酶负责细胞内外催化核 酸的降解
参与DNA的合成与修复及RNA合成后的剪接等重要基因 复制和基因表达过程
负责清除多余的、结构和功能异常的核酸,同时也可 以清除侵入细胞的外源性核酸
在消化液中降解食物中的核酸以利吸收 体外重组DNA技术中的重要工具酶
核糖核苷酸还原酶 核糖核苷酸还原酶 核糖核苷酸还原酶 核糖核苷酸还原酶 核糖核苷酸还原酶
TDP
dNDP dADP dGDP dUDP dCDP
dTDP
dNDP+ATP dADP+ATP dGDP+ATP dUDP+ATP dCDP+ATP
dNDP
激酶 激酶 激酶 激酶 激酶
磷酸酶
? dTTP
dNTP+ADP dATP +ADP dGTP+ADP dUTP+ADP dCTP+ADP
结合 2. 先合成UMP

3. 在IMP基础上完成AMP和 GMP的合成
3. 以UMP为基础, 完成CTP, dTMP的合成
RNAase T1
Pu :嘌呤
Py:嘧啶
限制性内切酶
具有识别双链DNA分子中特定核苷酸序列,并由此切割DNA 双链的核酸内切酶统称限制性内切酶(ristriction endonuclease)。
这些酶主要是从细菌中分离得到,能识别特定的核苷酸 顺序,但在细菌本身的DNA 中,这些顺序已被(甲基化酶) 甲基化,因而不被水解,也就是说这些酶仅限于水解外源 DNA 以保护自身,故称为“限制性”酶。限制酶都以内切方 式水解DNA,产物5ˊ为p,3ˊ为OH。
依据底物不同分类
DNA酶(deoxyribonuclease, DNase):专一降解DNA RNA酶 (ribonuclease, RNase):专一降解RNA。 非特异性核酸酶
依据切割部位不同 核酸内切酶:分为限制性核酸内切酶和非特异性限制性 核酸内切酶。 核酸外切酶:5´→3´或3´→5´核酸外切酶。
Asp
N1
甲酰基
C2
(一碳单位)
CO2
甘氨酸
C
N
7
6C
5
4 C 3 N
C 甲炔基
8
(一碳单位)
N9
N5,N10-次甲基四氢叶酸
Gln(酰胺基) 甘氨当中站, 谷氮坐两边,
左上天冬氨, 头顶CO2 还剩下一个一碳单位
合成原料:天冬氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、 一碳基团、CO2、磷酸核糖。
合成特点:磷酸核糖为起始物,逐步加原料 合成嘌呤环,形成重要中间产物 IMP(次黄嘌 呤核苷酸),再由它转变为AMP和GMP。
C Gln N 3 4 5 C CO2 C 2 1 6 C
N
HOOC H2C HC NH2
HOOC
Asp
天冬氨酸列右边 谷氨酰胺左上边
剩下一个CO2
合成原料:谷氨酰胺、天冬氨酸、CO2、磷 酸核糖。
合成特点:用原料先合成嘧啶环,然后再与 磷酸核糖连接生成嘧啶核苷酸。
• 合成过程
1) 尿嘧啶核苷酸的合成
•过程 1. IMP的合成 2. AMP和GMP的生成
PP-1-R-5-P
AMP ATP
(5’-磷酸核糖-1’-焦磷酸) PRPP合成酶
PRPP
谷氨酰胺
酰胺转移酶 谷氨酸
R-5-P
(5-磷酸核糖)
H2N-1-R-5´-P
(5´-磷酸核糖胺)
IMP
在谷氨酰胺、甘氨酸、一 碳单位、二氧化碳及天冬 氨酸的逐步参与下
嘧啶核苷酸的结构
三、嘧啶的分解代谢
核苷酸酶
嘧啶核苷酸
核苷
PPi
1-磷酸核糖
核苷磷酸化酶
嘧啶碱
还原反应
开环
脱氨氧化
还原反应
开环
嘧啶核苷酸
核苷酸酶 嘧啶核苷
核苷酶
嘧啶
NH2
C
N
CH
C
CH
O
N H
胞嘧啶
NH3 HN
O NADPH+H+
C
CH
C
CH
O
N H
尿嘧啶
O NADP+
C
HN
CH2
C O
N H
2、嘌呤核苷酸的补救合成途径
利用体内游离的嘌呤或嘌呤核苷,经过 简单的反应,合成嘌呤核苷酸的过程,称为 补救合成(或重新利用)途径。
•参与补救合成的酶
腺嘌呤磷酸核糖转移酶 (adenine phosphoribosyl transferase, APRT) 次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶(hypoxanthineguanine phosphoribosyl transferase, HGPRT) 腺苷激酶(adenosine kinase)
外切核酸酶对核酸的水解位点
BBBBBBBB
5´ p
p
p
p
p
p
p
p
OH 3´
牛脾磷酸二酯酶
( 5´端外切5得3)
蛇毒磷酸二酯酶
( 3´端外切3得5)
内切核酸酶对RNA的水解位点示意图
Py Pu Py Py G A C U G A

p
p
p
p
p
p
p
p
p
p
OH


RNAase I RNAase I RNAase T1
•合成过程
腺嘌呤 + PRPP APRT AMP + PPi 次黄嘌呤 + PRPP HGPRT IMP + PPi
鸟嘌呤 + PRPP HGPRT GMP + PPi
腺嘌呤核苷
腺苷激酶
AMP
ATP ADP
•补救合成的生理意义
补救合成节省从头合成时的能量和一些氨 基酸的消耗。
体内某些组织器官,如脑、骨髓等只能进 行补救合成。
dNMP+Pi
脱氧核苷酸的具体生成过程
核糖核苷酸还原酶,Mg2+
NDP
dNDP
还原型硫氧化 还原蛋白-(SH)2
氧化型硫氧化 还原蛋白 S
S
NADP+
NADPH+H+
硫氧化还原蛋白还原酶 (FAD)
脱氧胸腺嘧啶核苷酸(dTMP或TMP)的合成
dUDP
O
O
C Pi HN CH
dTMP合成酶
C
HN
C-CH3
限制性内切酶的命名和意义
三字母: 属名+种名+株名
例:Eco R I,这是从大肠杆菌(Ecoli)R菌珠中分离出的一种限制性内切酶
Eco R I
属名 种名 株名 序号
限制性内切酶是分析染色体结构、制作DNA限制图谱、 进行DNA序列测定和基因分离、基因体外重组等研究中不可缺 少的工具,是一把天赐的神刀,用来解剖纤细的DNA分子。
NH3
C O
N CH dR-5'-P
O N5,N10-甲烯FH4
FH2
FH4 FH2还原酶
C
N CH dR-5'-P
NADP+ NADPH+H+
dCMP
dUMP
dTMP
dTMP
激酶
dTDP

激酶
dTTP
ATP
ADP
ATP
ADP
核 苷 酸 的 合 成 及 相 互 关 系
嘌呤核苷酸与嘧啶核苷酸合成的比较
嘌呤核苷酸
嘧啶核苷酸
1. 合成原料基本相同

2. 合成部位对高等动物来说,主要在肝脏
同 点
3. 都有2种合成途径(从头和补救途径) 4. 都是先合成一个与之有关的核苷酸,然后在此基础上进
一步合成核苷酸
1. 在5'-P -R基础上合成嘌呤环 1. 先合成嘧啶环再与 5'-P-R
不 同
2. 最先合成的核苷酸是 IMP
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