核酸的酶促降解和核苷酸代谢
谷氧还蛋白
硫氧还蛋白
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
5-磷酸核糖-1-焦磷酸 (Phosphoribosyl pyrophosphate PRPP) PRPP是嘌呤核苷酸和嘧啶核苷酸从头合成的重要中间产物,也 参与嘌呤核苷酸和嘧啶核苷酸的补救合成。它是由PPP代谢途 径中的重要物质5-磷酸核糖经PRPP焦磷酸激酶催化与ATP反应而 生成的,是核苷酸合成的极其重要的前体。
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
1.1 核酸酶—核酸外切酶
1957年在曲霉(Aspergillus)中分离提纯出RNaseT1,由105个AA组成。专一水解鸟苷 酸二酯键,产生 3-GMP或以3-GMP为末端的寡核苷酸。
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1.2脱氧核糖核酸酶
脱氧核糖核酸酶(DNase):专一水解DNA。 内切酶:切断双链或单链。 外切酶:有5→3切割或3→5切割。
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3.5 脱氧核苷酸的合成
2- 脱氧核糖核苷酸是 DNA 合成前体 , 由相应的核苷还原酸通过以氢代替 2OH基团还原得来。通常是在核苷二磷酸水平上发生还原反应 ; 一些微生物如乳 酸杆菌,枯草杆菌等则以核苷三磷酸为还原底物。 催化核糖环还原 的核糖核酸还原酶有两种类型 第一类酶在自然界广泛分布并存在于哺乳动物细胞中. 由一种以上多肽链 组成,含有非正铁血红素, 对核苷 二磷酸的还原作用有专一性。
第二类酶在某些微生物中,只含有一种多肽链,需要钴胺素(VB12)作为辅 酶,不含非正铁血红素,是在核苷二磷酸还是三磷酸水平上的还原则取 决于酶的来源。
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3.5 脱氧核苷酸的合成
大肠杆菌的I型酶系:含有四种蛋白 硫氧还蛋白(thioredoxin):是小分子电子传递蛋白,分子中有两个Cys 残基。 硫氧还蛋白还原酶(thforedoxin reductase):催化下,硫氧还蛋白分子中的 两个Cys残基,在氧化型硫氧还蛋白中Cys之间形成二硫键,由 NADPH供给氢,而被还原为两个-SH,作为核糖核苷酸还原反应 中还原性底物。 蛋白质B1和B2:蛋白质B1和B2是核糖核酸还原酶的不同亚基,B1上有 底物结合部位和变构部位,B2上有催化部位。B1和B2只有合在 一起并且有镁离子存在时,才形成有催化活性的复合物。
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2.1 核苷酸的水解
核苷经核苷酶(nudeosidase) 分解为嘌呤或嘧啶和戊糖。 核苷水解酶(nucleoside hydrolase)
核苷磷酸化酶(nucleoside phosphorylase)
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2.2 嘌呤的降解
腺嘌呤和鸟嘌呤经脱氨氧化转变为黄嘌呤再进行降解。
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AMP和GMP合成
延胡索酸
天冬氨酸 腺苷酸代琥 珀酸裂解酶 腺苷酸代琥 珀酸合成酶
腺苷酸
次黄嘌呤 脱氢酶 黄嘌呤-谷氨 酰胺 氨基转 移酶(GMP 合成酶)
黄嘌呤
鸟苷酸
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3.2 嘌呤核苷酸合成的调控
Regulatory mechanisms in the biosynthesis of adenine and guanine nucleotides in E. coli. Regulation of these pathways differs in other organisms.
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嘧啶碱的直接利用
尿嘧啶磷酸核糖转移酶催化尿嘧啶转变成尿苷酸,目前
尚未发现胞嘧啶磷酸核糖转移酶 。在 UMP的生物合成途径
中,有乳清酸磷酸核糖转移酶催化乳清酸生成乳苷酸的反应。
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核苷的直接利用
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核苷二磷酸、核苷三磷酸的合成
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胸腺嘧啶核苷酸的合成
胸腺嘧啶脱氧核苷酸,由dUMP在dTMP合成酶催化下甲基化生成, 叶酸衍 生物作为一碳单位供体和还原剂。
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胸腺嘧啶核苷酸的合成与肿瘤抑制
重氮丝氨酸 氟尿嘧啶
阿西维辛
甲氨蝶呤
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3.4 核苷酸合成的救补途径(salvage pathway)
哺乳动物和微生物中,存在许多催化嘌呤和嘧啶合成单 核苷酸的酶,使核酸降解产物或外源补充的碱基得到直接利 用。
用放射性同位素标记的碱基和核苷,常常用于
研究核酸 合成,其原理就是依据“补救途径”。
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嘌呤碱的直接利用
哺乳动物和微生物中,存在许多催化嘌呤和嘧啶 合成单核苷酸的酶,使核酸降解产物或外源补充的碱 基得到直接利用。
核酸 核酸酶 核苷酸
核苷
核苷酸酶 碱基 嘌 呤 分 解 嘧 啶 分 解
磷酸
戊糖
核苷酶
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1 核酸的酶促降解
生物体内存在多种降解核酸酶类,统称为核酸酶(nuclease) ,在核酸降解和周转中 起着重要作用。ຫໍສະໝຸດ 核酸的酶促降解和核苷酸代谢
1.1 核酸酶—核酸外切酶
外切酶作用于核酸链一端,逐个水解下核苷酸,是非特异性磷酸二酯酶。 蛇毒磷酸二酯酶从DNA或RNA的游离3-羟基端开始,逐个水解下5-核苷酸; 牛脾磷酸二酯酶从游离 5-羟基端开始,逐个水解下3-核苷酸。
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3 核苷酸的生物合成
从头合成(de novo synthesis)
合成途径
利用氨基酸、磷酸戊糖、CO2和NH3等简单的化 合物合成核苷酸。 救补途径(salvage pathway) 利用核酸降解或进食等从外界补充的 含氮碱基或核苷合成新的核苷酸。
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
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3.3 嘧啶核苷酸的合成
Pyrimidine nucleotides are made from aspartate, PRPP, and carbamoyl phosphate.
尿嘧啶的生物合成
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
胞嘧啶的生物合成 尿嘧啶核苷酸转变为胞嘧啶核苷酸是在核苷三磷酸的 水平上进行的。 在细菌中UTP直接与NH3作用产生CTP。动物组织中由 Gln提供NH3,反应要有ATP供能,由CTP合成酶催化 反应。
尚未发现有碱基专一性DNase,但有序列专一性,即限制性 内切酶(restriction endonuclease)。
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1.3 限制性内切酶(restriction endonuclease)
限制性内切酶,restriction enzyme,在某些细菌细胞内存在的一类能识别 一定序列并水解外源dsDNA的核酸内切酶,并形成粘性末端("sticky" ends) 或平齐末端(“blunt" ends) 。
生物体内核苷酸常以核苷二磷酸(d)NDP ,核苷三磷酸(d) NTP形式参与合成 反应。是在 (d) NMP 水平上,ATP提供Pi,由相应专一激酶催化合成的。
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核苷二磷酸、核苷三磷酸的合成
核苷二磷酸激酶(nucleoside diphosphoate kinase)使核 苷二磷酸和核苷三磷酸相互转变。 核苷二磷酸激酶特异性很低,所有核苷二磷酸和核苷 三磷酸都可以作为磷酸根的受体和供体。
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
“blunt" ends
回文结构
"sticky" ends
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
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限制性内切酶命名
EcoRI: 第1个大写E:大肠杆菌属名(Escherichia)第1个字母; 第2,3小写co:种名(coli)的头两个字母; 第4个大写R: 所用大肠杆菌的菌株; 第5个罗马字:从该细菌中分离出来这一类酶的编号。
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xanthine oxidase
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嘌呤代谢与痛风(gout) 黄嘌呤氧化酶(Xanthine oxidase)
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次黄嘌呤 别嘌呤醇
奥昔嘌醇
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2.3 嘧啶的降解
嘧啶分解时有氨基的首先水解脱氨基。 胞嘧啶首先水解脱氨基,转化为尿嘧啶。 尿嘧啶和胸腺嘧啶经还原打破环内双键,水解开环成链状化合物,再水解 成CO2, NH3, -丙氨酸,-氨基异丁酸, -氨基异丁酸脱氨基后进入有机酸代 谢或直接排出体外。
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
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核酸的酶促降解和核苷酸代谢
2 核苷酸的分解代谢
核苷酸经核苷酸酶(nucleotidase)催化,水解为核苷及无机 磷酸。 非特异性的核苷酸酶,能作用于一切核苷酸。 特异性强的核苷酸酶只能水解3-核苷酸或5-核苷酸,分 别称为3-核苷酸酶或5-核苷酸酶。
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
1 核酸的酶促降解
2 核苷酸的分解代谢
3 核苷酸的生物合成
第三部分:生物大分子前体的合成
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
基本要求: (1)掌握常见核酸酶、核苷酸的合成代谢 (2)理解核苷酸的合成的补救途径 (3)了解核苷酸的分解代谢
教学重点及难点:
(1)限制性内切酶 (2)核苷酸的合成代谢
核苷酸的生物合成与癌症治疗
北宋( 1170年)东轩居士著《卫济宝书》:“痈疽五发,一 曰癌……”。
核酸的酶促降解和核苷酸代谢
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