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医学遗传学设计实验-完整ppt课件
❖ 4.1.2 提取胎儿游离DNA: ❖ (1)离心
第一次离心:经预处理后的血浆以1600×g的速度 离心10min,离心后取上清液置一20℃保存备用;
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第二次离心:将第一次离心后的上清液以13000— 16000×g的速度高速离心10min,离心后取上清液 置一20℃保存备用。
❖ (2)提取胎儿游离DNA: 取出上清液按照血样DNA提取试剂盒(QIAamp DNAbloodmini, Qia2gen)说明书中血液DNA的提 取方案提取DNA。
结果可能获得10kb、14kb两种长度的含a珠蛋白基
因簇的DNA片段。
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❖ 2.琼脂糖凝胶电泳
(1)加样:取18μl胎儿DNA酶处理液与2μl的DNA上 样缓冲液混匀,用微量移液枪小心加入样品槽中。
(2)电泳:加完样后,插上导线,打开电源,按 照 需 要 调 节 电压至120V,电泳开始,观察电泳槽中 负极的铂金丝处是否有气泡出现。
防止遗传病、先天畸形患儿出生的最有效而可行的
方法,对于减少群体中致病基因频率和提高人口素
质具有十分重要的意义。
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❖ 传统产前诊断方法一般采用羊膜腔穿刺、绒毛膜取 样和脐静脉穿刺等,它们都具有创伤性,可能对孕 妇及胎儿造成一定危害,如宫内感染、出血甚至流 产、死胎等。利用孕妇外周血中游离的胎儿DNA进 行产前诊断是一项非创伤性产前诊断技术,易于被 孕妇接受。
(3)当溴酚蓝条带移动到距凝胶前沿约1cm时,将 电压回零,关闭电源,停止电泳。
(4)取出凝胶,在波长为302nm的紫外灯下观察染 色后的电泳胶板。DNA存在处显示出肉眼可辨的桔 红色荧光条带。
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❖ 3.转膜:
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❖ 4.1.3 利用PCR技术进行胎儿DNA扩增:
采用15 bp的随机引物,反应体系为: l0×PCR缓 冲液5μl ,Taq酶5 U,25 mmol/L MgC12 5 μl , 2.5 mmol/L dNTP 4μl , 200 mmol/L 15 bp随 机引物5 μl ,加双蒸水至50 μl ,置于基因扩增仪 上。反应条件为94℃预变性4 min 后,开始循环: 94℃ 1 min,37℃ 2 min,55℃ 4 min,循环30次, 最后72℃ 延伸5 min,4℃保存。
❖ 孕妇外周血中游离的胎儿DNA含量相对高,提取及 分析过程简单,易于发展为可应用于临床的大样本 高通量的检测方法。另外胎儿DNA在孕早期就可检 测到,且分娩后很快被清除,不会受前次妊娠的影 响。
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❖ PCR技术能在体外快速简便地扩增特异的DNA片段, 为基因诊断分析提供了方便,被广泛运用于遗传病 和肿瘤的基因诊断。若PCR产物的片段中包含有 RFLP的切点,则可将PCR扩增产物用相应的限制 酶处理,经电泳后检测其多态性,结合系谱进行分 析,可进行基因诊断。
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3.实验材料、试剂及器材
❖ 3.1 材料:
孕妇的新鲜外周血5 ml、琼脂糖凝 胶(新制备)、 硝酸纤维素滤膜(NC膜)、透明胶带、防护眼镜、 塑料瓶、塑料袋、保鲜膜、滤纸、X光底片
❖ 3.2 试剂:
EDTA(乙二胺四乙酸)盐抗凝剂,0.12 ml 10% 的中性buffer溶液(含4 %的甲醛),QIAamp DNA提 取试剂盒(Qiagen);Taq酶(Takara),双蒸水, PCR缓冲液, dNTP (Promega), AmpF1STR@ 扩增试剂盒(ABI);BamHI内切酶,DNA上样缓冲 液,放射性物质(32p),变性液,预杂交液, 2×SSC(50%甲酰胺),X光片冲洗液。
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❖ 4.1.4利用Southern分子印迹杂交法检测出限制性 片段长度多态性(RFLP)进行基因诊断
❖ 1.用BamHI内切酶酶处理扩增产物,反应体系如 下:
待酶切DNA 1μg
双蒸水
适量
10X Buffer BamHI 2μl
BamHI
0.5-1μl
总体积
20μl
37℃孵育1小时或更长时间
医学遗传学设计实验
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实验设计方案:
一、实验名称 :
二、总体设计思路:
三、具体设计方案:
1.实验目的
2.实验原理
3.实验材料、试剂及器材
4.实验方法及注意事项
5.实验预期结果及遗传指导
6.参考从孕妇外周血中提取胎儿 DNA进行a地贫的产前诊断
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二、总体设计思路:
抽取孕妇外周血 → 提取胎儿DNA → 利用 PCR技术进行胎儿DNA扩增 → 利用Sou-thern分 子印迹杂交法检测出限制性片段长 度多态性(RFLP)进行基因诊断【用DNA限制酶处 理扩增产物 → 琼脂糖凝胶电泳 → 转膜 →探针标记 → 预杂交 → Southern杂交 → 洗膜 → 放射性自显 影检测】
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❖ Southern分子印迹杂交是将酶解后的DNA片段经 琼脂糖凝胶电泳分离,然后经碱变性,Tris缓冲液 中和,高盐下通过吸附作用将DNA从凝胶中转印至 硝酸纤维素滤膜上,附着在滤膜上的DNA与32p标 记的探针杂交,利用放射自显影技术确定探针互补 的每条DNA带的位置,从而可以确定在众多酶解产 物中含某一特定序列的DNA片段的位置和大小。此 法可检测出限制性片段长度多态性(RFLP),从 而进行基因诊断。
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三、具体设计方案:
1.实验目的
❖ 利用孕妇外周血中游离的胎儿DNA进行a地贫的产 前诊断,从而进行遗传指导。
2.实验原理:
❖ 地中海贫血的分布遍及全世界,我国南方省区的发
病率也较高,如广西壮族自治区可高达14.6%,其
次为广东、海南、云南等。在遗传咨询的基础上,
对高风险的胎儿进行产前诊断和选择性终止妊娠是
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❖ 3.3 主要仪器:
离心机,冰箱,基因扩增仪、微量移液枪(20μl), 电泳仪,紫外透射仪,封口器,southern印迹杂交 实验仪器,水浴锅(0℃,42℃,100℃),琼脂糖 平板电泳装置,放射性检测仪,暗盒(加双侧增感 屏)
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4.实验方法及注意事项
4.1 方法步骤:
❖ 4.1.1 血浆制备: 抽取孕妇外周血5 ml,加入EDTA抗凝剂,0.12 ml 10% 的中性buffer溶液(含4 %的甲醛)进行预处 理。