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培养基筛选的利器试验设计DesignofExperimentDOE-Sartorius

本文中主要介绍了 DOE 中的混料设计(Mixture Design)在培养基混合筛选中的应用。
在传统的培养基筛选中,往往是将细胞株分别培养于 3~10 种培养基,而后对目标产物的产 率,以及质量进行检测,从而来筛选适合的培养基。这种方法至今为止也是广泛使用的,然 而在某些情况下未必能够满足生产要求。在培养基筛选过程中,往往会发现细胞在某种培养 基中能够达到很高的细胞密度,然而 PCD 不高,而另外一种培养基,PCD 较高,细胞密度 较低。或者,一种培养基得到高产率,而另外一种得到高质量。在这样的状况下,培养基混 合很可能会是一个简单快捷的解决方案。
实验结论 由此可见,Y 的预测最大值为 6.26mg/ml,而此时Байду номын сангаас PowerCHOTM1,PowerCHOTM2,ProCHOTM4 分别为,40%,60%和几乎为 0%,也即从实验结果可以得出,proCHOTM4 在三种培养基混 合中对达到最高产率无显著作用,最佳的混合配比为 PowerCHOTM1:PowerCHOTM2=4:6。 需要强调的是,DOE 只是在实验中辅助我们最优化的设计实验,模型可靠性最终还是依赖于 根据工作表进行的实验结果是否准确,可重复。而最后得到的结果,也需要进一步回归到实 验中进行检验。 DOE 是一种最有效的提高产率和优化工艺的方法,已被广泛的应用到生物制药生产中的上下 游工艺步骤中。赛多利斯的 DOE 工具(BioPAT MODDE®)结合 Sartorius/Lonza 培养基以及 PAT 技术是一个可以帮助广大研发工作者、工艺开发工程师、工艺优化工程师、数据统计人员等 研究复杂工艺的最佳实验设计工具,不仅可以为实验优化方案决策提供坚实的理论基础,寻 找到最优的参数及其范围,还可以预测工艺中潜在的风险。
从工艺放大的角度,我们建议尽量不要将大于 3 种培养基,且选择同一品牌的培养基进行 混合。原因是在工艺放大后,培养基混合会使得操作复杂化,而如果混合的培养基为同一 品牌,在大规模生产中,可以采用培养基定制来解决这一问题。
基本概念 DOE 是用于帮助更有效地研究 X 和 Y 之间的关系,也即 Y=f(x),其中 y 为是响应值,也即实验 中的输出值,在细胞培养中可以是单细胞产率 Pcd,也可以是质量,或者是活细胞密度 VCD。 x 也就是因子,即可能会对结果产生影响的因素。f(x),模型,即是符合 Y 和 x 关系的方程式。
第4步
根据以上工作表的组合以及顺序(Run Order)行实验,得出的 Y 值填入工作表的第 8 列。
第5步 点击 Home 中的 Analysis Wizard 按钮,进行模型评估。在 DOE 软件中,有大量的参数可以用 来评估或辅助评估模型,主要有 Results Variation , Response Distribution , Significance of Terms,Residuals Normal Probability Plot,Observed vs. Predicted Values 等。 特别要强调的是两个,一个是方差分析(ANOVA)表:
实验设计 本文中采用的 DOE 软件为 Umetrics 的 MODDE (vesion 10)。 第1步 输入 x,分别为 x1= ProCHOTM4,x2= PowerCHOTM1,x3=PowerCHOTM2,取值范围均为 0%-100%。
第2步 输入 y,产率 mg/ml
第3步 选择 MODDE 自动推荐的 Modified Simplex cCentroid 模型,点击 home 中的 design wizard 按 钮产生工作表。在工作表中,第 1 列 Exp No 为默认的实验编号;第 2 列 Exp Name 为实验名 称,可以默认也可以自行命名;第 3 列 Run Order 为随机化的实验顺序;第 4 列 Incl/excl 可 以人为选着是否需要这一组实验,推荐默认,即全部为 Incl;第 5-7 列为 Modified Simplex Centroid 模型的实验组合,在本案例中也就是不同的培养基比率的组合。其中,11-13 行为 中心点的 3 个重复,以评估整个实验的可重复性。第 8 列为实验输出,也即 y。
在等高图中,可以查看 PowerCHOTM1,PowerCHOTM2,ProCHOTM4(三条边)的组合对 Y 值 (产率)的影响,红色区域是最佳的混合比率区。 而点击 Predict 中的 Optimizer 按钮,可以得到产量最高的预测值,也即 Y 为最大值,以及此
时 PowerCHOTM1,PowerCHOTM2,ProCHOTM4 的比率。
混料设计 试验者要通过试验得出各种成分比例与指标的关系。例如,某种不锈钢由铁、镍、铜、铬 4 种元素组成,我们想知道每种元素所占比例与抗拉强度的数量关系。对于该类问题,研究的 是在整个产品中各个成分所占的比率问题,显然,这些比率的总和应该为 100%。研究这类 问题的实验设计称为混料设计。
案例研究 背景介绍 在传统的培养基筛选中,发现 Sartorius/Lonza 提供的 PowerCHOTM1,PowerCHOTM2,ProCHOTM4 三种培养基能得到较高产率的抗体,现采用混料设计来研究是否可以通过优化三种培养基的 混合比率,来进一步提高产率。
DOE - 培养基筛选的利器
实验设计(Design of Experiment, DOE)自 20 世纪初创以来,在产品设计、生产过程控制、质量 优化工程等方面得到了普遍的推广和应用。随着 2005 年,FDA 对质量源于设计(Quality by Design,QbD)概念的提出,越来越多的制药过程不仅采用 DOE 提高实验效率,也通过其进 行质量和风险控制。
另外一个是 Summary of Fit.
R2 表示模型可以解释的变异占总变异的比例,因此完美的模型 R2 为 1,在实际实验中需要 R2 接近于 1。Q2>0.1 表示模型显著,但对于一个好的模型需要 Q2>0.5;如果 Model Validity <0.25,表示模型在显著性上出了问题;而对于可靠的模型 Reproducibility 需要大于 0.5。 第6步 在模型通过可靠性评估后,进行结果分析。点击 Predict 中的 Contour 按钮,可以查看等高 图。
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