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HDAC抑制剂研究进展-樊后兴
物和 RNA合成酶与 DNA模板相结合 ,激活基因转录。相反 , HDACs功能相
反 ,抑制基因转录。 在正常生理状态下 ,这两类酶对组蛋白乙酰化作用的调控处于平衡状态 。
而细胞在发生转化的状态下 ,HDAC的活性明显增强 ,使得原有的基因表达
平衡状态被打破 ,导致一些影响细胞增殖和调控细胞周期的分子表达失衡 , 进而导致细胞癌变。
明显加强。 胰腺癌组织中HDAC1基因和HDAC3基因在mRNA水平上较胰腺癌旁
组织表达增高。
ChoiJH和HalkidouK等的研究中发现胃癌和前列腺癌细胞中HDAC1 高表达
Huang等报导在胃癌、结直肠癌、宫颈的非典型增生以及子宫内膜间
质肉瘤HDAC2过表达。
第Ⅱ类组蛋白去乙酰化酶与肿瘤
人肝癌细胞中HDAC4的表达明显增强,提示在人肝癌细胞中存在 乙酰化的失平衡。有关HDAC5、HDAC7、HDAC9的相关报道很少。 口腔鳞状上皮细胞癌研究中发现,HDAC6在癌组织中呈明显高表 达;在肿瘤进展不同阶段也有显著的表达差异,说明HDAC6有可能与 肿瘤侵袭性相关 。有关HDAC10的报道很少。
组蛋白去乙酰酶类似物的结构特点及其功能
由于目前没有人的HDAC的晶体结构,所以有关HDAC的研究是通过与其有 35.2%的氨基酸同一性的超嗜热菌Aquifex aeolicus的组蛋白去乙酰酶类似物 (HDLP)为基础来研究的。HDLP的晶体结构显示,HDLP有两个明显的结构特 征:a)一个深度为11A的管状通道,通向容纳TSA或SAHA的活性部位,有催化 活性的锌离子在通道的底部,TSA或SAHA的脂肪链从不同角度分析均利于与 疏水通道接近。b)一个长度为14A的内腔与锌离子的结合位点相邻。
SAHA 2006批准上市,用于治疗皮肤T细胞 淋巴癌 而将其用于治疗白血病和其 他实体瘤则处于II期或III期临床 aton pharma(被Merck收购) 适应症:复发的实体瘤,血癌,复发 或转移的头颈癌
HMBA 做到III期,由于神经毒性和导致 酸中毒而终止 NCI
FR901228 phase II Gloucester Pharmaceuticals 适应症:淋巴细胞白血病,小细胞肺癌, 乳腺癌,胰腺癌,卵巢癌
第Ⅲ类组蛋白去乙酰化酶与肿瘤
Sir2(silent information regulator2)基因家族是一种保守的从古细菌
到哺乳动物都存在的NAD+(烟酰腺嘌呤二核苷酸)依赖的组蛋白 E组蛋
白去乙酰基酶。人类Sirtuins家族中公认的成员有7个,即:SIRT1-7。 p53是SIRT1的生理性底物,SIRT1通过对p53蛋白第283位赖氨酸 残基的去乙酰化,可以减少由p53诱导的细胞凋亡,有利于细胞的存活。 在乳腺癌中的SIRT7表达水平比良性乳腺组织中明显提高; 而乳腺 癌的淋巴结转移组和非转移组相比,SIRT3和SIRT7的表达水平差异也 有显著性。
NVP-LAQ-824 做到I期后终止 Novartis
CRA-024781 phase II Pharmacyclics
用于治疗复发的实体瘤
LBH-589(panobinostat) Novartis
phase II 巴癌
phaseI
用于治疗皮肤T细胞淋
用于治疗其他癌症
R-306465 phase I Johnson & Johnson
HDAC的分类---根据与酵母菌HDAC的同源性
HDAC (18种)
I型
Zn+依赖型,包括: HDAC1,2,3,8,11, 全 部位于核内,其相 对分子质量为42000 ~55000,广泛存在 于生物体的各种组 织器官。
II型
Zn+依赖型,包括: HDAC4,5,6,7,9,10 主要位于细胞质 ,但 可以在细胞核和细 胞质之间穿梭,其 相对分子质量为 120000~130000, 具有组织特异性 ,多 在心脏 、肺 、骨骼 肌表达。
短链脂肪酸
包括丁酸,苯丁酸和异戊酸及其盐
这类化合物在金属结合区是一个羧酸,由于其HDAC抑制活性低,使 其构效关系的研究受限。虽然活性低,但包括丁酸和苯基丁酸的许多 化合物,正在进行癌症治疗的临床试验研究。由于临床应用丁酸及其 类似物需要高浓度,并且生物利用度低,代谢降解快,促使研究去前 药,这些抑制剂比对应的母体化合物吸收和代谢好。
HDAC与肿瘤的发生
研究证实,HDAC的活性与癌症的发生有关。当HDAC过度表 达并被转录因子募集,就会导致特定基因的不正常抑制,从而导 致肿瘤,如急性粒细胞白血病被认为部分归因于早幼粒细胞白血 病蛋白/维A酸受体α融合蛋白对HDAC的非正常募集。 另Gu等报道,当HDAC过度表达时,也会抑制生物体内天然的 肿瘤抑制因子例如p53的基因表达。 同时相应的,HDAC抑制剂会使染色质组蛋白乙酰化水平提高, 因此导致特定基因激活表达,相应地导致细胞的末端分化或癌细 胞的凋亡。
分化及凋亡的目的。肿瘤细胞要比正常细胞对HDACi敏感得多。SAHA 于2006年的成功上市,以及目前有多个HDACi处于临床研究阶段,均
能够有效抑制多种实体瘤, 同时HDACi与多种化疗药物联合用药,也
展现出良好的协同治疗效果,且在有效抑制剂量范围内的低毒性,已使 HDACi成为一种具有广泛应用前景的靶向抗肿瘤新药。
HDACi及其抗肿瘤作用机制
近年来 ,一系列的 HDACi已被研制出来 ,被证实具有抑制培养肿瘤细胞增殖 、 细胞周期阻滞、诱导细胞分化及促进细胞凋亡的作用。这些抑制剂还能够在非毒性 剂量下 ,以选择性的方式抑制动物模型中的肿瘤细胞增殖。 HDACi和细胞周期 细胞周期调控异常是肿瘤发生的重要机制。而HDACi可以通过调节细胞周期蛋白 和细胞周期蛋白激酶抑制物的表达,诱导肿瘤细胞发生G1和/或G2期停滞 HDAC诱导细胞分化 多项研究证实HDAC抑制剂有诱导癌细胞分化作用 HDACi诱导凋亡 a. HDACi和caspases HDACi通过死亡受体途径或线粒体途径激活caspase半胱 氨酸蛋白酶 ,不但促进肿瘤细胞凋亡,还能逆转某些肿瘤细胞的抗药性。 b. HDACi和p53 抑癌基因p53调控一系列与凋亡相关蛋白的转录,HDACi所诱 导的细胞凋亡部分是通过乙酰化p53从而上调p53作用来完成的。 c. HDACi与细胞骨架 细胞骨架具有维持细胞的特定形状和细胞内部结构的有序 性,同时在细胞有丝分裂和凋亡中起重要作用。而乙酰化修饰是调节细胞骨架结构 和功能的重要方式。高剂量的HDACi可以乙酰化修饰微管蛋白,导致细胞发生有丝 分裂停滞和凋亡。 其他生物学效应 包括抑制血管形成,抑制肿瘤细胞的迁移活性和诱导肿瘤免疫。
酰胺类
包括 MS-275, CI-994和CS055
这类化合物比羟胺酸类和环肽类活性低。与羟胺酸类不同的是,该类化 合物是以活性管道最狭窄部位的Phe141和Phe198的两个苯环为靶点, 阻塞HDAC的生理底物伸向催化中心,其中2’-氨基与Tyr91或Glu92形 成氢键,中间的苯环与Phe141和Phe198形成三明治结构,因此,2‘-氨 基或2’-羟基是抑制活性的关键基团,除去2‘-氨基,在芳基上3’, 4‘或5’取代氨基或乙酰化氨基,化合物失去活性。2‘位为氨基时,在 3’,4‘,5’位置取代,活性降低。
G2M-777(Savicol) phase II, TopoTarget 适应症:实体瘤
pivanex
Titan Pharmaceuticals 做到 III期临床,后由于某种原因 终止
CUDC-101
展望
HDACi可以增加细胞内组蛋白及非组蛋白的乙酰化程度,提高p21,
p53等基因的表达水平,进而达到抑制肿瘤细胞的增殖,诱导肿瘤细胞
HDACi的分类及其构效关系
羟胺酸类
包括TSA, SAHA及其衍生物,CBHA和
MM232等
羟胺酸类化合物是 研究最为广泛的一 类HDAC抑制剂, (R)-TSA是第一 个来源于天然产物 的HDAC抑制剂, 它的羧酸化合物没 有HDAC抑制活性, 说明羟胺酸结构是 活性所必须的。 研究发现强效 HDAC抑制剂共同 的结构特点是其分 子中含疏水基团, 连接单元,,新型的特异性的HDAC抑制剂已被发现,但这种特异
性抑制剂是否具有更好的肿瘤杀伤效果有待于进一步证实。
包括环氧酮基的环四肽结构
如trapoxin B, HC-toxin等
不含环氧酮基的环四肽结构
如FR901228, apicidin和包
含羟胺酸结构的环四肽
对于这类化合物来说,体积较大的环肽结构 能够与管道入口处的凹槽紧密结合,酮羰基可以 与HDAC中袋装管道中的Zn离子和极性氨基酸残 基相互作用,环氧基能使HDAC中的活性位点烷基 化,不可逆地抑制HDAC酶的活性。若将环氧基换 成羟胺酸,则表现出对HDAC的可逆性抑制。
MGCD0103 phase II MethylGene
选择性地作用于HDAC1,2,3 和11
CBHA 临床前,aton pharma
pyroxamide 终止 aton pharma
PXD101 (belinostat) Phase II TopoTarget
适应症:乳腺癌,结肠癌, 卵巢癌,前列腺癌,肺癌
III 型
保守 的NAD+(烟酰 腺嘌呤二核苷酸)依 赖型,与酵母Sir2 家族具有同源性, 且对I,II型HDACi不 敏感,更多的证据 显示该类酶更倾向 于催化非组蛋白的 去乙酰化。
第1类组蛋白去乙酰化酶与肿瘤
研究发现肿瘤细胞中HDAC1的高表达可明显增加肿瘤细胞的增殖能
力,并且HDAC1的高表达可影响细胞外基质而使肿瘤细胞移行和侵袭力
其他
目前正处于临床研究的HDACi
CI-994
phase III , Pfizer
用于治疗肺癌,非小细胞肺癌, 胰腺癌,头颈癌,肾癌。