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地中海贫血基因检测和结果分析
–10kb
5’
0kb
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40kb
inter ξHVR
3’HVR
3’
2 1
2
1
– –MC – –BRIT – –MED – –SPAN – –THAI – –HW – –FIL – –SEA – 27.6 – 11.1
– 4.2
– 3.7 – 2.7 – 2.4
共5789例
83845例3
Baise
790例
Liuzhou
1559例
1033例
Hezhou
Nanning
Yulin
Fangchengguang
Xiong , et al. Clin Genet 2010
224例
1349例
广西地中海贫血的流行分布
血红蛋白病
α-地中海贫血 静止型携带者 α-地中海贫血特征 Hb H 病
9.3~16.7 72~90
—
缺 失
Gγ Aγ -HPFH 东南亚 型
29.7±0.5
型
-
Aγ -HPFH 196(C→
Aγ
T)
14.1~ 27.0
14.3~ 20.9
57~63
越南、柬埔 寨人
81~95 意大利人
Gγ Aγ δ β 地贫
29(A→G
)
β
22.3
40
—
世界地中海贫血的流行分布
广西地中海贫血的流行分布
1、根据肽链的功能缺失
0地贫 : 珠蛋白基因功能完全丧失,不能合成肽链 +地贫 : 珠蛋白基因尚保留部分功能
2、根据临床症状
静止型地贫: 突变杂合子( N/ +),中国人少见 轻型型地贫:突变杂合子( N/ +、 0/ N) 中间型地贫:突变双重杂合子/突变纯合子
( +/ +、 0/ +) 重型地贫: 突变双重杂合子/突变纯合子
β
HbA
α珠蛋白基因簇
HS40
轻型: 缺失2个基因,基因型记为:--/或-/-
2个基因突变,基因型记为: T/T
中间型: 缺失3个基因,基因型记为:--/-
缺失与突变混合,基因型为:--/T或纯合突变
重型: 缺失4个基因,基因型记为:--/--
缺失与突变混合,基因型为:--/T
地中海贫血分类
12 种见于中国人群的 2/ 1珠蛋白基因点突变
显性突变
5’
EXON 1 IVS 1
EXON 2
IVS 2 EXON 3
3’
启动子突变 异常剪接 起始密码突变 移码突变 无义突变 3’UTR突变
46 种见于中国南方人群的-珠蛋白基因点突变
中国南方人群最为常见的地贫类型
地中海贫血的实验室检测和结果分析
广西区人民医院检验科PCR实验室 李友琼
主要内容
一、什么是地中海贫血及分布 二、地中海贫血的致病机制 三、地中海贫血的基因诊断 四、最新的地中海贫血检测方法 五、检测结果分析及报告
一、什么是地中海贫血
定义:由于珠蛋白基因发生缺陷,致使珠蛋 白肽链合成减少或缺失,导致血红 蛋白的α链/非α链比例失衡,而引起 的一组遗传性溶血性疾病,亦称海洋性贫血。
引起地中海贫血常见的基因缺失突变类型分步
CD30
2
5’
1
CD13
UTR EXON I
CD31
CD49
CD44
CD59
IVS I
EXON II
IVS II
CD78 CD74
CD122
CD125 CD142
EXON III
UTR
3’
CD118
Missense mutation Mini deletion or insersion Termination mutation链
链
红细胞 链
铁链 血红素
●胎儿血红蛋白主要由两条珠蛋白链、两条珠蛋白链组成,还含有 γ链、ɛ链、ζ链组成
●成年人的血红蛋白由两条珠蛋白链和两条珠蛋白链组成
二、地中海贫血的致病机制
11p15.3
β珠蛋白基因簇
HS 5 4 3 2 1 ε
Gγ Aγ
ψβ δ
地中海贫血分类
2、按照肽链内切酶分型
缺失型地贫:珠蛋白肽链存在片段缺失而造
成功能缺陷
非缺失型地贫:珠蛋白肽链上不存在缺失,而是 (点突变) 由于基因的点突变造成的肽链功能
缺陷
地中海贫血分类
3、根据基因缺失或突变个数可分为:
静止型: 缺失1个基因,基因型记为-/ 1个基因突变,基因型记为/T
( 0/ 0、 0/ +)
中国人HPFH和δβ-地贫的基因突变类型及 表型特征
突变类型
缺失长度(kb, 缺失型)
或受累基因( 非缺失型)
Hb F(%)
Gγ (%)
其它种族
中国型
≈100 9.3~21.2 83~100
—
Gγ +(Aγ δ β )0-地贫
广州型
>43
19.4
95
—
云南型
~90
血红蛋白病:由于珠蛋白基因发生缺陷,致使珠蛋 白分子的一级结构发生改变,从而导致血红 蛋白的分子结构发生改变的一组遗传性疾病。
☆ 地中海贫血是最常见的血红蛋白病,珠蛋白合成
障碍性贫血为国内称呼,国外不用。
地中海贫血 血红蛋白变异体
地中海贫血分类
地中海贫血 地中海贫血
δ 地中海贫血
γ 地中海贫血 δ 地中海贫血 εγδ地中海贫血 溶血性异常血红蛋白(如HbS、C等) 地中海贫血样变异(如Hb CS、E等) 其他异常血红蛋白(如Hb M、Coimbra等)
β-地中海贫血 携带者 复合α-地中海贫血 中间型地中海贫血
δ-地中海贫血 携带者 复合α-地中海贫血
血红蛋白结构变异 携带者 复合α-地中海贫血 复合β-地中海贫血
总计
分组
阳性样本数 886 363 498 25 370 287 79 4 9 6 3 22 17 4 1 1287
% 15.32 6.27 8.6 0.43 6.39 4.96 1.36 0.07 0.16 0.1 0.05 0.38 0.29 0.07 0.02 22.25
引起珠蛋白表达降低的常见缺失突变类型分布
0kb
50kb
G A
LCR
100kb
150kb
Black Belgian Indian Malaysian 2 German Turkish Italian Gantonese Yunnanese Chinese n Taiwanese