蛋白质的分子结构
蛋白质三级结蛋构白的其质它的特三点:级结构
许多在一级结构上相差很远的氨基酸碱基在三 级结构上相距很近。
三级结构是蛋白质发挥生物活性所必须的。
所有具有高度生物学活性的蛋白质几乎都是球 状蛋白。
球状蛋白的三级结构很密实,大部分的水分子 从球形蛋白的核心中被排出,这使得极性基团间以 及非极性基团间的相互用成为可能。
成氢键,经常出现在-螺旋的
端头,它改变多肽链的方向并
终止螺旋
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(2)-折叠
β-折叠是由两条或多条伸展的多肽链靠氢键联结 而成的锯齿状片状结构。
侧链基团与Cα间的键几乎垂直于折叠平面,R基 团交替地分布于片层平面两侧。
β-折叠分平行式和反平行式,后者更为稳定。
N端在同一端。氨 基酸之间沿轴相 距0.325nm
O H3N+ C C
N-端 CH2
Val H
O NCC
H CH
OH
CH3CH3
肽键
T yr H
O NCC H CH2
OH
Asp H
O NCC
H CH2 CO2H
Gln H
N C COOH CH2 C-端
氢键对维持二级结构特别重要 疏水作用对维持三级结构特别重要
➢ 这些非共价键以量取胜,它们不仅稳定 了蛋白质的三维结构,对蛋白质的功能也有重 要影响作用
维持蛋白质三级结构稳定的因素
亲水区: 亲水区多位于分子表面, 故
球 形蛋白质水溶性较好
疏水核: 疏水区多位于分子内部, 往
往 结合的位点
是与辅酶/基或底物
蛋白质的分子结构
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蛋白质的 分子结构
一级结构 ——基本结构
二级结构
三级结构
空间结构
四级结构
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一、蛋白质的一级结构
1.定义:
蛋白质的一级结构是指蛋白质多肽链中氨基酸 的排列顺序,一级结构的主要连接键是肽键, 通常将二硫键也归属于一级结构
2.结构特点:
蛋白质的序列具有方向性,一般书写顺序是从 N-端到C-端, 其主要作用是决定蛋白质分子 的高级结构和功能
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3. 根据蛋白质的功能分; (1) 活性蛋白 按生理作用不同又可分为: 酶、
激素、抗体、收缩蛋白、运输蛋白等。 (2)非活性蛋白 担任生物的保护或支持作用的蛋
白,但本身不具有生物活性的物质。例如:贮存 蛋白(清蛋白、酪蛋白等),结构蛋白(角蛋白、 弹性蛋白胶原等)等等。
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Ser H
三、蛋白质的三级结构
概念:
蛋白质分子中所有原子(包括主链和侧 链)在三维空间的排列分布,又称为空间结构、 三维结构、构象
维持三级结构的作用 力
二硫键 —— 共价键
疏水作用
氢键 离子键
非共价键(次级键)
范德华力
稳定蛋白质三维结构的作用力
a b
c
e c
d
d
a
a 离子键 c 疏水作用 e 二硫键
b 氢键 d 范德华力
N端不在同一端。 氨基酸之间沿轴 相距0.35nm
维持β-折叠结构稳定性的力 —— 氢键 由一条链上的羰基和另一条链上的氨基之 间形成,即氢键是在链与链之间形成的。
(a)平行式
(b)反平行式
概(念3):-转角三、蛋白质的二级结构
肽链出现180回折的转角处结构称为转角 结构特点:
第一个残基的C=O与第四个残基的N-H形成氢 键,常见于连接反平行β-折叠片的端头(如Gly与 Pro),多位于球状蛋白质分子表面,约占全部残基 的四分之一
蛋白质的四级结构
四级结构的特点: 亚基单独存在时无生物活性,只有相互聚合成特
定构象时才具有完整的生物活性 亚基之间以非共价键结合,容易彼此解离 大多数寡聚蛋白质分子的亚基的排列是对称的,
对称性是四级结构蛋白质最重要的性质之一
血红蛋白的四级结构
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蛋白质的分类
1.根据组成: 简单蛋白和结合蛋白 (1) 单纯蛋白质 仅由氨基酸组成,不含其他
(4) 无规卷曲oil)
概念:
没有确定规律性的肽键构象
特点:
常见于球状蛋白质分子中,在其它类型二级结 构肽段之间起连接作用,有利于整条肽链盘曲折叠。酶的 功能部位常常处于这种构象区域。来自H2NCOOH
β-转角
β-折叠
α-螺旋
无规卷曲
核糖核酸酶分子中的二级结构
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多肽链折叠的规则方式
蛋白质二级结构总结
(2) 主链原子构成螺旋的主体,侧链 在其外部,直径约为0.5nm
-螺旋
左、右手螺旋
(3) 每个肽键的羰基氧与远
在第四个氨基酸氨基上的氢
形成氢键(共形成n-4个氢键),
所有肽键都能参与链内氢键
的形成,氢键的方向与中心
轴大致平行, 是稳定螺旋的
主要作用力
3.613 (SN)
(4) Pro的N上缺少H,不能形
成分,例如:核糖核酸酶、胰岛素。 (2) 结合蛋白质 除了蛋白质部分外,还有非 蛋白质成分(辅基、配基)例如:血红蛋白。
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2.根据分子的形状: (1)球状蛋白质――分子对称性佳,外形接近球
状或椭球状,溶解度较好,能结晶。Eg.血红蛋 白、血清球蛋白。 (2)纤维状蛋白质――对称性差,分子类似细棒 或纤维。 可溶性纤维状蛋白质――肌球蛋白。 不溶性纤维状蛋白质――胶原、弹性蛋白。
例子1——胰岛素分子的三级结构
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例2——溶菌酶分子的三级结构
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例3——磷酸丙糖异构酶和丙酮酸激酶的三级结构
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四、蛋白质的四级结构
许多蛋白质是由两个或两个以上独立的球状 蛋白质通过非共价键结合成的多聚体,称为寡聚蛋 白。寡聚蛋白中的每个独立的球状蛋白质称为亚基, 亚基一般由一条肽链构成,也称为单体。蛋白质 的四级结构是指亚基的种类、数量以及各个亚基 在寡聚蛋白质中的空间排布和亚基间的相互作用。
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胰岛素 由51个氨基酸残基组成,分为A、B两条链。 A链21个氨基酸残基,B链30个氨基酸残基。 A、B两条链之间通过两个二硫键联结在一起,A链 另有一个链内二硫键。
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一级结构是蛋白质空间结构和特异生物学功能的基 础,但并不是决定蛋白质空间结构的唯一因素
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二、蛋白质的二级结构
1、定义: 指多肽链主链骨架原子的空间相对位置,不涉
及氨基酸残基侧链的构象。 2、基本类型:
-螺旋、-折叠、-转角、无规结构
3、稳定二级结构的作用力:氢键
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(1) -螺旋
结构要点:
(1) 肽键平面为单位,以-碳原子 为转折盘旋形成右手螺旋,螺旋的每 圈有3.6个氨基酸,螺旋间距离为 0.54nm,每个残基沿轴旋转100,上 升0.15nm