种病毒测序
1
6
1997年
2 对医学的影响
后基因组计划内容
post genome project
功能基因组学 1 蛋白质组学 2
药物基因组学 3
4 疾病基因组学 5 肿瘤基因组学
6 表观遗传学
药物基因组学
药物基因组学是在基因组整体水平上阐明人类遗传变异与药物反应 关系的学科，其内容主要包括两个方面：
05 1997年——成果显著
06 1999年——中国加入 07 2000年——公布工作框架图 08 2003年——6个国家完成 09 2005年——完成
HGP取得成果——1997年
EST数目已达 识别人类基因组
两个计划
719076 3
基因200左右 4
2种真菌测序 完成
人类基因组中
2
心——中国
5
完成了141
发展
1、在开展国际合作之前, 英国和美国等 基因组学研究的先进国家已经启动了本 国的肿瘤基因组项目
01
从鉴定癌基因到肿瘤基因组 学研究
“癌症基因组项目”(Cancer Genome Project, CGP）
02
测序技术和生物信息分析方 法与肿瘤基因组变异图谱
2、ICGC病例入组标准和数据分析存储
标准
03
全球大协作与ICGC
3、ICGC的项目进展和亮点成果
截至2014年5பைடு நூலகம், ICGC共协调启动了针 对22个癌症类型的74个研究项目。
ICGC的项目进展和亮点成果
截至2014年5月, ICGC共协 调启动了针对22个癌症类 型的74个研究项目, 这些 项目承诺完成至少25000例 肿瘤患者的癌组织测序分 析.
肿瘤基因组学
定义 肿瘤基因组学是在人类基因组学的基础上,寻找癌相 关基因组及遗传序列,筛选及检测肿瘤特异性或相关 性表达,判断基因间相互关系,并比较个体之间基因差 异,最终用于指导肿瘤发病机制研究及临床肿瘤个体 化治疗。
肿瘤基因组学
目的 通过对肿瘤细胞基因组中各种突变（所有的基因扩 散区域，所有基因丢失区域，所有编码区的基因突 变，所有染色体重排，所有甲基化以及基因表达谱） 的鉴定，以此阐明癌症发病分子机制，为肿瘤的早 期诊断提供分子标志，为临床个体化治疗和预后判 断提供分子基础，为选择特异性药物作用靶点提供 科学依据。
NPPA基因单核苷酸
Conen 等 对 18437 名 白 种 健 康 妇 女 的 NPPA 基 因 单 核 苷 酸 多 态 进 行 了 前瞻性研究，随访9．8年，有 29．6％的妇女发展为高血压，其 中rs5063多态A等位基因和rs5065 多态C等位基因携带者的高血压发 生率显著降低(危险比分别为 0．88和0．95)。提示NPPA基因在 血压调控中起关键作用，是高血 压的独立保护因素。
长 的 时 间 隧 道，袅
人类基因组计划及后基因组计划
目 录 / contents
01 HGP历史进程 02 后基因组计划
1 HGP历史进程
HGP的发展
05 04 03
06 07
02
08
01
09
01 1986年——提出 02 1990年——正式启动 03 1993年——修订 04 1996年——提出策略
ICGC的项目进展和亮点成果
乳腺癌
从癌细胞克隆进化的角度，英国Sanger的研究团队 分析了21例患者组织的全基因组突变位点以及相邻 碱基的序列, 提出了突变过程标签的概念 . 利用这种 分子标签对患者聚类 ,发现与患者生殖系BRCA1/2的 突变情况相吻合。与此同时, 通过对癌组织超高深度 的测序, 可以对癌组织突变的等位基因频率(allele frequency)进行估算和定相(phasing), 从而对患者的 癌组织系统发生在分子水平进行勾画, 更重要的是可 以识别出癌细胞克隆亚群形成过程中的关键节点基 因.
进 入 夏 天 ，少 不了一 个热字 当头， 电扇空 调陆续 登场， 每逢此 时，总 会想起 那 一 把 蒲 扇 。蒲扇 ，是记 忆中的 农村， 夏季经 常用的 一件物 品。 记 忆 中 的故 乡 ， 每 逢 进 入夏天 ，集市 上最常 见的便 是蒲扇 、凉席 ，不论 男女老 少，个 个手持 一 把 ， 忽 闪 忽闪个 不停， 嘴里叨 叨着“ 怎么这 么热” ，于是 三五成 群，聚 在大树 下 ， 或 站 着 ，或随 即坐在 石头上 ，手持 那把扇 子，边 唠嗑边 乘凉。 孩子们 却在周 围 跑 跑 跳 跳 ，热得 满头大 汗，不 时听到 “强子 ，别跑 了，快 来我给 你扇扇 ”。孩 子 们 才 不 听 这一套 ，跑个 没完， 直到累 气喘吁 吁，这 才一跑 一踮地 围过了 ，这时 母 亲总是 ，好似 生气的 样子， 边扇边 训，“ 你看热 的，跑 什么？ ”此时 这把蒲 扇， 是 那 么 凉 快 ，那么 的温馨 幸福， 有母亲 的味道 ！ 蒲 扇 是 中 国传 统工艺 品，在 我 国 已 有 三 千年多 年的历 史。取 材于棕 榈树， 制作简 单，方 便携带 ，且蒲 扇的表 面 光 滑 ， 因 而，古 人常会 在上面 作画。 古有棕 扇、葵 扇、蒲 扇、蕉 扇诸名 ，实即 今 日 的 蒲 扇 ，江浙 称之为 芭蕉扇 。六七 十年代 ，人们 最常用 的就是 这种， 似圆非 圆 ， 轻 巧 又 便宜的 蒲扇。 蒲 扇 流 传 至今， 我的记 忆中， 它跨越 了半个 世纪， 也 走 过 了 我 们的半 个人生 的轨迹 ，携带 着特有 的念想 ，一年 年，一 天天， 流向长
药物基因组学立足于基因组的所有基因，以向临床治疗 药物的高效和安全应用提供遗传学指导作为最终目标
举例：
肾素基因C5312T
Vangjeli 等 研 究 发 现 肾 素 基 因 C5312T多态性与高血压有关，携 带T等位基因的人肾素基因与收 缩压增高有关。有关研究比较 ARB氯沙坦和肾素抑制剂阿利吉 仑降压疗效与肾素基因多态性的 关系，结果显示两组药物降压作 用与其呈显著相关，且氯沙坦组 的 相 关 性 更 明 显 ， 其 中 1Tr 基 因 型比CT、CC基因型更敏感。
第一点
研究不同个体的细胞、组织、器官在外源性物质(主要 是药物)作用下基因表达谱的变化及其与表型特征的可 能关联，用以阐明外来物质体内生物效应的变化情况。
第二点
研究不同遗传变异对个体药物反应和药物效应的作用， 这部分过去一直是药物遗传学的研究内容之一。
主要目的：
①指导新药创制 ②指导临床研究
③指导药物的 合理使用