精品文档 精品文档 2、 蛋白质分离的双向电泳过程 2.1溶液配制 常用水化上样缓冲液 (Ⅰ) 尿素 8M 4.805g CHAPS 4% 0.4g DTT 65Mm 0.098g Bio-Lyte 0.2%(w/v) 50μl(40%) 溴酚蓝 0.001% 10μl(1%溴酚蓝) MilliQ水 定容至100ml (Ⅱ) 尿素 7M 4.2g 硫脲 2M 1.52g CHAPS 4% 0.4g DTT 65Mm 0.098g Bio-Lyte 0.2%(w/v) 50μl(40%) 溴酚蓝 0.001% 10μl(1%溴酚蓝) MilliQ水 定容至100ml (Ⅲ) 尿素 5M 3.0g 硫脲 2M 1.52g SB3-10 2% 0.2g CHAPS 4% 0.4g DTT 65Mm 0.098g Bio-Lyte 0.2%(w/v) 50μl(40%) 溴酚蓝 0.001% 10μl(1%溴酚蓝) MilliQ水 定容至100ml 分成10小管,每小管1ml,-80℃冰箱保存。
胶条平衡缓冲液母液 尿素 6M 36g SDS 2% 2g Tris-HCl 0.05M pH8.8 3.3ml(1.5M pH8.8 Tris-HCl) 甘油 20% 20ml 精品文档 精品文档 MilliQ水 定容至100ml 分装成10管,-20℃冰箱保存。
胶条平衡缓冲液Ⅰ 胶条平衡缓冲液母液 10ml DTT 0.2g 充分混匀,用时现配。
胶条平衡缓冲液Ⅱ 胶条平衡缓冲液母液 10ml 碘乙酰胺 0.25g 充分混匀,用时现配。
低熔点琼脂糖封胶液 低熔点琼脂糖 0.5% 0.5g Tris 25mM 0.303g 甘氨酸 192mM 1.44g SDS 0.1% 1ml(10%SDS) 溴酚蓝 0.001% 100μl(1% 溴酚蓝) MilliQ水 定容至100ml 加热溶解至澄清,室温保存。
30%聚丙烯酰胺贮液 丙烯酰胺 150g 甲叉双丙稀酰胺 4g MilliQ水 500ml 滤纸过滤后,棕色瓶4℃冰箱保存。
1.5mol/L Tris碱pH8.8 Tris碱 90.75g MilliQ水 400ml 用1mol/L HCl调pH至8.8,加MilliQ水定容至500ml, 4℃冰箱保存。
10% SDS SDS 10g 精品文档 精品文档 MilliQ水 100ml
10%过硫酸铵 过硫酸铵 0.1g MilliQ水 1ml 现用现配。 10×电泳缓冲液 (1×=25mM Tris,192mM glycine,0.1% SDS,pH8.3) Tris碱 30g 甘氨酸 144g SDS 10g MilliQ水 1L 混匀后,室温保存。
2.2操作步骤 2.2.1 第一向等电聚焦 1.从冰箱中取水化上样缓冲液,室温溶解;在enpendoff管中,2.0mg蛋白干粉加入200μl水化上样缓冲液,室温下裂解3-4h;10000rpm常温离心10min,取上清液上样水化。具体的上样体积及蛋白质上样量如下表,
ReadyStripTMIPG胶条长度 上样体积 分析型的上样量 (银染) 制备型的上样量 (考马斯亮兰染色) 7cm 125-250μl 10-100ug 200-500ug 17cm 300-600μl 100-300ug 1-3mg
2.从冰箱中取-20℃冷冻保存的IPG预制胶条,于室温放置10min。 3.沿着聚焦盘的边缘由左至右线性加入样品。在槽两端各1cm左右不要加样,中间的样品一定要连贯,同时注意不要产生气泡。 4.用镊子轻轻的去除预制IPG胶条上的保护层,分清胶条的正负极,轻轻地将IPG 胶条胶面朝下置于聚焦盘中样品溶液上,使得胶条得正极对应于聚焦盘得正极。确保胶条与电极紧密接触,同时不要使胶条下面的溶液产生气泡。 5.在每根胶条上覆盖矿物油,防止胶条水化过程中液体的蒸发。 6.对好正、负极,盖上盖子。设置等电聚焦程序。 7cm胶条 水化 12h(17-20℃) 主动水化 S1 250V 慢速 2 h 除盐 精品文档 精品文档 S2 500V 慢速 1 h 除盐 S3 1000V 快速 1 h 除盐 S4 4000V 线性 3 h 升压 S5 4000V 快速 25000 伏h 聚焦 S6 500V 快速 任意时间 保持 17cm胶条 水化 12h(17-20℃) 主动水化 S1 250V 慢速 2 h 除盐 S2 500V 慢速 1 h 除盐 S3 1000V 快速 1 h 除盐 S4 8000V 线性 5 h 升压 S5 8000V 快速 60,000 伏h 聚焦 S6 500V 快速 任意时间 保持 选择所放置的胶条数。 设置每根胶条的极限电流。 设置等电聚焦时的温度。 7.聚焦结束的胶条如不立即进行平衡、第二向SDS-PAGE电泳,可将胶条置于样品水化盘中,-20℃冰箱保存1-2天。
2.2.2 第二向SDS-PAGE电泳 1.配制12%的丙稀酰胺凝胶,上部留0.5cm的空间,用MilliQ水封面,保持胶面平整。待凝胶凝固候,倒去分离胶表面的MilliQ水,再用MilliQ水冲洗。 2.从-20℃冰箱中取出的胶条,先于室温放置10min,使其溶解。 3.在桌上先放置干得厚滤纸,聚焦好得胶条胶面朝上放在干得厚滤纸上。将另一份厚滤纸用MilliQ水浸湿,挤去多余水分,然后置于胶条上,轻轻吸干胶条上得矿物油及多余样品。这可以减少凝胶染色时出现得纵条纹。 4.将胶条转移至溶涨盘中,每个槽一根胶条,在槽中加入平衡缓冲液Ⅰ。将样品水化盘放在摇床上缓慢摇晃10-15min。 5.第一次平衡结束后,彻底倒掉平衡缓冲液Ⅰ,将胶条竖在滤纸上,吸去多余得平衡液。再加入胶条平衡缓冲液Ⅱ,继续在摇床上缓慢摇晃10-15min。 6.用滤纸吸去SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶上方玻璃板间多余得液体。将处理好的第二向凝胶放在桌面上,长玻璃板再下,短玻璃板朝上,凝胶的顶部对着自己。 7.第二次平衡结束后,用滤纸吸去胶条上多余的平衡液。用镊子夹住胶条的一端使胶面完全浸没在1×电泳缓冲液中,然后将胶条胶面朝上放在凝胶的长玻璃板上。 精品文档 精品文档 8.将放有胶条的SDS-PAGE凝胶转移到灌胶架上,短板一面对着自己,在凝胶的上方加入低熔点琼脂糖封胶液。 9.用镊子或平头的针头轻轻地将胶条向下推,使之与聚丙烯酰胺胶胶面完全接触。注意不要在胶条下方产生任何气泡,同时操作时注意不要碰到胶面。 10.放置5min,低熔点琼脂糖封胶液完全凝固后,将凝胶转移至电泳槽中。 11.电泳起始时用低电流(7cm胶条:5-10mA/gel;17cm胶条:10mA/gel)或低电压(7cm胶条:50-75V/gel;17cm胶条75-100V/gel),待样品在完全走出IPG胶条,浓缩成一条线后,在加大电流(7cm胶条:10-15mA/gel;17cm胶条:20-30mA/gel)或电压(7cm胶条:150-200V/gel;17cm胶条:300-400V/gel),待溴酚蓝指示剂达到底部边缘时即可停止电泳。 12.电泳结束后,轻轻撬开两层玻璃,取出凝胶,并切角以做记号。然后进行染色。
2.3染色方法 2.3.1考马斯亮蓝G-250染色 固定液:45%(V/V)甲醇,1%(V/V)乙酸 G-250染色液:17%(W/V)硫酸铵,34%(V/V)甲醇,0.5%(V/V)乙酸,0.1%(W/V)G-250. 步骤:1.固定液固定20min或过夜(无需固定液可)。 2.倒出固定液 3.加入G-250染色液,18-24h。 4.倒出染色液 5.用水洗(20min一次,45~55℃温水有助于水洗) 6.可用塑料包裹,4℃贮于密封盆里。
2.3.2胶体考染法 1.用去离子水清洗凝胶两次,每次10min,以去除SDS。 2.固定:50%乙醇/10%冰醋酸/的水溶液,至少30min,可过夜。 3.染色:染色液为45%甲醇/10%冰醋酸/0.25%G-250溶液过滤所得,将凝胶浸泡后染色至少2h。 4.脱色:多次更换脱色液(25%乙醇/8%冰醋酸溶液)直至背景脱净。 5.保存:用保险膜包裹,可存一个月。
2.3.3银染法 步骤 试剂 体积(ml) 不同类型胶所需时间(min) 1mm 1.5mm 1.固定 10%乙酸 / 40%乙醇 / 水 2×250 2×15 2×60 精品文档 精品文档 2.敏化 75ml乙醇 / 17g乙酸钠 / 10ml 5% Na2S2O3 / 250 30 60 1.25ml戊二醛 / 加水至 3.水洗 去离子水 3~5×250 3×15 5×8 4.银染 25ml AgNO3 (2.5%) / 100μl 甲醛/ 加水至 250 20 60 5.水洗 去离子水 2~4×250 2×1 4×1 6.显色 6.25g Na2CO3 / 100μl 甲醛 7μl Na2S2O3(5%) 250 4 6 7.停止 3.65g EDTA 加水至 250 10 40 8.水洗 去离子水 2~3×250 3×5 2×30
3、 等电聚焦蛋白样品的浓度检测 3.1 Bio-Rad RC DC Protein Assay 微离心管检测方法 (1)将5μl DC试剂S与250μl DC试剂A混合(试剂A’),每份样品或标准溶液需要127μl 试剂A’。 (2)将标准蛋白稀释为3-5份蛋白浓度在0.2-1.5mg/ml范围内的标准溶液,在每次测未知蛋白浓度前绘制标准曲线。(为得到最佳结果,标准蛋白应与样品使用同样的缓冲液) (3)从每份样品或标准蛋白中取出25μl,分别加至清洁、干燥的微离心管中。 (4)向每管中加入125μl RC试剂Ⅰ,混旋后室温放置1min。 (5)向每管中加入125μl RC试剂Ⅱ并混旋,之后在15,000×g速度下离心3-5min。 (6)吸去上清,然后将管子倒置在干净吸水纸上,使溶液彻底被吸干。 (7)向每个微离心管中加入 127μl 试剂A’并混旋,在室温下放置5min或直至沉淀彻底溶解。在进行下一步之前再次混旋。 (8)在每个管中加入1ml DC试剂B,立即混旋,室温下放置15min。 (9)在750nm下读取吸光度,吸光度测定要在1h内完成。
3.2 Bradford法 1、溶液的配制 Bradford储存液 100ml 95% 乙醇 200ml 88% 磷酸 350mg 考马斯亮蓝G-250