PCR法检测支原体
实验原理:
通过对支原体特定的序列设计引物,当存在支原体污染时通过PCR特异性扩增,
会将目标DNA特异性的复制,然后通过琼脂糖电泳观检测,会跑出条带出现阳性
结果。反之当没有支原体污染时,由于没有模板,PCR无法扩增,则琼脂糖电泳跑
不出条带,出现阴性结果,为确保PCR法的精确性,故需要找到最优的PCR条件
在进行检测。
实验目的:
检测培养的细胞是否有支原体污染。
实验材料:
0.5 ml EP管;PCR管;镊子;手套;口罩;EP管架;移液枪(100 ul,10 ul)及配套
枪头(黄、白);dd H2O;上下游引物(两组);dNTPs;10 x Buffer;Easy Taq;冰
盒;琼脂糖;锥形瓶(200ml);量筒(50ml);全套琼脂糖电泳设备(电泳槽,
制胶槽,梳子,电源输出);凝胶成像系统;
PCR引物:
LZY-5 Myco universal F:GGGGAATGGGTGAGTAACACG
LZY-5 Myco universal R:CGGATAACGCTTGCGACCTATG
产物大小:500bp
LZY-6 mycotest F :GGGAGCAAACAGGATTAGTATCCCT
LZY-6 mycotest R :TGCACCATCTGTCACTCTGTTAACCTC
产物大小:250bp
实验步骤:
1、取样:
直接取培养细胞的培养基上清。
2、PCR(为25ul体系)
1、配制反应体系,根据检测样本数+1个阴性对照(水)+1个阳性对照,算出PCR
样本的个数,在此基础上增加几管的量,把除检测培养基外的其他组分按计算好的
量加到一起,混匀后分装,最后加入检测培养基。
25 ul 反应体系
5#引物:LZY-5 Myco universal
反应体系 反应条件
检测培养基 1 ul 94 ℃ 3 min
LZY-5 -F 0.5 ul 94 ℃ 30 s
LZY-5 -R 0.5 ul 55℃ 30 s
10xBuffer 2.5 ul 72 ℃ 30s
dNTP 0.5 ul 25 cycles或30 cycles
Easy Taq 0.5 ul 72 ℃ 10min
ddH2O 19.5 ul
6#引物:LZY-6 mycotest
反应体系 反应条件
培养基 1 ul 94 ℃ 3 min
LZY-5 -F 0.5 ul 94 ℃ 30 s
LZY-5 -R 0.5 ul 51℃ 30 s
10xBuffer 2.5 ul 72 ℃ 20s
dNTP 0.5 ul 35 cycles
Easy Taq 0.5 ul 72 ℃ 5min
ddH2O 19.5 ul
3.琼脂糖凝胶的制备
1%的琼脂糖凝胶电泳检测PCR结果。
上图为两对引物梯度PCR的结果,5#引物选择:55℃(55.9℃),6#引物引物选择:51℃