一个有效的药效团模型，一般包含3-5 个有效的药效团元素。如果模型中含有 的药效团元素数目过多，就可能导致在 药效团模型应用过程中无法产生结果的 后果。
药效团的识别过程
• 活性化合物的选择以及药效特征元素的含 义 • 构象分析 • 分子叠合和药效团映射
基于药效团的虚拟筛选进程
• 药效团特征的提取 • 药效团识别 • 基于药效团的数据库搜寻
药效团
药学院 112-2
焦俊超
药效团是什么？
• 药效团是指药物与受体结合时，在三维空 间上具有相同的疏水、电性和立体性质， 具有相似的构象。
药效团理论
• 药效团是基于药效特征元素为基础建立的 模型。药效特征元素主要分为七种，包括： 氢键供体、氢键受体、正负电荷中心、芳 环中心、疏水基团、亲水基团以及几何构 象体积冲撞。
药效团模型的应用
• 全新药物设计 • 基于药效团模型的数据 • 先导化合物的优化
基于药效团模型的数据库搜寻步骤
• 初筛 • 二维子结构匹配 • 三维结构搜索 柔性构象搜索方法：系统搜索、距离几何、 Monte Carlo方法，遗传算法以及定向DISCO和GASP，以及Catalyst • 区别：对柔性构象的处理和药效特征结构 的叠合。