一、DNA甲基化与基因表达
DNA甲基化是最早发现的修饰途径之一,可能存在于所有高等生物中。
DNA 甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。
1.DNA甲基化的主要形式
5-甲基胞嘧啶,N6-甲基腺嘌呤和7-甲基鸟嘌呤。
在真核生物中,5-甲基胞嘧啶主要出现在CpG和CpXpG中,原核生物中CCA/TGG和GATC也常被甲基化。
真核生物细胞内存在两种甲基化酶活性:一种被称为日常型(mainte-nance)
甲基转移酶,另一种是从头合成(denovo synthesis)甲基转移
酶。
前者主要在甲基化母链(模板链)指导下使处于半甲基化的DNA双链分子上与甲基胞嘧啶相对应的胞嘧啶甲基化。
日常型甲基转移酶常常与DNA内切酶活性相耦联,有3种类型。
II类酶活性包括内切酶和甲基化酶两种成分,而I类和III类都是双功能酶,既能将半甲基化DNA甲基化,又能降解外源无甲基化DNA。
由于甲基化胞嘧啶极易在进化中丢失,所以,高等真核生物中CG序列远远低于其理论值。
哺乳类基因组中约存在4万个CG islands,大多位于转录单元的5'区。
没有甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用,就可能被氧化成为U,被DNA修复系统所识别和切除,恢复成C。
已经甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用, 它就变为T, 无法被区分。
因此, CpG序列极易丢失。