第四章 克隆基因的表达
tac启动子是药物诱导型 调节基因lacⅠ(位于宿主基因组内或载体上))始 终产生阻遏物。
• 无IPTG:阻遏物与lac操纵基因结合,抑制 外源 基因转录。宿主大量生长。
• 有IPTG:阻遏物与IPTG结合,lac操纵基因解放, 外源基因大量转录。宿主生长受抑制。
(2)表达载体诱导复制
将宿主的生长与载体的复制分开。
2.获得目的片段: (1)通过PCR方法:以含目的基因的克隆质粒为
模板,按基因序列设计一对引物(在上游和下游 引物分别引入不同的酶切位点),PCR循环获得 所需基因片段。
(2)通过RT-PCR方法:用TRIzol法从细胞或组 织中提取总RNA,以mRNA为模板,逆转录形成 c环获得产物。
特定的时间顺序发生,称之为基因表达的 时间特异性。
• 多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶 段特异性。
(二)空间特异性 • 在个体生长全过程,某种基因产物在个体
按不同组织空间顺序出现,称之为基因表 达的空间特异性
• 基因表达伴随时间顺序所表现出得这种分 布差异,实际上是由细胞在器官的分布决 定的,所以空间特异性又称细胞或组织特 异性
当需要宿主大量生长时,抑制载体质粒的复制。
当宿主大量生长后,再诱导载体质粒的复制,增 加拷贝数。
6.提高表达产物的稳定性
防止被宿主的酶降解 (1)设计成融合蛋白
这是避免被降解的最好措施。 N末端:由原核基因编码一段多肽, C末端:是完整的真核外源基因。
λ△Z载体系列
提供三种融合插入阅读框
λ△ZUV5载体 λ△Z2载体
第四章 克隆基因的表达
第一节 基因表达的过程
• 基因表达(gene expression)是指储存遗 传信息的基因经过一系列步骤表现出其生 物功能的整个过程。
• 典型的基因表达是基因经过转录、翻译, 产生有生物活性的蛋白质的过程。
• 基因表达是受调控的
一、基因表达的基本规律
• (一)时间特异性 • 按功能需要,某一特定基因的表达严格按
3.启动子与外源基因之间的距离 SD距离AUG的距离也影响翻译(7个较好)
4.转录终止区对表达效率的影响 转录终止区的存在保证载体不会转录非必须基因, 不必浪费源量和能量,不会干扰正常的表达。
5.载体拷贝数及稳定性对表达效率的影响 增加载体的拷贝数会增加转录出的mRNA数目。 增加表达效率。 但过度的外源基因的表达会影响宿主的正常生长。
Lac乳糖操纵子:启动子Plac + 操纵基因lacO + 结 构基因。
其转录受CAP正调控和lacI负调控。
lacUV5突变能够在没有CAP的存在下更有效地起始 转录,该启动子在转录水平上只受lacI的调控,
lacI产物是一种阻遏蛋白,能结合在操纵基因lacO 上从而阻遏转录起始。乳糖的类似物IPTG可以和 lacI产物结合,使其构象改变离开lacO,从而激活 转录。
6.外源蛋白在菌体中的稳定性对表达效率的影响。
五、提高表达水平常用的方法 1.选择强启动子序列,如tac等 2.调整SD序列与AUG将的距离
3.改变起码密码下面的几组密码子 能提高翻译的起始效率。
4.增加mRNA的拷贝数和稳定性
在外源基因的下游插入“重复性基因外回文 序列”能防止mRNA受到3’ 5’外切酶的 攻击。
• 基因分类: 管家基因 表达很少受环境因素影响 可调节基因 受环境因素的诱导或阻遏 可诱导 可阻遏
按对刺激的反应性,基因表达的方式分为:
(一) 组成性表达
某些基因在一个个体的几乎所有细胞中 持续表达,通常被称为管家基因 (housekeeping gene)
• 无论表达水平高低,管家基因较少受环境因素影 响,而是在个体各个生长阶段的大多数或几乎全 部组织中持续表达,或变化很小。区别于其他基 因,这类基因表达被视为组成性基因表达 (constitutive gene expression)
(二)构建原核表达载体 适宜的选择标志;
具有能调控转录、生产大量mRNA的启动子; 含适当的翻译调控序列,和翻译起始点和 终止序列等;含合理设计的多接头克隆位 点,以确保目的基因按一定的方向与载体 正确连接(定向克隆 )。
⑴启动子
要求是:①强启动子②是诱导性的, 如热诱导和化学诱导
启动子
启动子
2.外源基因不能带有内含子。必须用cDNA,不能直 接用真核基因组DNA。
3.必须利用原核细胞的强启动子和 SD序列等调控元 件控制外源基因的表达
4.外源基因与表达载体连接后,必须形成正确的开 放阅读框架
5.防止外源基因产物对宿主细胞的毒害。
四、影响外源基因表达效率的因素
1.启动子的结构对表达效率的影响 (1)一致顺序 ①-35box • RNA聚合酶亚基的识别位点 ②-10box(Pribnow Box)
实际的启动子中很少具备与上述序列完全一 致的区域,启动子的这两个区域与上述保 守序列的相似程度越高,该启动子的表达 能力也就越强。
(2)-35区与-10区之间的距离
这两个保守区间的距离越是接近于17bp,启 动子的活性就越强。
2.翻译起始序列对表达效率的影响 (1)SD序列
SD序列与16SrRNA分子之间的碱基互补程 度,可明显影响mRNA的翻译速度,当序列 为5‘-GGAGG-3’,可与16SrRNA3’端完 全互补,翻译效率最高;而当该序列发生 单碱基突变时,翻译效率会下降30倍。
•
• ③、BL21(DE3)菌株
• 该菌株用于以T7RNA聚合酶为表达系统 的高效外源基因的蛋白表达宿主。T7噬菌 体RNA聚合酶基因的表达受控于λ噬菌体 DE3区的lacUV5启动子,该区整合于BL21 的染色体上。该菌适合于非毒性蛋白的表 达。
二、原核生物基因表达的特征
1.只有一种RNA多聚酶
4.不含内含子,缺乏转录后的加工系统。 5.调控主要在转录水平上。一是起始控制(启动子控
制),二是终止控制(衰减子控制)。
6.mRNA的核糖体结合位点 含有一个起始密码子和一段同核糖体16SRNA3’ 末端碱基互补的序列,SD序列
三、原核表达系统的注意事项
1.通过表达载体将外源基因导入宿主菌,并指导宿 主菌的酶系统合成外源蛋白
(3)细胞内的转运机制。 信号肽酶,信号肽酶等近20种蛋白质的参与。
六、外源蛋白质表达后的正确修饰
1.形成正确的二硫键
• 分子内二硫键、分子间二硫键。二硫键异 构酶催化。使蛋白质能够正确折叠。
人胰岛素分子
人血红蛋白分子
抗体分子
• 2.前体切割 如信号肽、内含肽等序列的切割。
3.蛋白质糖基化 • 增加蛋白质的稳定性和某些特殊性质。
• ①、JM109菌株
• 可作为大多数质粒载体的受体菌,也可以用于 制备M13等噬菌体载体的单链DNA。该菌株易于 培养,并且可以用较多的转化方法进行有效的转
化。 α-互补,容易鉴别重组体菌株
• ②、DH5α菌株
• 一种常用于质粒克隆的菌株。其j80lacZ△M15 基因的产物可与pUC载体编码的β-半乳糖苷酶氨 基端实现α互补,可用于蓝白斑筛选。recA1和 endA1的突变有利于克隆DNA的稳定和高纯度质 粒DNA的提取。
三、基因表达调控的生物学意义 (一)适应环境、维持生长和增殖 (二)维持个体发育与分化
基因表达调控的多级调控 (一)DNA水平
基因丢失;基因扩增 基因重排;甲基化修饰 染色质的结构状态 (二)RNA水平 转录水平调控 RNA的转录后加工 mRNA从核内向胞浆转运 mRNA稳定性 (三)蛋白质水平 翻译过程 翻译后加工 蛋白质的稳定性
大肠杆菌作为表达外源基因受体菌的特征
大肠杆菌表达外源基因的优势
1.全基因组测序,共有4405个开放型阅读框架 2.基因克隆表达系统成熟完善 3.繁殖迅速、培养简单、操作方便、遗传稳定 4.被美国FDA批准为安全的基因工程受体生物
大肠杆菌表达外源基因的劣势
1.缺乏对真核生物蛋白质的复性功能 2.缺乏对真核生物蛋白质的修饰加工系统 3.内源性蛋白酶降解空间构象不正确的异源蛋白 4.细胞周质内含有种类繁多的内毒素
PlL PrecA
PtraA
Ptrp Plac
Ptac
-35 区序列 -10 区序列
TTGACA TTGATA TAGACA TTGACA TTTACA TTGACA
GATACT TATAAT TAATGT TTAACT TATAAT TATAAT
Ptac = 3 Ptrp = 11 Plac
Lac启动子
5.减轻宿主细胞的代谢负荷
合理地调节代谢负荷与外源基因高效表达的 关系。
(1)诱导表达 将宿主生长代谢与外源基因表达分开。
一般采用温度诱导或药物诱导。
λPL启动子是温度诱导型
32℃
cⅠ857阻遏物有活性,抑制λPL启动子,外源基因 不表达,宿主大量生长。
42℃:
cⅠ857阻遏物失活,PL启动子启动,外源基因高 水平表达,宿主生长受到限制。
一、宿主菌
受体细胞的基因型: 野生型大肠杆菌的基因(指没有发生突变的基因)
野生型加“+”,突变型加“-”(但后者往往被 省略),表示的方法的规则如下: ①根据基因产物或作用产物的英文名称,取其单 词的第一字母,拼成三个字母并以斜体来表示。 如:DNA Adenine Methylase, 即dam。 ② 变异基因不同,用作用结果的英文名称的前三 个字母斜体表示,并加上一大写字母,以示区别。 如:Recombination , recA、recB、recC。 ③ 某个基因缺失时,在该基因型前加“△”。 ④由于某个基因变异导致大肠杆菌的特征发生变 化,也可以用该特征的英文名来表示,但第一个 字母要大写,并加上“+”或“r”表示有抗性, 加上 “-”则表示敏感。如:Ampicillin(氨卞青霉素),抗 性标记为Ampr, 敏感性为Amp-。