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曙光作业管理-调度系统安装配置手册

Torque + Maui配置手册之抛砖引玉篇本文将以应用于实际案例(南航理学院、复旦大学物理系、宁波气象局)中的作业调度系统为例,简单介绍一下免费开源又好用的Torque+Maui如何在曙光服务器上进行安装和配置,以及针对用户特定需求的常用调度策略的设定情况,以便可以起到抛砖引玉的作用,使更多的人关注MAUI这个功能强大的集群调度器(后期将推出SGE+MAUI版本)。

本文中的涉及的软件版本Torque 版本:2.1.7 maui版本:3.2.6p17。

1. 集群资源管理器Torque1.1.从源代码安装Torque其中pbs_server安装在node33上,TORQUE有两个主要的可执行文件,一个是主节点上的pbs_server,一个是计算节点上的pbs_mom,机群中每一个计算节点(node1~node16)都有一个pbs_mom负责与pbs_server通信,告诉pbs_server该节点上的可用资源数以及作业的状态。

机群的NFS共享存储位置为/home,所有用户目录都在该目录下。

1.1.1.解压源文件包在共享目录下解压缩torque# tar -zxf torque-2.1.17.tar.gz假设解压的文件夹名字为: /home/dawning/torque-2.1.71.1.2.编译设置#./configure --enable-docs --with-scp --enable-syslog其中,默认情况下,TORQUE将可执行文件安装在/usr/local/bin和/usr/local/sbin下。

其余的配置文件将安装在/var/spool/torque下默认情况下,TORQUE不安装管理员手册,这里指定要安装。

默认情况下,TORQUE使用rcp来copy数据文件,官方强烈推荐使用scp,所以这里设定--with-scp.默认情况下,TORQUE不允许使用syslog,我们这里使用syslog。

1.1.3.编译安装# make# make installServer端安装设置:在torque的安装源文件根目录中,执行#./torque.setup root以root作为torque的管理员账号创建作业队列。

计算节点(Client端)的安装:由于计算节点节点系统相同,因而可以用如下SHELL script (脚本名字为torque.install.sh)在其余计算节点上安装:创建torque.install.sh脚本#vi torque.install.sh#!/bin/shcd /home/dawning/torque-2.1.7make install使用如下命令:npssh -on node1..32 sh /home/dawning/torque.install.sh 将在每个节点上安装TORQUE。

1.1.4.TORQUE配置1.1.4.1 在计算节点上配置TORQUE:在每个计算节点,必须配置MOM daemon信任pbs_server daemon,可以通过编辑/var/spool/torque/server_name来实现,把node33写入该文件即可。

#cat /var/spool/torque/server_namenode33其余的配置参数写入/var/spool/torque/mom_priv/config 文件。

配置计算节点的数据管理,数据管理允许作业的数据在计算节点和PBS_Server之间传递。

对于共享文件系统,如NFS,可以通过在mom_priv/config 中用$usecp参数来指定如何映射用户的根目录。

$usecp *:/home /home这里集群的mom_priv/config内容如下:# MOM server configuration file# if more than one value, separate## rule is defined by the name## host allowed to connect to mom server on privileged port# note: IP address of host running pbs_server it by comma.$pbsserver 10.0.68.33$clienthost node33#ideal processor load and max processor load$ideal_load 7$max_load 8## host allowed to connect to Mom server on unprivileged port#Specifies hosts which can be trusted to access mom services as non-root.#By default, no hosts are trusted to access mom services as non-root.$restricted *.node33## Log event :# 0x1ff : log all events + debug events# 0x0ff : just all events$logevent 0x0ff## alarm if the script hang or take very long time to execute$prologalarm 30## Specifies which directories should be staged$usecp *:/home /homeServer端资源管理配置指定计算节点为了让pbs_server与每个计算节点进行通信,它需要知道要和那些机器联络,集群中的每个计算节点都必须在nodes文件中指定,一个1行。

#rsh node33#cd /var/spool/torque/server_priv#for i in `seq 1 32`;do echo node$i np=2;done > nodes#cat nodesnode1 np=8node2 np=8node3 np=8node4 np=8node5 np=8node6 np=8node7 np=8node8 np=8node9 np=8node10 np=8node11 np=8node12 np=8node13 np=8node14 np=8node15 np=8node16 np=8node17 np=8node18 np=8node19 np=8node20 np=8node21 np=8node22 np=8node23 np=8node24 np=8node25 np=8node26 np=8node27 np=8node28 np=8node29 np=8node30 np=8node31 np=8node32 np=8np=8是说每个节点有8个CPU(其余的以线程来跑)。

指定作业的提交节点为node33,node34,node35:[root@node33 ~]# qmgr -c 'set server submit_hosts = node33'[root@node33 ~]# qmgr -c 'set server submit_hosts += node34'[root@node33 ~]# qmgr -c 'set server submit_hosts += node35'1.1.5.系统自动启动脚本1.Server的系统启动脚本/etc/init.d/pbs_server该脚本单独启动/重新启动/暂停/查看状态TORQUE中Server的守护进程#cp contrib/init.d/pbs_server /etc/init.d/编辑pbs_server:#vi /etc/init.d/pbs_serverPBS_DAEMON=/usr/local/sbin/pbs_serverPBS_HOME=/var/spool/torque要确保这两个变量设定正确。

2.Mom系统启动脚本/etc/init.d/pbs_mom,在计算节点执行。

该脚本单独启动/重新启动/暂停/查看状态TORQUE中Mom的守护进程。

#cp contrib/init.d/pbs_mom /etc/init.d/#vi /etc/init.d/pbs_momPBS_DAEMON=/usr/local/sbin/pbs_momPBS_HOME=/var/spool/torquePBS_SERVER端测试:重启pbs_server,使刚才的配置生效。

>/etc/init.d/pbs_server restart# verify all queues are properly configured> qstat -q# view additional server configuration> qmgr -c 'p s'# verify all nodes are correctly reporting>pbsnodes -a# submit a basic job - DO NOT RUN AS ROOT> su - testuser>qstat2. 调度器系统MAUI的安装配置2.1.1.在共享目录下解压缩MAUI# tar -zxf maui-3.2.6p17.tar.gz假设解压的文件夹名字为: /home/dawning/maui-3.2.6p172.1.2.编译要是MAUI和TORQUE无缝的结合在一起,确保管理节点(PBS SERVER)上TORQUE的路径设置正确,#./configure --with-pbs=/usr/local#make#make install2.1.3.MAUI自启动脚本[root@node33 maui-3.2.6p17]# cp etc/maui.d /etc/init.d/[root@node33 maui-3.2.6p17]# vi /etc/init.d/maui.d#!/bin/sh## maui This script will start and stop the MAUI Scheduler## chkconfig: 345 85 85# description: maui#ulimit -n 32768# Source the library functions. /etc/rc.d/init.d/functionsMAUI_PREFIX=/usr/local/maui# let see how we were calledcase "$1" instart)echo -n "Starting MAUI Scheduler: "daemon $MAUI_PREFIX/sbin/mauiecho;;stop)echo -n "Shutting down MAUI Scheduler: "killproc mauiecho;;status)status maui;;restart)$0 stop$0 start;;*)echo "Usage: maui {start|stop|restart|status}"exit 1esac2.1.4.与MAUI结合的node33上TORQUE设置在TORQUE的qmgr上[root@node33 maui-3.2.6p18]# qmgrMax open servers: 4Qmgr: set server managers += root@*.node33Qmgr: set server operators += root@*.node33Qmgr: set server scheduling=TrueQmgr: quit要确保set server scheduling=True这条,这条语句确保了可以使用MAUI调度。

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