海洋生物基因工程理论.
中 心 法
则
1973年 Cohen 第一例成功的克隆实验
基因工程或称基因重组技术,是将不
同生物的基因在体外人工剪切、组合,并
和载体(质粒,噬菌体,病毒)DNA连
接,然后转入微生物或细胞内,进行扩
增,并使转入的基因在细胞内表达,产
生所需要的蛋白质。
示意图
载 体 DNA (限 制 性 内 切 酶 切 开 ) 目的基因
二、重组DNA技术基本原理
(一)目的基因的获取
1. 化学合成法
用于已知序列,或可推导出序列的基因酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)
动物病毒DNA改造的载体 (如腺病毒、腺病毒相关病毒、逆转录 病毒)
表达载体的条件
① DNA复制及质粒DNA的筛选系统
② 目的基因的转录系统 包括:启动子、抑制物基因和转录终止子 ③ 蛋白质的翻译系统
包括:核糖体的识别位点、翻译起始和终止
密码子
Prokaryotic Expression System
M13噬菌体DNA改造系统(含lac Z基因) M13mp系列 pUC系列
Color selection
Blue / White
3. 其他
柯斯质粒(cosmid)
酵母人工染色体载体 (yeast artificial chromosome, YAC) 细菌人工染色体 (bacterial artificial chromosome, BAC)
根据产物的功能可以分为结构基因(酶和不 直接影响其他基因表达的蛋白质)和调节基 因(阻遏蛋白或转录激活因子)两大类。
下图
1953年: Watson和Crick提出了DNA的双螺旋模型
The double-helical structure of DNA
The semiconservative nature DNA replication
海洋生物工程
主讲人: 马翠萍
青岛科技大学化学与分子工程学院
生物工程,是20世纪70年代初开始兴起的一门新
兴的综合性应用学科。 一般认为是以生物学(特别是其中的微生物学、遗 传学、生物化学和细胞学)的理论和技术为基础,结 合化工、机械、电子计算机等现代工程技术, 充分运用分子生物学的最新成就,自觉地操纵遗传物 质,定向地改造生物或其功能,短期内创造出具有超 远缘性状的新物种,再通过合适的生物反应器对这类 “工程菌”或“工程细胞株”进行大规模的培养,以 生产大量有用代谢产物或发挥它们独特生理功能一门 新兴技术。
(compatible end),可用连接酶连接。
限制性内切酶 识别 特定的
碱基序列
下图
限制性内切酶造成粘性末端
有利于 重组DNA 分子的构建
末端转移酶 在载体及外源 双链DNA的3' 端各加上一段 寡聚核苷酸, 制 成人工粘性末 端,
然后在DNA连 接酶的作用下, 连接成为重组 的DNA.
(三)目的基因
能携带目的基因,实现无性繁殖所采用的 可独立复制的完整DNA分子。又称克隆载体。 其中为表达出蛋白质设计的载体又称表达载 体。
常用的载体:
质粒、噬菌体DNA、病毒DNA
载体的选择标准:
能自主复制;
具有两个以上的遗传标记物,便于 重组体的筛选和鉴定;
有克隆位点(外源DNA插入点), 常具有多个单一酶切位点,称为多 克隆位点; 分子相对较小,一般3-10 Kb
应用重组DNA技术所要分离、获得的基因。
1. cDNA (complementary DNA) 是指经反转录合成的,与RNA互补的单链DNA。以单链 cDNA为模板,经聚合反应可合成双链cDNA。
2. 基因组DNA(genomic DNA)
是指代表一个细胞或生物体整套遗传信息的所有DNA序列。
(四)基因
是存在于细菌染色体外的小型环状双链DNA
分子。大小约为
数千碱基对。常
有 1 ~ 3个抗药
性基因,以利于
筛选。
Eco R Ⅰ
Hind Ⅲ Bam HⅠ Sal Ⅰ
氨苄青霉素 抗性基因 Pst Ⅰ
pBR322
四环素 抗性基因
Ava Ⅰ
Ori
Pvu Ⅱ
2.噬菌体(phage)DNA
获取同一拷贝的过程,即无性繁殖。
分子克隆(DNA克隆)
细胞克隆 个体克隆(动物或植物)
DNA克隆:
应用酶学的方法,在体外将各种来源 的 DNA与载体DNA结合成具有自我复制能力的 DNA分子,继而通过转化或转染宿主细胞, 筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行 扩增、提取获得大量同一DNA分子,又称基因 克隆。
生物工程包括5大工程: 基因工程、 细胞工程、 酶工程、 发酵工程、 生物反应器工程。
海洋生物基因工程
(理论)
制作人: 马翠萍
青岛科技大学化学与分子工程学院
基因工程是生物技术的核心部分。
基因
或RNA)的DNA序列。
(gene)
基因是能够表达和产生基因产物(蛋白质
根据产物的类别可以分为蛋白质基因和RNA 基因(rRNA基因和tRNA基因)两大类;
文结构。
5’· · ·· · ·GGATCC · · ·· · ·3’ 3’··· · · ·CCTAGG · · ·· · ·5’
5´-端突出
粘性末端
3´-端突出
平末端 限制性核酸内切酶识别序列长度为4~8个bp。 不同酶切产生的相同粘性末端称配伍末端
5’AATTC—— 3’G—— 5’G—— 3’ACGTC——
(二)工具酶
限制性核酸内切酶 DNA聚合酶 逆转录酶 DNA连接酶 末端转移酶
Taq DNA聚合酶
限制性核酸内切酶
(restriction endonuclease)
识别DNA的特异序列,并在识别位
点或其周围切割双链DNA的一类内切酶。
是细菌内存在的保护性酶。分为I、II、 III三类。II类酶识别序列特点为回
重组体
宿主细胞
已转化的宿主细胞
繁殖 阳性克隆株
表达
所以,基因工程的操作包含以下步骤: 获得目的基因 构造重组 DNA 分子
转化或转染
表达
蛋白质产物的分离纯化
一、重组DNA技术相关概念
(一)DNA克隆
克隆(clone):
来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合。
克隆化(cloning):