第三章 藻类基因工程
现已证明,来自大肠杆菌、枯草杆菌以及人的 一些外源基因可以在蓝藻中表达,例如大肠杆菌 谷氨酸脱氢酶基因在蓝藻中表达引起抗铵,人的 超氧化物歧化酸(superoxide dismutase, SOD)基因 在蓝藻中表达以减少氧胁迫。这就可能通过引入 外源基因,以赋于蓝藻新的遗传特性,或作为重 要的天然产物基因表达的宿主。目前还成功地将 芽孢杆菌的杀虫毒素基因导入并表达于几种蓝藻 细胞中。这些都标志着蓝藻基因工程正向着实用 目标迈进。
穿梭载体能否在宿主蓝藻中稳定维持取决于多方面 的原因:首先,蓝藻中存在多种限制性内切酶,实际上, 已在E.coli中实现商品化生产的多种限制性内切酶如 Ava I、AvaⅡ等都来源于蓝藻,解决的办法是利用携 有合适的甲基化酶基因的E.coli宿主,对穿梭载体的 特异位点进行甲基化修饰,从而改善其在蓝藻中的稳 定性。其次,导入的质粒与宿主质粒之间可能发生同 源重组,因此,转化前对内源性质粒的清除显得非常 必要。Matsunaga等(1990)对海洋蓝藻Synechococcus NKBG 042902-YG1116的转化试验中,用溴化乙锭处理 藻株,清除内源质粒pSY10与pSY09,得到很好的效果, 而未经处理的藻株,则不能被转化。
脉冲匀直变角电泳(PHOGE)技术的应用带来基 因定位工作的突破。Bancroft等1989年借助于限 制酶切、PHOGE与Southern杂交技术,已得到 Anabaena PCC 7120的基因图谱,结果表明,尽 管蓝藻基因的组织也采用操纵子的形式,但功能 相关的基因并非集中在一处,而是分散于染色体 上 不 同 位 置 。 继 A.PCC 7120 之 后 , 海 洋 蓝 藻 Synechococcus PCC 7002的染色体物理图谱也 已完成。深入开展的基因克隆与基因图谱绘制工 作无疑为蓝藻的基因操作奠定了基础。
四、基因枪法
基因枪法又称微粒子轰击法,基本原理:利 用基因枪的火药爆炸、高压放电或高压气体作 驱动力,将吸附或包裹有DNA的金粉或钨粉微 粒高速发射,击中并高速穿透真空室中受体的 细胞壁及原生质膜到达细胞内,从而达到将吸 附于微弹上的外源DNA导入受体细胞或原生质 体,并获得整合和表达基因。
五、载体
自1973年发现蓝藻质粒以来,已在约50 %被检 单细胞及丝状蓝藻中证明了内源性质粒的存在, 质粒数目从1~10个不等,大小在1.3-130 Kb之间, 但只在极少数淡水蓝藻中找到质粒编码功能的证 据,一般认为蓝藻质粒属隐秘型质粒。至今蓝藻 质粒尚未发现可识别的遗传标记,不能在E.coli中 复制,不能作为克隆载体。
常用遗传转化方法
一、接合转移
接合转移是指利用广谱宿主接合质粒,使DNA 通过细胞接触从一种细菌转移到蓝藻。这个系统 需先构建含有目的基因、大肠杆菌、蓝藻质粒复 制起点及转移起点、选择标记的杂交质粒,转化 含有辅助质粒的E.coli菌株,再通过接合引入一个 具有编码接合装置的基因,使3种质粒由于无法复 制或整合而逐渐丢失;杂交质粒或以自主复制形 式存在,或与蓝藻染色体发生同源重组而稳定存 在。
2.重组DNA分子的构建 一般将带有目的 基因的DNA片段连接到能够独立复制并具 有选择标记的载体上,如质粒、噬菌体和 病毒等,以形成重组DNA分子。DNA片断 与载体的连接方式主要有同聚末端连接、 粘性末端连接、平齐末端连接及人工接头 分子连接。
3.重组DNA分子的转化及扩增 重组DNA 必须进入宿主细胞DNA中,才能得到扩增 和表达。根据载体的性质不同,可采用转 染、转化、转导等方式,将重组DNA分子 导入宿主细胞内,并使其大量繁殖。
研 究 概 况
藻类基因工程起步较晚,60年代首先对蓝细菌 (Cyanobacteria)进行了分子遗传学的研究,近 10年来,在蓝藻载体构建、基因克隆、基因转 移、基因表达、功能分析等方面都取得了显著 的进展。这为在分子水平上了解蓝藻的合光作 用、生物固氮、细胞代谢等重要过程提供了可 能性,同时又为蓝藻的遗传操作开辟了新的前 景。
大型藻类基因工程的研究方兴未艾,特别 是质体基因组结构、序列及定位方面做了 大量的研究,并能以其基因序列进行藻类 发生和分类方面的研究,同时,对其转化 模式的建立也进行了有益的探索。高等植 物基因工程研究中发展起来的一系列直接 导入外源基因的方法可能成为藻类转基因 的有效手段,并对藻类基因工程的发展起 到促进作用。
除了依靠穿梭载体,人们还试图寻求其他 的方法。海洋蓝藻噬菌体早在1989年Bergh 就已报道,最近,又分离到一种新的海洋 蓝藻噬菌体(ms-1)并对其宿主范围进行了感 染试验,发现Synechococcus NKBG 042902 对它十分敏感。研究海洋蓝藻的噬菌体转 导机制,发展噬菌体载体系统,以期在特 异性宿主蓝藻中获得外源基因表达,为构 建蓝藻基因工程载体提供了新的思路。
第二节 用于基因工程研究的藻类
原核微藻:蓝藻
微 藻
真核微藻:绿藻、硅藻 褐藻门
大型藻
红藻门 绿藻门
1. 蓝藻门
蓝藻又称蓝细菌,是藻类中最原始的类群,是 光合自养的原核生物。蓝藻有单细胞、丝状、中 空球状和立方体等形状,但大多数蓝藻为不定型 群体,并常具有一定形态和颜色的胶被。 蓝藻分子遗传学研究始于20世纪60年代,由于 蓝藻的结构和遗传复杂性类似于革兰氏阴性细菌, 部分种类还具有天然转化系统和有效重组系统, 使得蓝藻分子遗传学得到迅速发展,在光合作用、 生物固氨、植物进化等基础研究中的地位不断上 升,目前已成为藻类分子遗传学的前沿。其自身 的理论体系和研究手段正趋于成熟。
1.2 海洋蓝藻基因转移系统
1968 年 Bazin 证 实 了 蓝 藻 的 遗 传 重 组 现 象 , 1970 年 Shestakov与Khyen首次发现Synechococcus PCC 7943 的DNA天然转化作用。目前已确认可天然转化的蓝藻是不 产生异形胞的单细胞种类,绝大多数属于Synechococcus 与Synechocystis两个属,至今已发展了两种类型的基因 转移系统,一种是遗传转化,包括天然转化、诱导转化和 电击穿孔;另一种是接合转移。以往由于淡水蓝藻在养殖 中所处的特殊位置,遗传转化的研究得以普遍地开展。近 年来,随着海洋生物技术的发展,已分离到多种具有经济 开发潜力的海洋蓝藻,其中有些种类能够高效地进行光合 作用,有些种类则能产生一些重要的生化物质,如植物生 长调节剂、UV吸收蛋白复合体、高活性SOD与酪氨酸酶 抑制剂等等。上述特点吸引了人们将越来越多的注意力投 入到海洋蓝藻基因工程的研究,并已取得一系列成果。
至今,应用于蓝藻遗传转化的供体DNA大体可分 为三类:第一类是直接利用未修饰的外源质粒,如 pBR322,pBR328等,可将外源DNA导入蓝藻, 但效率很低,且对受体需做特殊的处理;第二类是 利用自身染色体或基因组,通过同源重组作为插 入突变的有效方法,在这方面,海洋蓝藻 Synechococcus PCC 700 Stevens,1980年有过 成功尝试,嵌入Strr标记的染色体片段天然转化成 功;第三类即是穿梭载体。研究结果表明,穿梭载 体是一方便、有效的运载体,海洋蓝藻的遗传转 化也大多采用穿梭载体作为中介(表1)。
第三章 藻类基因工程
第一节 概念及研究内容及概况
藻类基因工程亦称藻类遗传工程或藻类重组 DNA技术,是以海藻为研究对象将某种生物基 因通过基因载体或其他手段运送到海藻活细胞 中,并使之增殖(克隆)和行使正常功能(表达), 从而创造出藻类新品种的遗传学技术。
通过对藻类基因工程的研究,一方面期望 从改造的藻体中筛选出抗性强且生长快的 优良藻种,并把藻类作为新型的生物反应 器生产某种特殊的有用物质;另一方面期望 从藻类中分离、克隆有重要经济价值的基 因,作为农作物改良的目的基因或用于微 生物发酵生产。
4.对重组克隆(recombinant clone)进行筛选 在转化实验中,一些细胞被转化,一些细 胞未被转化,因此需要筛选出被转化的宿 主细胞。筛选可利用载体的遗传标志,如 抗菌素抗性等来进行选择。
5.鉴别特定重组克隆 由于种种因素的影响,筛 选出来的并不一定是真正转化的细胞,需要作进 一步鉴定,可用核酸杂交、免疫化学法等。另外, 由于整合部位等位置效应,外源DNA在宿主细胞 内的表达强度等也不同,还需要进一步弄清目的 克隆中外源DNA片段上的基因的结构和功能。主 要有酶切图谱的制定、基因在DNA片段上的精确 定位、确定是否含有内含子、DNA序列分析、离 体翻译实验、外源基因在宿主细胞中的表达及产 物提纯等。
藻类基因工程作为基因工程的一个分支,相应地 包括以下几个主要步骤: 1.获得带有目的基因的DNA片断 用限制性内切 酶切割生物染色体DNA,得到大小不同的DNA片 段,其中的某一片段上可能刚好有所需要的目的 基因;以mRNA为模板,用反转录酶进行反转录合 成互补DcD合成法直接合 成某个基因。
二、天然转化与诱导转化
天然转化是指蓝藻在指数生长期不经过处理直 接吸纳外源DNA。聚球藻是首次报道的可天然转 化的藻株(Shestakov和Khuyen,1970)。目前 发现的可天然转化的蓝藻绝大多数属于聚球藻和 集胞藻两个属。蓝藻天然转化的机制虽不太清楚, 但估计绝大多数单细胞品系可能具有天然感受态, 其机制可能与细菌具有相似之处。 诱导转化是指通过人工诱导感受态进行遗传转 化,如Ca2+可有效诱导集胞藻感受态的形成。
真核藻类(eukaryotic algae)基因工程起始于80年代, Rochaix和Dillewjin(1983)第一个报道了他们利用 质 粒 为 载 体 对 单 细 胞 绿 藻 ——— 莱 茵 衣 藻 (Chlamydomonas reinhardi Dang)进行基因转移的 研究。随着真核藻类基因工程研究的广泛深入, 目前衣藻已成为叶绿体、线粒体与染色体三套基 因组均能遗传转化的藻类。除衣藻外,椭圆小球 藻(Chlorella ellipsoidea Gern.)也正在成为另一个单 细胞绿藻转化系统,目前已对20余种红藻进行了 研究,在14种红藻中发现有质粒,数目一至多个 不等。近两年来,在一些经济藻类如钝顶螺旋藻 (Spirulina platensis)、真江蓠(Gracilaria asiatica)中 也发现了质粒。真核藻类特别是一些经济藻类质 粒的发现,为真核藻类基因工程提供了潜在的载 体,对藻类基因工程的发展具有积极意义。