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氨基质子化

A=Log Io/I = ecl e 消光系数; c 浓度; l 光程
Lambert-Beer’s law: A=Log Io/I = ecl e, extinction coefficient; c, concentration; l, optical length
7.3 Ser, Thr, Asn, Gln, Cys, 和 Pro具有极性、不带电 的侧链基团.
7、20种标准氨基酸,按照侧链基团进行分组
7.1 6种氨基酸是非极性的, 属于脂肪族 氨基酸 7.1.1 Gly, Ala, Val, Leu, Ile和 Met. 7.1.2甘氨酸(a-氨基乙酸)的侧链是个氢原子,
是 20种氨基酸中最简单的,所以甘氨酸的a-碳不是 手性碳。
7.1.3在蛋白质结构中,Gly 最具弹性, 易弯曲. 7.1.4 Ala, Val, Leu, Ile和Met具有烃的侧链, 有 疏水性
2.1 许多种蛋白质可以从不同的器官转运大分 子物质。有许多存在于血浆中。如:血色素 (oxygen), 血清清蛋白 (fatty acids), 脂蛋白 (lipids), and 铁传递蛋白(iron).
2.2 许多种蛋白质可以转运小分子物质从血浆 膜或细胞膜。 (glucose葡萄糖, amino acids氨基酸, nucleotides核苷, chloride氯化物, potassium钾离子, 钠离子sodium ion).
素) 7 、蛋白质调节细胞活动或生理活动。
7.1生长因子和转录因子调控细胞的生长和分化。
7.2激素调控多细胞生物的不同细胞的活动。
8、 蛋白质在遗传和神经冲动的传导中起重要的 作用。
8.神经传导中起 重要的作用。
9 、蛋白质的其他功能 。抗冻剂蛋白使南极洲 的鱼类防冻。喜温细菌的特殊的热稳定性蛋白。
第2章 蛋白质的构件——氨基酸 第3章 蛋白质的通性、纯化和表征 第4章 蛋白质的共价结构
蛋白质的重要性
1、有机体内的反应几乎都需要酶的刺激. 1.1许多种酶已经被发现,每一种酶都催化不
同的化学反应。
1.2 生命离不开酶的催化作用。 1.3酶是多种多样的,具有高效专一、活性的 蛋白质。
2 、一些特殊的蛋白质可以转运分子和离子
5、 每个氨基酸都有三个字母的缩写和一个字母的符 号。 一定要记住这20种氨基酸的缩写、分类和8种重 要的氨基酸的结构 ※
6、在所有种中(从细菌到人),所有的蛋白质都由 20种氨基酸构成。
6.1所有的蛋白质, 无论它们是多么的不同,在 结构和功能中,都是用这 20个标准氨基酸构成的。
6.2 构成蛋白质的氨基酸至少有二十亿岁。
糜蛋白酶活性位点
萤火虫发光受荧光素酶 和 ATP 催化
红血球 含有大量的血色素和氧转运蛋白
角蛋白 是头发,触角,指甲 和羽毛的主要成分
第一节 氨基酸的结构和分类
1、 最初蛋白质的研究
1.1 在1806年,从芦笋(asparagus)里发现了第一 个氨基酸:天冬氨酸(asparagine)
1.2 直到1938年,最后一个氨基酸苏氨酸 (threonine) 被发现!
7.2 Phe, Tyr, 和 Trp 是芳香族 的氨基酸 7.2.1 Phe 和 Tyr 都有苯环 7.2.2 Trp 有一个吲哚环 7.2.3二种氨基酸有疏水性. 7.2.4 在蛋白质中,Tyr 的-OH有重要的作用 (使
蛋白磷酸化) 7.2.5 在280 nm具有光吸收,利用这个性质可以
测定蛋白质的浓度
Lined up by similarity: chiral to chiral, COO to CHO
4、 氨基酸在水溶液中电离.
4.1氨基酸晶体要比相似大小的其他有机 分子熔点高得多。
4.2 在不同的pH 条件下,氨基酸的电离 程度不同。
4.3氨基酸在水溶液中,一般以兼性离子 的形式存在,在生理条件下(pH=7附近),氨 基质子化(-NH3+),而羧基离子化(-COO -),
3 、蛋白质有营养或贮存的功能。例如:许多这种 的蛋白质存在于植物细胞中。卵清蛋白 铁蛋白在动 物组织中贮存铁离子。(大约每个铁蛋白中可以贮 存4500个铁离子。)
4、蛋白质在机体的运动中起到了重要的作用。 例 如, 肌动蛋白 和 肌球蛋白存在于肌肉和非肌肉的细 胞中。 微管蛋白和 动力蛋白存在真核细胞的鞭毛和 纤毛。
5、蛋白质在机械支持(力量和保护)中起重要 的作用。
5.1 胶原质
5.2 弹性蛋白 存在与韧带中.
5.3 角蛋白存在于头发、指甲,皮革
5.4 蚕丝蛋白 存在于丝光纤和蜘蛛网中。
5.5 节肢弹性蛋白 存在于昆虫的翅膀连接 处。
6、蛋白质能够保护生物体。 6.1 脊椎动物中的免疫蛋白 6.2血液凝结过程中的纤维蛋白原和凝血素。 6.3蛇毒,细菌毒素和有毒的植物蛋白(蓖麻毒
1.3所有的氨基酸被给一个普通的名字. Glutamate(谷氨酸) 来自小麦麸. Tyrosine 来自与奶 酪
2、 20 种氨基酸含有相似的结构特征
2.1 20种氨基酸都被称之a-氨基酸,因为a氨基酸分子中的a-碳(分子中第2个碳,Ca)结合 着一个氨基和一个酸性的羧基
2.2Ca还结合着一个H原子和一个侧链基团 (用R表示)。
2.3 有19种a –碳是不对称的(手性碳原子) 有两种对映体。Glycine 没有旋光性。
3 、 氨基酸分为D-型氨基酸和L-型氨基酸 3.1 D-型氨基酸和L-型氨基酸是与构型标准物-
甘油醛比较得出的结果
3.2蛋白质中只存在L-型氨基酸。仅仅在一些细菌 的细胞壁肽链或抗生素的肽链中存在D-型的氨基酸。
7.3.1 R 基团有亲水性是由于有羟基 ,硫原子和 氨基基团.
7.3.2 在蛋白质中, Cys 的-SH 氧化形成二硫 键
7.3.3 Cys经常参与疏水作用
7.3.4脯氨酸(β-吡咯烷基-a-羧酸)有一个环 形的饱和烃侧链,所以严格地讲,脯氨酸是一个亚 氨基酸,具有刚性结构。
7.3.5脯氨酸常出现在蛋白质的弯曲处和蛋白质 的表面 ,弹性最差。
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