油滴
多为单细胞，或形成放射状、链状、带状等群体、丝状体，或埋于胶质块中。
细胞分裂：2个子细胞各以母体的上下壳为上壳，形成新细胞。
产生复大孢子、小孢子或休眠孢子。
褐藻门
细胞壁由纤维素（内层）和藻胶质（褐藻糖胶，外层）组成；细胞核较其他藻大的多。
叶绿素a、叶绿素c、β-胡萝卜素、叶黄素及褐藻素；色素体多数，侧生，或星状、轴生，或螺旋带状或分枝状。
营养繁殖、无性繁殖和有性生殖均有。
轮藻门
大型沉水藻类，外观似有根茎叶的分化。茎明显分化成节和节间两部分，有的每节上生出一轮短的小枝轮。
叶绿素a、叶绿素b、叶黄素和β-胡萝卜素等；
淀粉
营养繁殖：植物体断裂、产生匍匐茎或地下假根的节上产生珠芽。
有性生殖：卵配。雌雄同株或异株。
白糖素、油滴。
单细胞、群体、多核管状体或丝状体。
游动种类：细胞纵分裂；丝状种类：丝体断裂繁殖；无性繁殖产生动孢子、似亲孢子或不动孢子；有性繁殖种类少，常为同配。
硅藻门
细胞壁由硅质和果胶质组成，高度硅质化而成为坚硬的壳体，分上下两壳，套合在一起。
叶绿素a、叶绿素c、β-胡萝卜素、岩藻黄素、硅藻黄素等；色素体粒状、片状、叶状、分枝状或星状，分布在细胞体内。
大多为单细胞运动个体，少数营固着生活。
通常为细胞纵分裂，也可形成休眠孢囊。
绿藻门
细胞壁由纤维素（内层）、果胶质（外层）组成，少数无细胞壁。
叶绿素a、叶绿素b、叶黄素和β-胡萝卜素等；色素体有盘状、杯状、星状、带状和板状等，常具1至多个蛋白核。
淀粉
体型复杂，有单细胞、群体、胶群体、丝状体、膜状体、异丝体、管状体等类型。
淀粉、油滴。
多为单细胞具鞭毛的运动个体，少数为群体或丝状体。
主要是细胞分裂：纵分裂、横分裂或延板片连接线斜分裂。少数种类可形成动孢子或不动孢子；仅少数种类具有性生殖。
金藻门
大多具鞭毛（多2条，等长或不等长）；细胞裸露或在表质上具硅质化鳞片、小刺或囊壳。
叶绿素a、叶绿素c、β-胡萝卜素、叶黄素及金藻素；色素体1-2个，片状，侧生。
无性繁殖：产生孢子。有内生孢子、外生孢子或休眠孢子（厚壁孢子）。
红藻门
具1核，或幼时1胶、卡拉胶）。
叶绿素a、叶绿素d、叶黄素、β-胡萝卜素、红藻红素、红藻蓝素等。
红藻淀粉
少数为单细胞和群体；多细胞体有：简单的单列或多列细胞的丝状体，许多藻丝组成的圆柱状或膜状的植物体。
淀粉、油滴。
多为单细胞的运动个体，少数种类型呈不定形群体。
游动种类：细胞纵分裂；
群体或不具鞭毛种类：产生游动孢子。
甲藻门
大多单细胞、有鞭毛的运动个体，细胞裸露或具纤维素细胞壁。纵裂甲藻：细胞壁由左右两片组成；横裂甲藻：细胞壁由许多小板片组成，具横沟和纵沟，沟内各具1鞭毛。
叶绿素a、叶绿素c、β-胡萝卜素、甲藻素、多甲藻素等。色素体多个，盘状、棒状、带状或片状，
褐藻淀粉和甘露醇
均为多细胞体，有异丝体、假膜体、膜状体等体形。
无性繁殖：产生游动孢子或不动孢子；
有性生殖：同配、异配或卵式。
裸藻门
无细胞壁；细胞前端由胞口与外界相通。鞭毛1条或2条，罕见3条。
叶绿素a、叶绿素b、β-胡萝卜素等，有的具裸藻红素。色素体多数，盘状、片状或星状。
副淀粉（裸藻淀粉），兼有脂肪。
藻类各门主要特征对比表
形态结构
色素、色素体
贮存物质
体制
繁殖方式
蓝藻门
无细胞核；细胞壁成分有：纤维素（内层）、果胶质（外层）、黏质缩氨肽（特有）等。
叶绿素a、β-胡萝卜素、蓝藻黄素、蓝藻叶黄素、蓝藻藻蓝蛋白、蓝藻藻红蛋白。无色素体。
蓝藻淀粉、蓝藻颗粒体。
主要是群体或丝状体，很少单细胞。
营养繁殖：1个母细胞分成2个子细胞；或1个母群体分成2个或多个子群体。
白糖素、油滴。
多为单细胞或群体，少数为丝状体。
游动单细胞种类：细胞纵分裂；
群体种类：群体断裂成2个或更多的小片，然后分别长成新个体；
不动种类：产生动孢子或内壁孢子（静孢子）。
黄藻门
游动的营养细胞核生殖细胞具2条不等长的鞭毛，长的一条向前，短的一条向后。
叶绿素a、叶绿素c、β-胡萝卜素、叶黄素；色素体一至多个，盘状、片状，少数带状或杯状。
生殖过程中无游动细胞。无性生殖产生单孢子或四分孢子；有性生殖为卵配，雌配子（果胞）具受精丝，精子粘在受精丝上后，融化，精核延受精丝进入果胞内。生活史大多有配子体、果孢子体和孢子体。
隐藻门
多具2条鞭毛，细胞很小（3-6μm），前端具口沟。多不具纤维素细胞壁。
叶绿素a、叶绿素c、藻胆素等；色素体1-2个，大型，叶状。