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SAS002卡方检验全章+总结
思路:计数资料→独立四格表→n≥40 且有 T 在[1,5)之间→连续校正卡方或 Fisher 精确概率 程序: data A;
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input r c f @@; cards; 1 1 46 1 2 6 2 1 18 2 2 8 ; proc freq; tables r*c/chisq nopercent nocol expected; weight f; run;
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结果: H0:两种检测方法结果无差别。S=7.1429;p=0.0075;p<0.05,拒绝 H0。 (样本阳性率比较,免疫荧光检测结果阳性 率更高) ,故可以认为两种检测方法检测结果不同,免疫荧光法的阳性检测率更高。 注意:kappa 为一致性检验 0‐0.4 一致性差;0.4‐0.75 一致性一般;0.75‐1 一致性好。一致性越高则两种处理间的差 异就越小。 4.R*C 表——双向无序——样本率比较——基本卡方+两两比较 例 7‐6 某医师研究物理疗法、药物治疗和外用膏药三种疗法治疗周围性面神经麻痹的疗效,资料见表 7‐8。问三种 疗法的有效率有无差别? 表 7‐8 三种疗法有效率的比较 有效率 疗法 有效 无效 合计 (%) 物理疗法组 药物治疗组 外用膏药组 合计 199 164 118 481 7 18 26 51 206 182 144 532 96.60 90.11 81.94 90.41
结果: H0:两组新生儿 HBV 的总体感染率无差别。Fisher 精确概率双侧检验 p=0.1210;p≥0.05,不拒绝 H0。尚不能认为预 防注射与非预防注射的新生儿 HBV 的感染率不等。
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3.配对四格表——利用 bc 的卡方检验(McNemar's Test) 例 7‐3 某实验室分别用乳胶凝集法和免疫荧光法对 58 名可疑系统红斑狼疮患者血清中抗核抗体进行测定, 结果见 表 7‐3。问两种方法的检测结果有无差别? 表 7‐3 两种方法的检测结果 免疫荧光法 乳胶凝集法 + - 12( b) 11( a) c 33( d ) 2( ) 13 45 合计
思路:计数资料→R*C 表→双向无序→基本卡方+组间两两比较 程序: data A;
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input r c f; cards; 1 1 199 1 2 7 2 1 164 2 2 18 3 1 118 3 2 26 ; proc freq; tables r*c/chisq nopercent nocol expected; weight f; run; 结果:
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99(90.48) a 75(83.52) c 174 ( a c )
5(13.52) b 21(12.48) d 26 (b d )
104 ( a b ) 96 ( c d ) 200 ( n )
95.20 78.13 87.00
23 + 35 - 58 合计 思路:计数资料→配对四格表→利用 b、c 的卡方检验(McNemar's Test) 程序: data A; input r c f;/*注意b、c必须摆在第二三两行*/ cards; 1 1 11 1 2 12 2 1 2 2 2 33 ; proc freq; tables r*c/agree; weight f; run;
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H0:三种疗法治疗周围性面神经麻痹的疗效无差别。卡方值=21.0377;p<0.0001,拒绝 H0。尚不能认为三种疗法治 疗周围性面神经麻痹的疗效无差别。两两比较:物理疗法、药物治疗组——卡方值 =6.7560 , p=0.0093 , p < α`=0.05/(3+1)=0.0125。两组间有差别;物理疗法、外用膏药组——卡方值=21.3228,p<0.0001。两组间有差别;药 物治疗和外用膏药组——卡方值=4.5910,p=0.0321>0.0125 不拒绝 H0,两组间可认为无差别。总结物理疗法与其它 两组的疗效有差别,药物治疗与外用膏药组之间疗效无差别。 5.R*C 表——双向无序——构成比比较——基本卡方 例 7‐7 某医师在研究血管紧张素 I 转化酶(ACE)基因 I/D 多态与 2 型糖尿病肾病(DN)的关系时,将 249 例 2 型糖尿病 患者按有无糖尿病肾病分为两组,资料见表 7‐9,问两组 2 型糖尿病患者的 ACE 基因型总体分布有无差别? 表 7‐9 DN 组与无 DN 组 2 型糖尿病患者 ACE 基因型分布的比较 组别 DN 组 无 DN 组 合计 DD 42(37.8) 30(21.7) 72(28.9) ID 48(43.3) 72(52.2) 120(48.2) II 21(18.9) 36(26.1) 57(22.9) 合计 111 138 249
weight f; run;
结果:
H0:两组降低颅内压的总体效率无差别。卡方值=12.8571;p=0.0003;p≤0.05,拒绝 H0。试验组有效率高于对照组, 可认为试验组药物降低颅内压有效率高于对照组。 2.独立四格表——连续校正卡方与 Fisher 精确概率 例 7‐2 某医师欲比较胞磷胆碱与神经节苷酯治疗脑血管疾病的疗效,将 78 例脑血管疾病患者随机分为两组,结果 见表 7‐2。问两种药物治疗脑血管疾病的有效率是否有差别? 表 7‐2 两种药物治疗脑血管疾病有效率的比较 有效率 组别 有效 无效 合计 (%) 胞磷胆碱组 神经节苷酯 组 合计 46 18 64 6 8 (4.67) 14 52 26 78 88.46 69.23 82.05
结果: H0:两组药物治疗脑血管病的有效率无差别。连续校正卡方值=3.1448;p=0.0762;p≥0.05,不拒绝 H0。尚不能认为 两种药物治疗脑血管病的有效率不等。 例 7‐4 某医师为研究乙肝免疫球蛋白预防胎儿宫内感染 HBV 的效果,将 33 例 HBsAg 阳性孕妇随机分为预防注射 组和非预防组,结果见表 7‐4。问两组新生儿的 HBV 总体感染率有无差别? 表 7‐4 两组新生儿 HBV 感染率的比较 感染率 组别 阳性 阴性 合计 (%) 预防注射 4 18 22 18.18 组 非预防组 5 6 11 45.45
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合计
9
24
33
27.27
思路:计数资料→独立四格表→n<40 或有 T<1→Fisher 精确概率 程序: data A; input r c f @@; cards; 1 1 4 1 2 18 2 1 5 2 2 6 ; proc freq; tables r*c/chisq nopercent nocol expected; weight f; run;
目录
卡方检验 ................................................................................................................................................................................... 1 1.独立四格表——基本卡方 ............................................................................................................................................. 1 2.独立四格表——连续校正卡方与 Fisher 精确概率 ..................................................................................................... 2 3.配对四格表——利用 bc 的卡方检验(McNemar's Test) ......................................................................................... 5 4.R*C 表——双向无序——样本率比较——基本卡方+两两比较 ................................................................................. 6 5.R*C 表——双向无序——构成比比较——基本卡方 ................................................................................................... 9 6.R*C 表——双向无序——列联比——基本卡方+pearson 列联系数 C ...................................................................... 10 7.R*C 表——单向有序——R 有序——(同双向无序)基本卡方 .............................................................................. 11 8.R*C 表——单向有序——C 有序——(绝对不能用基本卡方)CMH 卡方或非参 ................................................. 11 9.R*C 表——双向有序——(绝对不能用基本卡方)CMH 卡方或 Spearman 相关系数(rs) ............................... 12 10.R*C 表——分层卡方——根据是否有序判断 ........................................................................................................... 13 总结: ..................................................................................................................................................................................... 14 思路、分析依靠个人经验,能力浅薄,难免疏漏,仅供参考 By Albert Wang