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分子克隆分接转筛(讲课复习)
➢转导:以噬菌体作载体构建的重组 体导入受体细胞的过程
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重组DNA的筛选与鉴定方法 平板筛选(插入失活、蓝白筛选)
1 2
3 PCR筛选重组体 4 原位杂交技术
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2.分子克隆中常用工具酶:
(1). 使核酸降解的核酸酶类: 核酸内切酶、核酸外切酶。
(2).催化核酸合成的酶类: DNA聚合酶,RNA聚合酶,连接酶,逆转录酶。
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3.基因克隆常用载体
目前用于基因克隆的载体种类繁多, 包括在大肠杆菌中使用的质粒、噬菌 体载体、酵母菌质粒载体以及动、植 物病毒载体等
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质粒自身含有复制起始点,与相应的顺式调控元件组成一个复制子(replicon), 能利用细菌的酶系统进行独立的复制及转录。质粒具有多种遗传选择标记, 包括各种抗药基因或营养代谢基因等。
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RT-PCR
反转录 逆转录酶 AAAnA mRNA
AAAnA
T T TnT
cDNA第一链
DNA聚合酶
cDNA
PCR扩增
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➢转化:以质粒作载体构建的重组体 导入受体细胞的过程
类 ➢转染:以病毒作载体构建的重组体 型 导入受体细胞的过程
1988年Saiki 等从温泉 ( Hot spring)中分离 的一株水生嗜热杆菌 (thermus aquaticus) 中提取到一种耐热DNA 聚合酶。
thermus aquaticus
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此酶具有以下特点: ①耐高温, ②在热变性时不会被钝化,不必在每次扩增反应后再加 新酶。 ③大大提高了扩增片段特异性和扩增效率,增加了扩增 长度(2.0Kb)。 酶命名为Taq DNA多聚酶(Taq DNA Polymerase)。此酶的发现使被PCR广泛应用。 在 1989 年,Science 将PCR中的Taq DNA多聚酶命 名为当年的风云分子 (Molecule of the year)
④底物:四种脱氧三磷酸核苷 (dNTP: dATP、dTTP、dCTP、 dGTP) ⑤ Mg2+: DNA聚合酶的激活剂
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⑸ 2535个循
环
4.PCR反应程序
⑴94~96℃ 30’’-3’ 预变性(使模板DNA充分变性)
⑵94℃
30’’
变性
⑶50-60℃ 30’’-1’ 复性(使引物与模板充分退火)
⑷72℃
n’(按1’扩增1kb计算)延伸
⑹72℃
3-7’
总的延伸(使产物延伸完整)
⑺4-10℃ 保存
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3.与反转录相关的PCR扩增
RT-PCR(reverse transcriptase-PCR,RT-PCR): 又称反转录PCR, 是以反转录的cDNA作模板所进行的PCR, 可对基因的表达和序列多态性分析。
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2.PCR反应过程:
1个PCR
20-40个 PCR循循环环
①94℃变性 ② 50-65℃退火 ③72℃延伸
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引物
5’
3’
3’
5’
变性、退火
延伸
变性、退火
延伸
PCR扩增原理 上课复习
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①模板:单链或双链DNA
②引物:16-30 bp合成的寡核苷酸 3.PCR基本要素 ③DNA聚合酶:耐热的DNA聚合酶
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氨苄青霉素抗性(ampicillin resistance,ampr)基因:
此基因编码ß内酰胺酶,该酶能 水解氨苄青霉素ß—内酰胺环,使之 失效而使细菌产生耐药。
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DNA限制性内切酶
DNA连接酶 100μl
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4.目的基因的分离与制备
⑴、人工合成基因 ⑵、应用聚合酶链反应获取目的基因
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是由细菌自己产生的一种能识别双链 DNA中的特定序列,并以内切方式水解
核酸中磷酸二酯键的核酸内切酶。在细菌 体内,这种内切酶可以分解外源性的 DNA物质,例如病毒等;而细菌本身的 DNA同一识别序列中的某些碱基被甲基 化所保护。
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TaqDNA聚合酶主要用于聚合酶链式反应 (polymerase chain reaction,PCR)中, 能以DNA为模板,从结合在模板上的引物 出发,以dNTP为原料,按碱基配对方式, 从5’-3’方向合成新的DNA链。TaqDNA 聚合酶在70~75℃时具有最佳的生物活
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5.目的基因的体外重组
DNA分子的体外重组:是DNA分 子之间的连接过程。这是一个DNA 连接酶催化的生物化学反应 。
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6.重组子导入宿主细胞
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分子克隆的路线
载体DNA (vector)
目的DNA DNA 重组 (target fragment)
重组DNA (recombinant DNA )
转化
宿主(host)
筛选、扩增
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克隆(clone)
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分—获取目的基因和载体 接—目的基因与载体的连接 转—重组DNA导入宿主细胞 筛—重组DNA的筛选与鉴定
分子克隆
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(一)基本概念:
• 克隆(Clone) 指的是通过无性繁殖过程所产生的 与亲代完全相同的子代群体。
• 分子克隆(Molecular Cloning) 是在体外对DNA分 子按照既定的目的和方案进行人工重组,将重组分 子导入到合适的受体细胞中,使其在细胞中扩增和 繁殖,以获得DNA分子大量复制,并使受体细胞获 得新得遗传特征的过程。
性,随着温度的降低,酶活性明显下降。 同时此酶缺乏3’-5’外切酶活性,因而无 校正功能。
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催化双链DNA中相邻碱基的5’磷酸 和3’羟基间磷酸二酯键形成的酶, 称为DNA连接酶(DNA ligase)。 DNA连接酶主要有两种:
T4噬菌体DNA连接酶
大肠杆菌DNA连接酶
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目的基因的获取-----PCR技术:
定义: PCR技术又称聚合酶链式反应(polymerase chain reaction),是通过模拟体内 DNA 复制的 方式,在体外选择性地将 DNA 某个特殊区域扩 增出来的技术。
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Taq DNA多聚酶的发现
Heat-stable polymerase is vital to the ease of the process…