大肠杆菌（学名：Escherichia coli，通常简写：E. coli）)是人和动物肠道中最著名的一种细菌，主要寄生于大肠内，约占肠道菌中的1%。

是一种两端钝圆、能运动、无芽孢的革兰氏阴性短杆菌。

除某些菌型能引起腹泻外，一般不致病，能合成维生素B和K，对人体有益。

其属名埃希氏菌（Escherichia）来源于其发现者Theodor Escherich。

大肠杆菌是肠杆菌科的一员，经常作为细菌的模式生物广泛用于科学研究。

每个人每天平均从粪便中排出1011到1013个大肠杆菌。

各种粪便细菌和类似的生活在土壤或植物降解物中的细菌（最常见的是产气肠杆菌，学名Enterobacter aerogenes）一起被归为“大肠菌群”(coliform)。

大肠菌群为好氧或兼性厌氧[来源请求]，不形成内孢子，能发酵乳糖产生酸及气体的一群微生物。

在水净化和污水处理领域，因大肠杆菌在粪便中数量极多，故常用为检查水源是否被粪便污染的标志，其测量标准为大肠菌群指数。

此外大肠杆菌多数情况下无害，不会从实验室“逃脱”而伤害人类。

利用大肠杆菌作为粪便污染的指示物也可能产生误导性的结论，因为其它环境如造纸厂中，大肠杆菌也可大量存在。

然而一般无害的大肠杆菌在以下三种情况下也会导致疾病：
1.当细菌离开肠道进入泌尿道可以导致感染，由于性交会导致细菌进入膀
胱，有时被称作“蜜月膀胱炎”。

尿路感染尽管对女性更为普遍，但两性都可能发生。

老年中发病男女比例大体相同。

因为细菌总是通过尿道进入泌尿系统，厕所的不卫生会升高感染机率，但其它因素也很重要（如女性怀孕，男性前列腺肥大），还有一些原因不明。

2.当细菌由于如溃疡等导致的穿孔进入腹腔，通常会导致致命性的腹膜炎感
染。

然而，大肠杆菌对一些抗生素，如链霉素非常敏感，一般情况抗生素能够有效治疗。

3.大肠杆菌的某些株具有毒性（其中一些类似导致痢疾的毒素），可以导致
食物中毒，这通常是因为使用了被污染的肉类（通常是屠宰过程或储藏贩卖过程中的污染所致，加上食物未完全煮熟无法杀死细菌）。

疾病的严重程度可以相差很多，尤其对儿童、老人和免疫缺失病人可以是致命的，但通常是温和的。

大肠杆菌的内毒素可能对热稳定或不稳定。

后者的结构和功能与霍乱毒素相当接近，全毒素包含一个A亚基和五个B亚基。

B亚基起黏附作用，使毒素进入肠道细胞，而A亚基断裂出来，使得细胞脱水引起腹泻。

大肠杆菌的生活史。