DNA的生物合成
母链DNA
复制过程中形成 的复制叉
子代DNA
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• 密度梯度实验
梯度离心结果
含重氮N15-DNA的细菌
培养于普 通培养液
第一代
继续培养于 普通培养液
第二代 ——实验结果支持半保留复制的设想。
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• 半保留复制的意义
按半保留复制方式,子代DNA与亲代DNA
的碱基序列一致,即子代保留了亲代的全部遗
传信息,体现了遗传的保守性。 遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础, 但不是绝对的。
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(二)真核生物的DNA聚合酶
DNA-pol DNA-pol DNA-pol DNA-pol DNA-pol 起始引发,有引物酶活性。 参与低保真度的复制 。 在线粒体DNA复制中起催化作用。 延长子链的主要酶,有解螺旋酶活性。 在复制过程中起校读、修复和填补缺 口的作用。
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5' 3'
dCTP
dGTP
dTTP
dATP
dCTP
dATP
dGTP
dTTP
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领头链的合成
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随从链的合成
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(三)复制的终止
• 原核生物基因是环状DNA,双向复制的复制 片段在复制的终止点(ter)处汇合。
ori
0
ori
50
82
32
ter
SV40
ter
E.coli
全称:依赖DNA的DNA聚合酶 (DNAdependent DNA polymerase) 简称:DNA-pol
活性:1. 5'→3' 的聚合酶活性
2. 核酸外切酶活性
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• 核酸外切酶活性
5´
AG C T T C A G G A T A
3´
| | | | | | | | | | |
3´
?
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前导链是连续合成,而后续链是不连续合成。 DNA的合成始于RNA引物的合成,因此前导 链只有一次RNA合成,滞后链的冈崎片断每 个都有RNA引物的合成。RNA引物随后由 DNA片段替换,相邻的DNA片段连接形成一 条完整的DNA链。 DNA聚合酶的校对功能和细胞的错误修复功 能维持DNA分子的准确性和忠实性。
(250kD)
功能 是原核生物复制延长中真正起催化作用的酶。
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α亚基具有5′→3′方向合成DNA的催化活性 ε亚基具有3′→5′外切酶活性,起校对功能, 可提高聚合酶Ⅲ复制DNA的保真性 亚基可能起组建的作用 β亚基犹如夹子,功能是识别引物、夹住DNA 分子向前滑动 亚基起着促使核心酶二聚化的作用 其余的亚基构成 -复合物,主要功能是帮助 亚基夹住DNA(也称夹子装置器),并有 增强核心酶活性的作用
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5’ 3’
ori
ori
ori
ori
3’ 5’
5’ 3’
3’
5’
5’
3’
3’
5’
复制子
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(2)起始点和方向 ①原核生物和真核生物复制都是在DNA分子特定的 位置起始的,如大肠杆菌起始点有固定的重复的保守顺
序,可被酶识别。
②方向:大多是双向、对称复制, 也有单向或不对称 的。 ③速度: 原核生物复制叉移动快(约105bp/min); 真核生物复制叉移动慢 (约5×102~5×103bp/min)
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引发体和引物
Dna B、 Dna C Dna A 5 3 DNA拓扑异构酶 SSB 5 3
含有解螺旋酶、DnaC蛋白、引物酶和DNA 复制起始区域的复合结构称为引发体。
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3
5 3
引物
5
引物是由引物酶催化合成的短链RNA分子。
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DNA复制的调控是在起始阶段进行的, 一旦复制起始,它就会继续下去直到整个复制子 完成复制。 复制起点是以一条链为模板起始DNA 合成的一段序列。有时,两条链的复制起点并不 在同一点上(不对称复制,如D环复制)。
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5’
O
3’
3’
O P OO-
HO
ATP
5’
DNA连接酶
ADP 5’ 3’ 3’
O O P OO-
5’
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•功能
• DNA 连接酶在复制中起最后接合缺口的
作用。
• 在 DNA修复、重组及剪接中也起缝合缺 口作用。 • 也是基因工程的重要工具酶之一。
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一、原核生物的DNA生物合成
(一)复制的起始
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• 解螺旋酶(helicase) ——利用ATP供能,作用于氢键,使DNA双链 解开成为两条单链 • 引物酶(primase) ——复制起始时催化生成RNA引物的酶 • 单链DNA结合蛋白(single stranded DNA binding protein, SSB) ——在复制中维持模板处于单链状态并保护单 链的完整
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复制起始点、复制子与复制叉(动 画演示)
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三、复制的半不连续性
3
5 3
领头链 (leading strand)
解链方向
随从链 (lagging strand)
5
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• 顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,
这股链称为领头链(前导链)。
• 另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能 顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称 为随从链(后随链、滞后链)。复制中的不连续 片段称为岡崎片段(okazaki fragment)。
引物(primer): 提供3’-OH末端使dNTP可以依次聚合 其他的酶和蛋白质因子
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一、复制的化学反应
(dNMP)n + dNTP → (dNMP)n+1 + PPi
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• 聚合反应的特点
除了底物和酶外,DNA 新链生成需引
物和模板;
新链的延长只可沿5’→ 3’方向进行 。
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二、DNA聚合酶
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细菌复制终止区含有多个约22bp的终止子 (terminator)位点,E. coli 有7个终止子位点。
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新合成的两条 染色体DNA分子相互 连在一起,被拓扑 异构酶IV分离
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DNA复制的分子机制的基本特点
复制的结果是半保留复制,复制的过程是 半不连续复制。 复制以复制单位进行,起始于特定的位点 (复制起点)。 复制可以是单向,也可以是双向,后者更 为常见。 复制时,DNA的两条链都从5′端向3′端延 伸。
子代DNA
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第一节
复制的基本规律
Basic Rules of DNA Replication
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一、半保留复制的实验依据和意义
•半保留复制的概念
DNA 生物合成时,母链 DNA 解开为两 股单链,各自作为模板(template)按碱基配对 规律,合成与模板互补的子链。子代细胞的 DNA,一股单链从亲代完整地接受过来,另 一股单链则完全从新合成 。两个子细胞的 DNA都和亲代DNA碱基序列一致。这种复制 方式称为半保留复制。
5´
T C G AA G T C C T A G C G A C
• 3'→5'外切酶活性 能辨认错配的碱基对,并将其水解。 • 5'→3' 外切酶活性 能切除突变的 DNA片段。
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功能:
① 5′→3′聚合酶活性; 酶与模板结合后构象改变,识别碱基,正 确配对后才发挥聚合作用 ② 3′→ 5′外切酶活性; 主要是对新生DNA链进行校对,防止“错 配” ③ 5′→3′外切酶活性。 主要是对DNA损伤的修复,以及在DNA复 制时RNA引物的切除及其空隙的填补
在一个完整的细胞周期中,每一个复 制起点只使用一次,完成一次复制过程。 多数生物的复制起点,都是富含A.T。
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(二)复制的延长
复制的延长指在 DNA-pol 催化下, dNTP 以 dNMP的方式逐个加入引物或延长中的子链上, 其化学本质是磷酸二酯键的不断生成。
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3' 5'
DNA-pol
OH 3'
可见,DNA polⅠ是1个多功能酶
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N端
DNA-pol Ⅰ 木瓜蛋白酶
C端
小片段
323个氨基酸 5'→3'核酸外切酶活性
大片段/Klenow 片段
604个氨基酸 DNA聚合酶活性 3'→5'核酸外切酶活性 • Klenow片段是实验室合成DNA,进行 分子生物学研究中常用的工具酶。
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DNA-pol Ⅲ
需要解决两个问题: 1. DNA解开成单链,提供模板。
2. 合成引物,提供3-OH末端。
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原核生物E.coli为例
复制由起始点 oriC(origin)开始双向复制
E.coli的复制起始点oriC(245bp的DNA组分) 序列分析有如下特点 3组串连重复序列(13bp),每个顺序都由GATC开始 2组反向重复序列(9bp) 4个dnaA蛋白结合部位
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二、双向复制
原核生物复制时,DNA从起始点(origin)向 两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复制 叉,称为双向复制。
复制中的放射自显影图象
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Cairns复制模型—θ型复制
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ori
ter
A
B
C
A. 环状双链DNA及复制起始点 B. 复制中的两个复制叉
C. 复制接近终止点(termination, ter)