PubMed使用方法
PubMed使用方法
内容纲要
一、PubMed及NCBI相关数据库简介 二、PubMed数据范围
三、PubMed主页的结构 四、PubMed检索方法以及检索结果的处理 五、PubMed Central
PubMed及相关数据库介绍
NCBI(National Center for Biotechnology
修改检索策略
检索明细 数据库匹配过程 检索词转换 显示用户输入的检索式
数据库匹配过程
词转换
你输入的检索式
修改检索策略
检索框中随时修改 “Limit” 、 “Preview/index”、 “History”、
“Details”功能实现。
四.其他检索
Mesh Database 功能:
引文匹配器(Citation Matcher)
输入题录信息,查找特定文献进行补缺。 刊名要准确,缩写要标准
著者姓名大小写不敏感
如 查 找 : Taiwan
I Hsueh Hui Chih 由 Chang PY(taiwan yi xue hui za zhi ) 撰写、 1975 发表文献的其他著者
编制检索式
字段限制 查找闻玉梅教授的文献
Wen ym[au]
查找 Jhon Adorn Williams 撰写的文章
Williams JA[AU]
查找英语综述文献 english[la] AND review[pt]
PubMed记录字段说明
文摘 第一著者单位地址 出版商提供文献识别号 著者群 版权说明 参考评论文献 合著者 文献参考评论 定稿版 校样版 输入日期
确定规范检索词 查看词义注释、树状结构表 副主题词、扩展、主要主题词
例:欲查肾衰竭的饮食疗法相关文献?
基本检索肾衰竭的 饮食疗法
结果中有些主要内容 并非肾衰竭
MeSH Database 规范主题词数据库检索 肾衰竭饮食疗法课题
1.输入检索词
2.执行浏览
3.点按规范词可获详细注 解
Information,美国国立生物技术信息中心) NCBI是目前国际上几个重要分子生物信息网站 之一,在1988年11月4日成立。NCBI是 National Institutes of Health(NIH)底下的 National Library of Medicine(NLM)的部门之 一。由于NLM具有建立与维护生物医学数据库 经验,且因它是NIH的单位,因此可执行计算分 子生物计划。NIH目前是全世界最大的生物医学 研究单位。
如:clin exp immunol
布尔逻辑运算式: (运算符须大写)
如 :Stem [ti] AND neuroscience
多个检索词输入 Moore AM撰写的有关接 触性皮炎的文章
刊名的输入 (字段限定来源出SO)
著者检索 moore am[au]
检索提问输入
仅检索有文摘 的文献
清除限定 作者限定 添加作者姓名输入框 作者姓名索引选词
期刊限定
多作者逻辑 匹配选项 全文、免费全文、摘要限 定 日期限定
出版日期限定 研究对象 人/动物限定 入库日期限定 研究对象性别限定
语种限定
子文档限定
文献类型限定
研究对象年龄限定
检索字段限定 执行检索
清除所有限定
Previw/index(检索策略预览)
PubMed not Medline
PubMed 收录Medline不收录的文献。 记录中用[PubMed]标记表示。
PubMed与MEDLINE的区别
收录范围广:
MEDLINE收录的部分生命科学相关文章的非医 学专业期刊(物理、天文、化学等) 在MEDLINE数据标引前的最新题录
编制检索式
主题词型 哮喘的药物治疗(asthma, drug therapy) asthma/drug therapy 手损伤的治疗(hand injuries, surgery, therapy) hand injuries/surgery OR hand injuries/therapy 阿司匹林治疗心肌梗死(aspirin, therapeutic use, myocardial infarction, drug therapy) aspirin/therapeutic use AND myocardial infarction/drug therapy
输入完成日期
电子出版日期
电子出版日期
文献出版日期
数据加入PubMed日期 文献勘误 参考文献勘误 全部著者姓名 全部调研者姓名 作为文章主题的著者全称
文献相关注释
基金编号 基因符号 期编号
资助调研者
资助调研单位 国际标准期刊号 美国立医学图书馆识别号 期刊全称
最后修订日期
规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘 版权拥有者 题录提供机构的识别号 病史相关与原始记录
树状结构
树状结构
选择组配方式 Search Box with AND Search Box with OR Search Box with NOT
第四步: search box 点击 search PubMed
检索结果
Tacrolimus / adverse effects[MeSH]
search box
[注] 截止2006年3月15日PubMed公布的数据
In process citation
提供MEDLINE尚未经规范处理的数据。 获MeSH词后,再加入MEDLINE。 记录中用[in process]标记表示。
Publisher Supplied Citations
PubMed 基本检索规则
截词检索:treat* 强迫短语检索:“brca 1”(不再自动转换匹配
和扩展检索)
PubMed 基本检索规则
自动转换检索词
(automatic term mapping)
自动对照规范词表,期刊名表,短语,著者名索 引, 依次寻找转 短语寻找转换 单词转换 单词在上述四个字段寻找转换在所有字段中转换
主题词注释
可选副主题词
限定作为 主要主题 词匹配
不进行下位词扩检
该主题词所替代的 非规范词形式
主题词树形结构 表:显示该词的 学科隶属关系
检出结果更为专指 通过MeSH Database 检索的结果,其中41 篇综述文献
例:从主题途径查找FK506副作用和肾移植的
文献(限定条件:
1年,人类,英语)
History(检索史)
检索式回顾 编辑检索式 如#3 AND child
检索历史回顾
检索式
检索时间
检出篇数
检索式编号可替代检索式进行输入检索 如:#5 AND #6
Details (匹配过程)
显示检索词转换匹配运算详细过程 用途:转换、确定规范词 如:liver cancer -> liver neoplasms
编制检索式
混合型 检索舌根肿瘤的病理学(tongue neoplasms, pathology, tongue base, base of the tongue) tongue neoplasms/pathology AND (“tongue base” OR “base of the tongue”)
如:输入stem[ti] AND neuroscience Details显示:
stem[ti] AND (("neurosciences"[TIAB] NOT Medline[SB]) OR "neurosciences"[MeSH Terms] OR neuroscience[Text Word])
提示相关词
主题词轮排表
第三步:
主题词细节屏(主题词词义注释、副主题词、
加权或不扩展、入口词、曾用词、树状结构) 选择合适的副主题词 选择加权或不扩展 send to
主题词细节屏
主题词细节屏
p175
主题词词义注释 主题词词义注释 副主题词选择
加权检索 不扩展检索
入口词
曾用词 曾用词 药理作用 药理作用
浏览检索式 改变检索式 (可用检索式编号#1 OR #2)
浏览索引(index)
检索预览
检索历史
索引加词检索
Index(索引字顺表)
选择限制字段 输入检索词(词根) 在字顺表中选择检索词
选用逻辑算符建立检索式
点击GO
步骤1 点击预览和索引
步骤2 输入待选词
步骤4 确定与检索栏中 检索提问的逻辑关系 步骤3 索引选词
其他关键词
提供其他关键词的机构 数据提供者机构
文章总页数
出版商提供数据时间 期刊出版国 数据库文献编号
作为主题词的个人姓名
出版状态 文献类型 出版模式(纸张或电子) 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码
正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据 二次文献数据库以及文章讨论的 分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码
出版商直接向PubMed提供电子记录 包括MEDLINE未收录的部分记录 记录中用[PubMed-as supplied by publisher]标 记表示。
OldMedline
1950-1965年间发表的200多万篇文献 没有MeSH字段和摘要 记录中用[PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966] 标记表示。
自动扩展检索
系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索, 如:输入“hypertension therapy,系统自动将高 血压的药物治疗、饮食疗法,