近年来,利用计算机进行文献检索已逐步代替传统的手工检索,随着Internet的普及,我们可以随时随地通过国际互联网来检索获得免费的医学文献,这是一条文献检索新捷径[1],特别是进行MEDLINE检索,既简单又实用[2]。
现在有多个机构提供免费的网上MEDLINE检索服务,其中由美国国立医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)建立的PubMed数据更新快[3],检索系统完善,深受广大医务工作者和图书情报人员的欢迎。
由于PubMed检索系统在不断完善和加强,要快速、全面、准确地在近4千种医学期刊、1千1百万条数据中检索出符合自己要求的资料[4],并不容易。
下面介绍最新版本(2000年9月版)的PubMed使用方法。
1. 进入PubMed在浏览器的地址栏内输入Pubmed的网址:/PubMed/后按回车键,就进入PubMed的主页,开始检索。
2. 普通检索在检索式提问框中输入一个或更多的词(例如:vitamin c common cold),然后按回车键或用鼠标点击"Go"按钮,PubMed就会利用"自动词语匹配"功能将重要的词或词组用"AND"组合在一起进行检索(见图1)。
输入的词可以是自由词、主题词、或其他指定字段。
由于主题词检索的文献更全面、更准确,应尽量使用主题词/副主题词检索。
对于某些新的技术词汇、新药、新方法、新疾病等,还没有相应的主题词时,应该用自由词检索。
3. 高级检索使用逻辑词AND, OR, NOT(例如:vitamin c OR zinc)、指定文献记录字段名称检索、使用医学主题词(MeSH)/副主题词组配格式检索,如neoplasms/diet therapy[mh]。
不久返回检索结果,检索提问框仍出现在页面顶端,并显示您刚才输入的检索词。
您可以在提问框内、点击"Details"或"Limits"按钮再修改检索词。
3.1 PubMed检索规则和语法①布尔运算符AND,OR,NOT必须大写,例如,vitamin c OR zinc;②PubMed从左至右进行布尔运算。
不过,你可以通过加圆括符改变运算顺序,如common cold AND (vitamin c OR zinc)。
括弧内的字段是作为一个整体来处理的。
③如果输入的字段含有主题词组,PubMed优先按词组检索。
如果不希望这样,应该加布尔运算符。
例如输入:air bladder fistula,PubMed会将"air bladder"作为词组。
此时应输入:air AND bladder AND fistula。
④字段标记符(tag)使用规则:只能在词后加字段标记符,如:romatherapy [mh],必须用封闭的方括弧[ ],大小写和空格会被忽略,如crabs [mh] = Crabs[MH]。
⑤日期格式:采用YYYY/MM/DD[DP]格式,如1998/03/06[dp],1999/10 [EDAT]。
月和日可以不写。
输入日期范围则用冒号连接,如1996:1998[dp],1998/01:1998/04[dp]。
日期字段标记符有3个:Date of Publication [DP] :出版日期Entrez Date [EDAT] :进入PubMed的日期。
MeSH Date [MHDA]:该引文被MeSH 主题词编入索引的日期。
⑥期刊标记符有3个:jsubseta - Abridged Index Medicus 只检索《医学索引》的期刊jsubsetd - Dental 只检索《牙科文献索引》的期刊jsubsetn - Nursing 只检索《护理学索引》的期刊例如: neoplasms AND jsubseta⑦检索须有摘要的文献,使用"hasabstract"。
如: neoplasms AND hasabstract⑧检索印刷前的引文,使用"pubstatusaheadofprint"。
例如: pubstatusaheadofprint AND gene3.2. PubMed的检索语法检索语法格式是:检索词[tag] 布尔运算符检索词[tag]例如:要检索作者Dr. Crick在1993年撰写的关于DNA的文献,格式是:dna [mh] AND crick [au] AND 1993 [dp]要检索关于热或潮湿与多发性硬化的关系,格式是:(heat OR humidity) AND multiple sclerosis检索学龄前儿童哮喘治疗的英文综述文献,格式是:asthma/therapy [mh] AND review [pt] AND child, preschool [mh] AND english [la]3.3 作者姓名检索输入作者姓名时应采用姓+名(名的首字母缩写,不用标点符号)的格式,例如SmithJA。
PubMed将自动地截取作者姓名中名的首字母以适应不同的名缩写。
如果只输入作者的姓,PubMed会在包括作者字段在内的所有字段进行检索,但如果作者的姓是一个MeSH词的时候除外,例如输入Yang,则PubMed将只检索:Yin-Yang[MeSH]或Yang[Text Word]。
此外,如果使用双引号""将作者的姓全称和名的第一个首字母引起来,并用作者检索字段标识符[au]限制,如"smith j"[au],PubMed将关闭自动截词,且检索姓名中名只有一个字母缩写的作者。
3.4 期刊名检索包括期刊名全称(如molecular biology of the cell)、期刊名MEDLINE缩写(如mol biol cell)、国际标准连续出版物号(ISSN,如1059-1524)。
例如,如果输入"New England Journal of Medicine",PubMed将按"N Engl J Med[ta]"查询。
应注意:①如果杂志名也是一个MeSH词,例如Gene Therapy, Science, 或Cell,PubMed只会按MeSH词来检索,要想检索杂志名,必须加字段标记[ta],如gene therapy [ta]。
②对一个单词的杂志名,也必须加字段标记[ta]。
③尽量使用期刊名全称和期刊名MEDLINE缩写检索,在早期的文献中,ISSN号是不能保证检索完全的。
④如果杂志名带有参数或引号,应该去掉这些参数或引号,如:J Hand Surg [Am]应该以J Hand Surg Am 键入。
3.5 截词检索可以在词尾加*号,来检索有一样词头的所有词,如输入bacter*,则会检索bacter, bacteria, bacterium, bacteriophage 等词,但不会检索带有空格的词组,如bacteria control。
PubMed只能检索前150个相符合的词。
此外,截词检索将关闭自动词语匹配功能,也不能进行扩展检索。
如:heart attack*不会匹配MeSH词,也不会扩展检索myocardial infarction、myocardial stunning、shock、cardiogenic这些方面的文献。
3.6 强制词组检索(规定Pubmed检索一个词组)一般情况下,如果PubMed检索在常用词组列表中已有的词组,如poi-son ivy,PubMed就会把它作为一个词组来检索。
但有时Pubmed可能找不到相应的词组,如果输入的词组,在PubMed的词组表中没有时,PubMed 会拆分词组,如您输入:single cell,PubMed会分成"single" 和"cell" 分别检索,如要强制检索single cell,必须加双引号,使得PubMed将其当作一个词来进行检索,即写成"single cell"。
需注意的是,使用双引号规定PubMed进行词组检索,PubMed 就不会执行自动词语匹配功能和扩展检索功能。
3.7 检索细节点击Details按钮,可以查看和编辑检索情况,即可以增加或删除检索词,如图2。
还可以从检索细节窗口保存检索项目:点击URL按钮后,用浏览器的书签(或收藏夹)菜单将目前的检索项目作为URL地址以书签形式保存,以便下次再检索。
4. 限定检索(Limits)如图3,可以对多个选项限定检索,以缩小检索范围,提高检索准确率。
完成后将出现如图4的核对框,显示限定的字段。
限定字段检索的项目有:4.1 字段选择可选择:所有字段(All Fields)、作者地址、作者姓名、期刊名、ISSN号码、语种、MeSH词、副主题词、页码、出版日期、自由词、标题词、期刊卷号、数据库更新代码、物资名称等22个选项,默认选项为All Fields。
4.2必须有摘要的文献(Only Items with Abstracts )为复选框,选中后检索出的文献均有摘要。
注意1975年前的文献是没有摘要的。
4.3 出版形式(Publication Types)包括:Clinical Trial 临床试验Editorial 编辑按语Letter 读者来信Meta-Analysis 荟萃分析Practice Guideline 实践指南Randomized Controlled Trial 随即对照试验Review 综述4.4 出版语种(Languages )PubMed 引用了近40种语言的期刊。
但下拉式菜单中只有最常检索的几种语言供选择:英语、法语、德语、意大利语、日语、俄语和西班牙语。
如您没有限制语言,PubMed会检索所有语种出版的文献。
语种的字段标记符一般取英文的前3个字母表示,如汉语为[chi],德语为[ger],但日语例外,为[jpn]。
4.5 年龄(Ages )可在下拉式菜单中选择其中一项。
All Infant: birth-23 month 出生到23月龄的婴儿All Child: 0-18 years 0~18岁的儿童All Adult:19+ years 所有成年人(19岁以上)Newborn: birth-1month 新生儿(出生到1个月)Infant: 1-23 months 婴儿Preschool Child: 2-5 years 2~5岁的学龄前儿童Child: 6-12 years 6~12岁儿童Adolescent: 13-18 years 青春期13~18岁Adult:19-44 years 19~44岁成年人Middle Aged:45-64 years 45~64岁Aged:65+ years 65岁以上80 and over: 80+ years 80岁以上4.6 性别(Gender)4.7 人或动物(Human or Animal)4.8 子项(Subsets )包括:目前有9个数据库或过滤检索系统可选:AIDS、AIM、Dental、MEDLINE、Nursing、PreMEDLINE 、Publisher、PubRef、Toxicology。