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13药物化学原理-定量构效关系


Hansch分析方法
Hansch和藤田认识到了两个因素影响药物活性 I. 亲脂性(药代动力学) II.电性(药物与靶标作用的药效学) 发现药物活性与亲脂性之间有抛物线函数关系, 采用线性多重回归分析,推论和扩展出以下方程 ,即Hansch方程:lg1/C=-kπ2+kπ'+ρσ+k'' lg1/C=-k[lgP]2+k[lgP]'+ρσ+k'' C:生物活性测试的药剂浓度(比如IC50,LD50) ,k、k'、k''、ρ是用统计方法曲线拟合得到的回 novo方法
Free和Wilson报道的一种数学方法,用以评价取代基加和 效应,并定量估计它们的大小,是一种在给定的结构框架 内取代基的优化方法。 假设条件:在分子的任何位置引入某特定的取代基,无论 分子中是否存在其它基团,对活性影响是不变的。
BA aiXi
Hansch的贡献
Hansch的贡献
定量构效关系发展历程
用于研究物化性质与生物活性关系相关性的方法
在已经定义和测定了取代基的各种物化参数(描 述符),如何利用这些参数进行先导物的优化呢 ? I. 合成一些(通常较多化合物)与先导物相关的化 合物, II.测试活性,得到活性数据 III.然后用不同的数学方法处理这些数据,形成两者 之间的关系(数学方程)。
Hansch分析方法
Hansch分析方法 后来认识到对活性作用的其它物化参数,比如立 体参数、形状参数等等,在Hansch 方程中加入了 Es,及其它一些描述形状、大小或拓扑学的参数,将 这些参数用线性多重回归分析,确定因变量(活 性剂量)对线性组合的自变量(描述符)的最小 二乘拟合,得出以下方程: lg1/C= -aπ2+bπ'+ρσ+cEs+dS+e Hansch 分析是用线性自由能方法进行同源物的药 物设计,方程中包含有各种物化参数的不同组合 ,统计学方法确保选出最佳组合,并进行统计学 的显著性差异检查得出关系方程。以此方程进行 未知物活性的预测。是一种超热力学方法。
Free和Wilson方法或de novo方法
BA aiXi
BA是生物活性值,Xi为第i个取代基,当该取代 基存在时,赋值为1,不存在,赋值为0。ai是第i 个取代基对生物活性的贡献,u为母体骨架的平均 活性。这些线性方程用最小二乘求解ai和u。 武田和Ban 等对其进行了修正,其一:生物活性 用A/A0表示,A和A0分别代表取代和没有取代的 化合物的活性强度,ai是第i个取代基对H活性贡 献的lg值。用这种方法推导的取代基常数可与其 他加和性自由能参数进行比较。其二:u成为该系 列的母体化合物的理论预测值。
Free-Willson方程
Free-Willson方法示例
Free-Willson方法示例
Free-Willson方法示例
回归分析和检验
Free-Willson方法示例
Free-Willson方法示例-图形分析
置信区间
Free-Willson方法示例-图形分析
其它早期的定量分析方法 增量因子:早期QSAR研究中,对合成的大量皮 质激素进行回顾性分析,发现引入的卤素、羟基 、烷基等等基团定量地影响活性,每个取代基的 影响赋值,称为增量因子,作为预测用。 TOPLISS法 Craig作图法 聚类分析法 这些早期的分析方法已经被整合进3-D QSAR或 被其所代替。
Hansch分析方法 Hansch方法使用了一些假定条件:忽略受体的构 象变化,没有代谢物和其它物质的干扰,与受体 靶标作用的有关物化参数(线性自由能参数)具 有加和性,活性-参数关系呈理想的抛物线或线性 关系,相关性之间存在因果关系。 优点: 1. 应用描述符可将有机化学模型搜集来的数据用于 预测复杂体系中的生物活性; 2. 活性预测是定量的,并具有统计学的可信度; 3. 方法简单易行,费用低 4. 经分析得到的结论具有一定延展性,可扩展到未 包含的取代基上。
Hansch分析方法
不足: 1. 所归类的化合物必须具有量化的取代基参数 2. 保障生成的方程可信,所归类化合物要足够量多 3. 使用统计学和计算机技术 4. 小分子作用模型必须确切,如有缺陷,所得方程的偏差大 5. 有机化学反应中体现的物化参数的确切性不代表生物体系 里作用的一致性,难以肯定哪些原子或基团参与了药物和 靶标的作用 6. 有机化学里确定的参数是在酸性或碱性条件下测定的,全 质子化的,生物体系里,药物分子是部分质子化的。 7. 外推过程中,由于以上原因的存在,常常给出错误预测, 与其它经验性关系相同。 8. 是一种优化先导物的方法,不能用于发现先导物。
药物化学原理
分子结构的多样性 分子结构的相似性 先导物发现:药物筛选 先导物优化:构效关系研究 分子结构的互补性 分子结构的宏观和微观特性
构效关系--定量构效关系QSAR
定量构效关系
1868年Crum-Brown曾预言,可用数学方法来表 达结构和活性的关系,现在从Hansch研究特定取 代基的变化对活性的定量影响,开拓了定量构效 关系的研究领域。 1893年Richet首先报道了物化参数与药理效应具 有相关性,他观察到一组化合物的麻醉作用与其 水溶解度呈反比关系。 Overton和Meyer观察到非离解性化合物的麻醉作 用于化合物在油水中的分配呈相关性。 Ferguson认为简单的热力学原理适用于药物的活 性,是药物在外相或细胞外液中的相对饱和度决 定麻醉作用的参数。
定量构效关系 Hansch1951年观察到苯氧乙酸类衍生物对植物生 长活性与其邻位的电子密度呈相关性,电子密度 低,生物活性高。开始他们试图用Hammett的σ 常数定量这种相关性,但没成功。 Hansch 改变观念,认为药物的作用分成两个过程 :第一步,从给药处到达机体的作用部位(药代 动力学),第二步,是药物与特定位点的相互作 用(药效学,受体假说)。 Hansch 提出了以正辛醇-水系统的膜亲脂性假说 和度量尺度,成为Hammett的σ常数外的一个可 测量物化参数,接着又提出了立体参数。
3D-QSAR 基于计算机的药物与受体结合的QSAR分析法 用以研究一些多样性的分子结构与特定靶标的生 理功能之间的相互关系。 方法:选择一组具有特定活性的分子,按照某些 预定的取向规则将这些分子叠合,在包括这组分 子的受体空间中,计算每个分子在空间上所依据 的参数,推导出每个分子的空间参数与各自的生 物活性的相关性,建立自洽性和有预测性的函数 。已经开发了很多种计算机方法。
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