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遗传学课件第12章 基因组研究
The entire genetic information contained within an organism that can be found within a nucleus of a typical cell in the organism.
基因组:真核生物单倍体细胞核,细胞器或 原核生物细胞(或病毒粒子)所含的全部 DNA或RNA分子。
(chromosOME), In the 1990s genome went from
being a highly specialized term not even in much
usage in genetics to a word that is now in
common general currency. As with all
爬行类
两栖类
骨鱼类
软骨鱼类
棘皮类
甲壳类
昆虫类
软体动物
蠕虫类
霉
酶菌
藻类
真菌
革兰氏阳性菌
革兰氏阴性菌
支
枝原体
106
107
108
109
1010
1011
图 10-37 不同门类生物的 C 值分布(仿 B.Lewin:《GENES》Ⅵ,1997,Fig 21.1)
[概念] C值悖论(C-value paradox):高等 生物具有比低等生物更复杂的生命活动, 所以,理论上应该是它们的C值也应该更 高。但是,事实上C值并不体现出与物种进 化程度相关的趋势。高等生物的C值不一 定就意味着它的C值高于比它低等的生物, 这称为~。
◆基因组学是遗传学研究进入分子水平后发 展起来的一个分支,主要研究生物体全基 因组的分子特征。
1986年H. Roderick提出从整个基因组的层次研 究遗传的科学称为“基因组学”,主要研究生 物体基因组的结构与功能。
◆基因组学强调的是以基因组为单位,而 不是以单个基因为单位作为研究对象,因 此,基因组学的研究目标是认识基因组的 结构、功能及进化,弄清基因组包含的遗 传物质的全部信息及相互关系,为最终充 分合理地利用各种有效资源,为预防和治 疗人类遗传疾病提供科学依据。
(注意: 原核、真核生物的差别)
细胞质基因组(plasmon):细胞质中遗传物质的统称。 核基因组(nuclear genome):单倍体细胞核中所含的全部 遗传物质。 细胞器基因组(organelle genome):真核细胞器中所包含 的全部DNA分子。Mitochondrial genome, chloroplast genome. 人类基因组:22条常染色体和X,Y染色体的DNA组成。 The human genome contains approximately three billion chemical base pairs. 表观基因组(epigenome):全基因组的甲基化图谱。
genomics
结构基因组学 Structural ~ 功能基因组学 Functional ~ 比较基因组学 Comparative ~ 表观基因组学 Epigenomics 化学基因组学 Chemical ~ 药物基因组学 Pharmacogenomics 环境基因组学 Environmental ~ 进化基因组学 Evolution ~ 计算基因组学 Computational ~ 蛋白质组学 Proteomics 转录物组学 Transcriptomics 表型组学 Phenomics 生物信息学 Bioinformatics
哺乳类 3×109,而肺鱼的C值为1011
进化地位高、结构复杂生物的 同类生物最小基因组比较,符 合: 进化程度越高,生物基因组 越大的规律。
DNA动力学分析表明:
同一类生物中C值的差异主要反映 在 重 复 顺 序 DNA 、 内 含 子 及 基 因间的DNA片段的含量差异。
What’s Genomics?
The ordering of genes in a haploid set of chromosomes of a particular organism;
The total set of genes carried by an individual or cell;
The full DNA sequence of an organism;
不同生物的基因组(C值):
概念:生支物原体体单倍体0.5D8 NX A10总6 量称为 C
值。
细菌 酵母
2.8 X 106 3.0 X 107
霉菌
5.5 X 107
蠕虫
1.1 X 108
昆虫
0.5 X 109
鸟类
0.2 X 1010
两栖类
0.1 X 1010
人类
0.3 X 1010
显花植物
鸟类
哺乳类
revolutions, the Genetics Revolution has ushes.
proteome, proteomics; transcripome, transcripomics; phenome, phenomics
Genome (基因组)的定义
结构基因组学:研究基因组的结构并 构建高分辨率的遗传图、物理图、序 列图和转录图的学科。
功能基因组学是基因组时代的核心和焦点。 其所要解决的问题包括如何识别基因组组成 元素及注释重要元素的功能。
The entire complement of genetic material in a chromosome set;
The entire genetic complement of a prokaryote, virus, mitochondrion or chloroplast or the haploid nuclear genetic complement of a eukaryotic species;
遗传学课件第12章 基因组研究
第十二章 基因组研究
本章主要内容:
基因组和基因组学的概念 基因组的序列组织 基因组计划 染色体外基因组
一、基因组和基因组学的概念
The word genome (基因组) dates to 1920. It was
cobbled from the German gen (GENe) + -ome