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分子生物学--第15章 DNA损伤与修复


2017年3月科学杂志论文:癌症发生的原因中运气不 好占66.1%。
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DNA复制错误: 1. 碱基错配 互变异构移位(tautomeric shift): 碱基发生了酮式-烯 醇式或氨基-亚氨基异构体互变,造成碱基配对发生改 变,使复制后的子链上出现错误。

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2.复制打滑
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DNA损伤的后果
DNA 修复机制 短期效应 生理功能紊乱 细胞死亡
基因组不稳定 信号传导异常
异常增生和代谢
基因表达异常
长期效应
衰老 肿瘤 疾病
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第二节 DNA损伤的修复
The repair of DNA damage
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托 马 斯 ·林 达 尔 ( TomasRobertLindahl ) 1938 年 1 月 28 日出生,瑞 典医学家,专门从事癌症 研究,挪威科学和文学研 究院的成员。发现碱基切 除修复。
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(一)突变是进化的分子基础 (二)只有基因型改变的突变 (三)突变是某些疾病的发病基础 (四)突变导致死亡
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二、DNA损伤修复障碍与肿瘤等 多种疾病相关
DNA损伤与肿瘤、衰老以及免疫性疾病 等多种疾病的发生有着密切的关联
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思考题:


试说明DNA损伤的几种类型及修 复合成主要方式的名称。 试述核苷酸切除修复的过程。

根据DNA结构的改变分为:
碱基脱落 碱基结构破坏 嘧啶二聚体形成
DNA单链或双链断裂
DNA交联
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碱基脱落
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碱基结构破坏导致碱基之间发生错配
EMS(甲基磺酸乙酯)
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嘧啶二聚体
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DNA链发生断裂:
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DNA损伤的类型(从损伤后果上)
碱基置换 转换 颠换
缺失
插入 链的断裂
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嘧啶二聚体的直接修复
UV
Potolyase (光修复酶)
300-600nm
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烷基化碱基的直接修复
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二、切除修复是最普遍的DNA损伤修复方式
碱基切除修复
核苷酸切除修复 碱基错配修复
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碱基切除修复(base excision repair)
识 别 受 损 的 碱 基
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① 复制与重组中出现的碱基配对错误; ② 因碱基损伤所致的碱基配对错误; ③ 碱基插入;
④ 碱基缺失。
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大肠杆菌错配修复系统组成:
甲基化酶(如DNA腺嘌呤甲基化酶,即m6A甲基化酶) DNA polymerase Ⅲ 填补单链 DNA 缺口
Helicase、SSB、核酸外切酶 (Ⅰ和Ⅶ)、连接酶 MCE (mismatch correct enzyme) 3 subunits Mut H, L, S
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着色性干皮病患儿脸部特征
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着色性干皮 病的并发症
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着色性干皮病的治疗
• 避免紫外线照射 • 避免肿瘤致病因子 • 对症治疗
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碱基错配修复( mismatch repair) 错配是指非Watson-Crick碱基配对。
碱基错配修复也可被看作是碱基切除修复的一
种特殊形式,主要负责纠正:
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常见的DNA损伤修复途径
修复途径 光复活修复 碱基切除修复 核苷酸切除修 复 错配修复 重组修复 损伤跨越修复 修复对象 嘧啶二聚体 受损的碱基 光复活酶 DNA糖基化酶、无嘌呤嘧啶核酸内切酶 参与修复的酶或蛋白
大肠杆菌中UvrA、UvrB、UvrC和UvrD, 嘧啶二聚体、DNA螺 人XP系列蛋白XPA、XPB、 旋结构的改变 XPC……XPG等 复制或重组中的碱基 配对错误 双链断裂 大范围的损伤或复制 中来不及修复的损伤 大肠杆菌中的MutH、MutL、MutS,人 的MLH1、MSH2、MSH3、MSH6等 RecA蛋白、Ku蛋白、DNA-PKcs、 பைடு நூலகம்RCC4 RecA蛋白、LexA蛋白、其他类型DNA聚 合酶
• 5-BrdU (酮式-A; 烯醇式-G)(T碱基类似物)
• 亚硝酸盐氧化脱氨 (C→U)(碱基修饰)
• SAM使G甲基化(G与T配对)(烷化剂)
• 吖啶类化合物: 吖啶橙 (嵌入染料) • 黄曲霉素B (攻击碱基,书235页)
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嵌入染料
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物理和化学因素对DNA的损伤
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二、DNA损伤有多种类型
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羟自由基作用: 破坏碱基结构 核糖分解 DNA链断裂 DNA链、蛋白质的交联
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(二)体外因素
物理因素 化学因素 生物因素
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物理因素:电离辐射(核辐射、各种射线)、非电 离辐射(紫外线、各种电器发出的辐射)
岡崎
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化学因素:


自由基 碱基类似物 碱基修饰剂、烷化剂 嵌入性染料
保罗 · 莫德里奇( Paul Modrich ),1946年出 生,美国科学家,在 杜克大学担任生物化 学教授,以及在霍华 德休斯医学研究所担 任研究员。 发现DNA 错配修复。
2015诺贝尔化学奖
获奖理由是“DNA修复的细胞机制研究”
阿齐兹 · 桑贾尔( Aziz Sancar ) , 1946 年 生 于土耳其萨武尔,美 国和土耳其国籍生物 学家,专门从事 DNA 修复、细胞周期检查 点、生物钟方面的研 究。直接观察到了光 解酶修复胸腺嘧啶二 聚体的过程。

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含有氨基的碱基还
可能自发脱氨基反
应,转变为另一种
碱基,即碱基的转
变,如C转变为U,
A转变为I(次黄嘌 呤)等。
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机体代谢过程中产生的活性氧
活性氧(ROS):反应活性很高的含氧自由基和H2O2。 自由基:外层轨道带有未配对电子的原子、原子团或分 子。(·O2- 和·OH等) 含氧自由基可造成碱基的氧化,如8-氧鸟嘌呤(7, 8oxoG, GO)可与C或A配对,造成G-C → T-A的颠换。

多见于青春期后,男多于 女。主要症状为肌无力、 肌萎缩和肌强直。 面容瘦长,颧骨隆起,呈斧状脸,颈消 瘦而稍前屈。骨骼肌收缩后松弛显著延 迟,导致明显的肌肉僵硬
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DNA自身的不稳定性 :
DNA结构自身的不稳定性是DNA自发性损伤中最频繁和 最重要的因素。 当DNA受热或所处环境的pH值发生改变时, DNA分子上 连接碱基和核糖之间的糖苷键可自发发生水解,导致碱基 的丢失或脱落,其中以脱嘌呤最为普遍。
第十五章
DNA损伤与修复
DNA Damage and Repair
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目的与要求
学时:2
1.掌握:DNA 损伤的类型
2.掌握:DNA损伤修复的方式
3.了解:DNA损伤、修复的意义 4.了解:DNA损伤的因素
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各种体内外因素所导致的DNA组成与结构的
变化称为DNA损伤(DNA damage)
核苷酸切除修复(nucleotide excision repair, NER)
识别损伤对DNA双螺旋结构所造成的扭曲。 4步反应组成: 由特殊的蛋白质探测损伤,并引发一系列 蛋白质与损伤部位的有序结合。 由特殊的内切酶在损伤部位的两侧切开 DNA链,去除2个切口之间的带有损伤的 DNA片段,形成缺口。 由DNA pol填补缺口。 由DNA连接酶连接切口 。
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E.coli的NER主要由4种 蛋白质组成: UvrA UvrB UvrC UvrD
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核苷酸切除修复 (全基因组修复–真核生物)
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核苷酸切除修复 (转录偶联修复 -人类)
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着色性干皮病 (Xeroderma pigmentosum, XP)
是一种隐性遗传性疾病,有些呈性联遗传。因核酸 内切酶异常造成DNA修复障碍所致。临床以光暴露部位色 素增加和角化及癌变为特征。 1. 幼年发病,常有家族发病史。 2. 面部等暴露部位出现红斑、褐色斑点及斑片,伴毛细 血管扩张,间有色素脱失斑和萎缩或疤痕。皮肤干燥。 数年内发生基底细胞癌、鳞癌及恶性黑素瘤。 3.皮肤和眼对日光敏感。 4.病情随年龄逐渐加重,多数患者于20岁前因恶性肿瘤 而死亡。 5.组织病理 晚期出现表皮非典型性增生、日光角化及鳞 癌和基底细胞癌等恶性肿瘤。
脆性X综合征 X染色体上(CGG)n重复序列的拷贝数增加。 在男性中的发病率为1/1000~1/1500,在所有男性 智力低下患者约10%~20~为本病所引起。
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肌强直性营养不良
19号染色体上编码肌强直性 蛋白激酶Dystrophia myotonica protein kinase(DMPK) 3’-UTR 区(CTG)n重复序列扩增导致 。
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常见的DNA损伤及其修复机制 DNA损伤因素 DNA损伤类型 修复机制 `
X射线、氧自由基、 烷化剂 自发脱碱基 紫外线和多环芳烃 单链断裂、无碱基位点、氧化性碱 基(如8-氧鸟嘌呤)脲嘧啶 环丁烷嘧啶二聚体等大的紫外线光 产物和稳定的多环芳烃化合物等大 分子DNA加合物 碱基切除修复
核苷酸切除修 复 双链断裂修复 (同源重组修 复和末端连接 ) 错配修复
抗癌药(如顺铂和丝 双链断裂和链间交联 裂霉素)
复制错误和烷化剂
碱基错配和缺失(插入)
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一、直接修复
直接修复是最简单的一种DNA损伤修复方式, 修复酶直接作用于受损的DNA,将之恢复为原来的 结构。 嘧啶二聚体的直接修复(光复活酶) 烷基化碱基的直接修复 (烷基转移酶) 无嘌呤位点的直接修复 (DNA嘌呤插入酶) 单链断裂的直接修复 (DNA连接酶)
识别新生链中非 m6A 的GATC序列 扫描新生链中错配碱基 酶切含错配碱基的DNA区段
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