第六章 微生物的分子进化 与分类学
6.1 rRNA序列分析与生物三域理论


1.rRNA分类原则与方法
（1）原核微生物：23SrRNA(2904bp) 16SrRNA(1542bp) 5SrRNA(120bp) （2）真核微生物：25SSrRNA 18SrRNA 5.8SrRNA 5SrRNA （3）rRNA特点：广泛性；遗传特性；保守性； 易提取测序。 （4）分类方法：酶切和测序
6.4 细菌的分类系统

1.伯杰氏分类系统（第九版） 2.原核生物分类系统
6.5真核分类系统概要

1.真菌的分类原则和依据 形态学位主、生理生化和生态学为辅的原则。 （1）丝状真菌的分类 根据：孢子产生的方式和孢子本身的特点。 A：形态形状 B:生理 C:生化 D:生态 （2）酵母的分类依据



2、生物三域理论


（1）原始五界系统 （2）三域系统：细菌域、古细菌域、真 核生物域（Wose 建立在rRNA的研究之 上）。 缺点:无非细胞形态生物
6.2 基因机构的进化

包括：启动子区域的进化、编码区的进 化、非编码区的进化、内含子的进化等
6.3 分类学与命名法则

1.分类单位：界、门、纲、目、科、属、种-真菌门：四个亚门 （1）鞭毛菌亚门（2）接合菌亚门（3） 子囊菌亚门（4）担子菌亚门（5）半知 菌亚门。

3.细菌经典分类方法： （1）个体细胞形态、大小、染色 （2）群体形态 （3）生理生化特点 （4）生态特点

4.细菌数值分类方法 （1）特征的地位等同，数理统计求相似 性。相似度≥80%属于同种。

5.分子分类法 （1）G+C百分含量 （2）核酸杂交 （3）16SrRNA
DNA同源性≥70%可定为同一个种。


(G+C)%≤10-12%,16SrRNA同源性≥95% 归为同一个属。

2.微生物的命名规则 林奈氏双命名法：属名+种名（拉丁） Bacillus stubtilis var.niger Saccharomyces cervisiae Hansen